C'est quoi ces histoires de boucles temporelles exactement ?

La boucle principale, on manque un peu de détails je pense, mais ce serait les First People (une future Fringe Team) qui envoient la machine dans le passé (quel but exactement, vraiment détruire un monde ?) et cause sans arrêt les mêmes évènements menant à la construction de la machine/destruction des mondes etc.

Peter tentant de tricher avec le temps (whatever happens happens) pour briser cette boucle. Mais est ce qu'il n'en créé pas une autre au passage ? etc etc

c'est l'explication "classique" donnée notamment dans retour vers le futur.  
Walter évoque l'absence de paradoxe (il me semble) très rapidement lorsqu'il en parle à son fils, mais j'ai pas compris son explication
 
j'espère qu'ils vont pas se la jouer comme dans matrix 3

La machine est renvoyé dans le passé par le trou de vers par le Walter du Futur pas pour détruire un univers, mais tout simplement parce que ça s'est déjà passé. Ça peut pas être changé:
“I can’t change what happens because it has already happened; but you can make a different choice within what happened. (…) We could cheat the rules of times”
 
Manque tjs l'explication de la construction (bah oui faut bien prendre du métal et le fondre en pièces de la machine à un moment, non?) et surtout l'invention de la machine. Les plan sortent d'où si Walter l'a pas inventée?

Rappelez-vous le fait que les jeunes futurs/ Observer; savaient déjà ce que Peter allait dire. Peut-on estimer que les Observer sont justement une organisation autonome qui a mis en place des Peter dans les dimensions alternatives jeunes, afin de faire bosser les Walter dans le bon sens ?
 

Et alors la machine, que fait-elle ? Elle peut détruire un monde ? Permet de voyager dans le temps ?

- Ils donneront clairement les "règles" du voyage dans le temps tel qu'ils le voient, comment ça fonctionne etc. Tout ça de façon à se tenir aux règles qu'ils ont fixées, que tout soit clair.
- Dans la S4, ils vont pouvoir en révéler plus sur les Observateurs, ce qui n'était pas possible avant ("une histoire prête à être racontée" ).
 
Dans l'ensemble, je suis à peu près d'accord avec ce qu'à dit Babouchka. Evidemment il nous manque des détails, notamment qui exactement a créé la machine, qui l'a envoyée (les First People ou Walter ?) et qui a créé tout le baratin autour des First People (le calendrier, les stations qui diffusent les chiffres... Peut-être Walter himself). On aura peut-être des aperçus du futur (le futur de l'épisode 3x22) pour voir tout ceci, mais à condition que ça soit pertinent et que ça permette d'expliquer ou de mettre en lumière quelque chose (toujours dixit les scénaristes).
 
Enfin, une interview (encore   ) datant de fin 2009, plutôt instructive malgré le titre :
http://www.seriefringe.com/jeff-pi [...] ot-de-plus
Où on voit pourquoi ils ont changé le format de la série au cours des saisons, et où on se rend compte qu'ils connaissent les grandes étapes de la série ainsi que la fin. Les deux questions, c'est :  
1) Que mettre entre ces grandes étapes (apparemment ils ont une saison d'avance à ce niveau, donc ils connaissent à peu près la S4 à l'heure actuelle)
2) Est-ce qu'on va les laisser aller jusqu'au bout...

Outil de création et de destruction, donc détruire un monde, ou réunir les deux. Elle doit permettre à Peter d'avoir une sorte de vision du futur (en déplaçant sa conscience dans le temps).  
En fait quand Walter a dit qu'on pourrait "tricher avec les règles du temps", ça m'a fait penser à la série de bouquins "Un livre dont vous êtes le héros". A la fin d'un paragraphe, on a plusieurs choix pour le paragraphe suivant. Mais on peut tricher, en allant voir ce qu'il y a dans un paragraphe, et si ça ne nous plaît pas, on fait comme si on n'y était pas allé. La machine permet à Peter de voir le futur tel qu'il sera s'il fait tel choix, et si ça ne lui plaît pas, il n'a qu'à faire un autre choix dans le présent. Donc pas de paradoxe.

Et finalement, après sa vision du futur, quel choix fait Peter ? Celui de disparaitre ? C'est lui la cause de la guerre entre les mondes finalement ?

Initialement il fait le choix de détruire l'univers rouge (on voit Brandonate dire que les failles s'amplifient). Après avoir vu le futur, il comprend que détruire l'autre univers est inutile car les deux sont liés, et qu'ainsi il détruit les deux mondes. Du coup, il change de choix et décide de réunir les deux mondes. La raison pour laquelle il a disparu est floue, c'est fait exprès, la saison 4 y répondra. Je ne peux que faire des suppositions. Peter est censé avoir "rempli son rôle", c'est-à-dire réunir les deux univers (ou alors briser la boucle temporelle, je ne sais pas).  
 
Peter ne fait pas le choix de disparaître, sa disparition doit être la conséquence de son choix de changer le futur (Walter dit à Peter, en 2026 : "les répercussions pourraient être terribles" ).
 
Peter n'est peut-être pas la cause de la guerre entre les mondes. La vraie cause de la guerre est que Walter est allé de l'autre côté, ce qui a amorcé une série de failles dans la réalité, qui conduisent à la destruction du monde parallèle. Et Peter n'est pas forcément la raison pour laquelle Walter a traversé (là Peter n'existe plus, mais Walter a peut-être traversé pour une autre raison tout aussi valable; après tout, Walter avait découvert le monde parallèle bien avant que Peter tombe malade).  
 
Difficile d'en dire plus, à mon avis la S4 éclaircira les choses  

depuis le premier épisode belly totalement incongru