Reprise du message précédent :

 
J'aime bien cette figure (à droite):
 
http://img74.imageshack.us/img74/1 [...] i308ph.jpg  
 
 
il semble y avoir une légère corrélation entre le résultat d'un essai clinique et l'origine des fonds de l'essai

Le graphique de droite fait un peu peur quand même...
 
Edit: Rhaaaaa!

 
Pour moi, c'est tout sauf une surprise et 15% de résultats positifs en moyenne pour une nouvelle molécule, ça me semble beaucoup plus crédible que 50%. Et le pire, c'est que dans une bonne partie des cas, les auteurs sont de bonne foi : je suis toujours effaré par l'incapacité de beaucoup de médecins/biologistes à utiliser les outils statistiques. Le summum ayant été atteint quand à un congrès auquel j'ai participé, où un des orateurs affirmait sans sourciller que sa molécule avait 100% d'efficacité car elle avait eu un effet ... dans un cas sur un    
 

Dans le dernier science:
 
Why is H5N1 avian influenza so virulent?
Genomic analysis of various isolates suggests
that, in addition to two known surface proteins,
a third previously unnoticed sequence in a
small viral protein may contribute to virulence.
 
http://www.sciencemag.org/cgi/cont [...] /5767/1562
 
et le papier:
 
http://www.sciencemag.org/cgi/repr [...] 7/1576.pdf

Dites petite question qui me titillait. Sur les puces à ADN, on a enlevé les introns de l'ADN (du moins le plus possible) ou pas ?
 
Et si pas, ca ne pose pas de problème quand les ARN viennent se lier ?

j'ai aussi une question, ce qu'on appelle "dip stick" (le support) dans les techniques de recherche de microorganismes type listeria par hybridation, c'est juste un bête support pour la sonde, ou c'est un support spécifique?  

 
Ca n'est pas de l'ADN génomique à proprement parler qui se trouve sur ces puces (en tout cas pas pour les puces qui regardent ce qui passe au niveau du transcriptome).  
Ce sont des sondes (synthétiques, 25nts) ADN complémentaires aux transcrits et qui, donc, ne ciblent que les exons.
 
(Pour la petite histoire, l'ARN total (enfin, que les ARN polyA+) est d'abord reverse-transcrit en cDNA puis biotinylé par transcription en cRNA. Ce sont ces cRNA qui hybridisent ( ) aux sondes)

Ouf !
 
J'ai cru qu'on allait laisser deux posts d'affilée sans réponses, merci Bank !    
 
Il reste plus que le post de cassebrik ! Vivement que ses étudiants arrêtent de faire grêve, elle pose des questions trop compliquées quand elle n'a rien à faire et qu'elle s'ennuie

C'est sûr que c'est ultra spécifique la question à cassebrik
 
Au pif, je dirais que c'est juste le support.
 
(au moins y aura une réponse et pis, de toute manière, on a jamais dit qu'on donnait nécessairement les bonnes réponses )

Bonjour.
 
 
Y'en a qui ont prévu d'aller à JOBIM (Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématique) à Bordeaux en juillet et à l'EBM (Evolutionary Biology Meeting) de Marseille en septembre ?
http://cbi.labri.fr/jobim2006/
http://www.up.univ-mrs.fr/evol-cgr/

c'est pas pour moi, c'est pour mes étudiants mais j'ai pas la réponse    

en fait le truc, c'est qu'on leur demande de proposer tout ce qu'il faut pour monter une manip, et je pense en effet que c'est le support, mais chez quel type de fournisseur peut on trouver cela?  

 
Chez neogen, ils ont le fameux GENE-TRAK®.    
 
 
 
http://www.google.com/search?clien [...] 8&oe=utf-8
 

tu veux dire une manip clé en main? pas sur qu'on ait les moyens  

je viens de rentrer d'une petite semaine a Tignes    
 
J'ai encore la tete dans les montagnes, je repondrai demain a tete reposee  

 
Oui, on synthetise un a un les oligo (avec un systeme de masque) et l'on hybride generalement l'ADNc (donc sans intron) mais ca peut varier.

Tu travailles comme un salop, t'es mal payé, >90% de tes manips ne mènent à rien et y a quasiment aucune perspective de "grader" à moins d'être très très bon.
 

 

Et pour faire ce job, vaut mieux faire normale (prévoire 4 ans d'école si tu veux passer l'agreg, puis 2 à 4 ans de post-doc) vu que de toutes façons ya pas de places.
 
Et prépare toi à être méprisé par les physiciens qui rôdent sur le net.

 
et à juste titre  
 
ah, et il y a un taux de suicide 40% plus élevé que la moyenne nationale du Japon  

Bonjour à tous,
 
Je découvre ce topic, et cela réveille en moi quelques souvenirs...
J'ai obtenu une maîtrise de biochimie en 96 puis à l'époque j'ai dû partir faire mon service militaire. Au retour, en 97, j'étais parti pour faire un DEA, et j'étais pris en stage à l'IGBMC d'Illkirch, un labo pas trop pourri donc. J'ai rencontré les chercheurs là bas et j'ai demandé au responsable des étudiants "quelles sont les chances d'avoir du boulot après ma thèse ?".
Vu le peu d'enthousiasme de mon interlocuteur, qui n'a pas cherché à me faire peur d'ailleurs, mais juste me dire la triste vérité, j'ai décidé de tout laisser tomber, et j'ai abandonné là la biochimie. Trop d'incertitudes, je voulais gagner ma vie ! Alors je suis devenu prof...
Bref, 10 ans après, je me demande encore si j'ai bien fait !! Que pouvez vous m'en dire, vous qui peut être avez à peu près mon âge, et qui êtes restés dans ce circuit ?  

Tu pourrais au moins faire l'effort de lire les trois derniers messages avant de poster une question

 
la recherche c'est top  

Ben je les ai lus, mais ça me paraît "rapide" comme réponse... Maintenant si vous ne voulez pas répondre, ben je ne repasserai plus par ici ...

 
La biologie, c'est souvent un domaine réservé aux passionnés et beaucoup (en France du moins) ont du faire des sacrifices financiers pour assouvir cette passion.    
Mais je pense que ce n'est pas spécifique à la biologie et que la recherche dans quelque domaine que ce soit est quuleque chose de passionant et d'exaltant.
 

 
Il y a pas deux labos où les conditions, tant matérielles que sociales, sont identiques. En ce qui me concerne, je ne suis ni dans un labo riche, ni dans un labo pauvre (par rapport aux standards français). Je peux faire sans problème 90% des manipes que je ferais si j'avais des moyens illimités. Mais je suis biochimiste et la biochimie est une branche relativement peu couteuse de la biologie. Un biologiste moléculaire ou cellulaire te tiendra très probablement un autre discours.
 

 
Je serais nettement plus riche si je faisais du conseil, mais c'est un choix de vie et je l'assume. C'est surtout les premières années qui sont délicates, après ça s'arrange. Cela dit, il y a toujours la possibilité d'aller à l'étranger : les chercheurs français à l'étranger sont de plus en plus nombreux.
 

 
J'ai justement fait le cursus prépa (PC), école d'ingé, puis rattrapage du cursus universitaire au niveau DEA. En étant sérieux, la remise à niveau en DEA est tout à fait faisable.  

C'est un milieu d'interactivite tres prenant, tu discutes bcp pour chercher des idees, resoudre des pbm techniques etc  
 

Perso, je me suis expatrie    (UK)
La France n'est pas au top ces temps-ci    
 

Il te faut un doctorat.  
 

Ecole d'inge c'est pas le chemin le plus "academique", si tu fais un prepa, tente plutot l'ENS  

Pour le moment, oui. Mais je ne suis pas un biologiste de labo....    

Je passe la journée devant l'ordi.

Pour l'instant ça va, je suis en thèse, et pas trop à me plaindre on va dire. Après, au niveau financement d'un groupe de recherche, c'est pas toujours la joie. Faut avoir un peu de chance. D'après ce que j'ai entendu, y'a des périodes (style une année) où tout foire comme pas permis, et d'autres périodes où tout marche au dela de tes espèrances.

Etudes universitaires de Biologie (équivalent à Bachelor + Master). Et après, une thèse est presque obligatoire pour aller plus loin (que ce soit dans l'académique ou l'industrie)

Bioinformatique et ce qui tourne autour. Si tu es bon en maths, tu devrais facilement pouvoir faire un cursus math et biologie. Ensuite tu auras surement des compétances pour bosser sur des analyses de puces à ADN ou trucs comme ça, ce qui est, à mon avis, la génétique actuelle.    

De rien. Pourquoi la génétique au fait ? Qu'est-ce qui t'attire là-dedans ?

D'ailleurs si cette semaine mes western blots continuent de me dessiner la Joconde au lieu d'une belle bande à la taille attendue, je pense que je vais faire monter les stats...

Si ça marche pas, tu peux toujours faire migrer tes protéines sous photoshop, c'est généralement 1min à 220V
 
 
 
 
 

J'avoue y avoir déjà pensé... Mais à ce niveau la c'est plus du simple bidouillage des contrastes, c'est de la peinture sur soie...    
 
Bon dieu que je hais Santa Cruz, je sens que je vais pas tarder à leur envoyer un coli piègé moi...

 
  T'es la 3ème personne que j'entends descendre cette boîte en moins d'une semaine...
 
Laisse-moi deviner, c'est un goat IgG?

 
Santa Cruz, perso j'ai eu que des mauvaises experiences, anti-corps de mayrde  

 
Ca dépend, si tu as besoin d'un témoin négatif, ils ont tout ce qu'il faut    

Exactement. J'essaye encore aujourd'hui de faire quelques incantations mystiques en espérant que ça marche et ensuite je les traîne en justice pour foutage de moral en l'air prohibé...

OK.
A lire tes centres d'intérêts, y'a plein de domaines et techniques qui pourrait t'intéresser:
 
- la génétique (étude des différences génétiques entre individus)
- la génomique et la protéomique (étude du génome, de son organisation, des protéines)
- la biologie cellulaire et moléculaire (étude de la cellule, mais pour moi, c'est plus un paquet de technique que l'on applique à un sujet d'étude, comme le cancer ou la réparation de l'ADN)
- la biologie du développement et de l'évolution (evo/devo)
- la biochimie (même remarque que pour la biol cell/mol)
- l'immunologie (relatif au système immunitaire)
- la microbiologie (englobe les virus, bactérie, champignons)
- la virologie (englobe que les virus)
- la bioinformatique (même chose que les domaines en haut, sauf que c'est 100% sur ordinateur )
- etc....
 
Mes définitions ne sont pas forcément exacts.
 
Le lien wiki: http://fr.wikipedia.org/wiki/G%C3%A9n%C3%A9tique

Au niveau du salaire pour un doctorant en Suisse, ça peut varier du simple au double, suivant que tu sois doctorant ou doctorant/assistant, ou dans le public ou le privé. Je dirais qu'une fourchette serait de 2'000 CHF à 4'000 CHF (soit 1'300€ de à 2'500€ ). Evidemment, ça parait beaucoup, mais après déduction des taxes/impots/loyer/assurances/prix de la vie, il ne reste plus grand. Mais y'a pas à se plaindre néanmoins.
 
Sache que tu peux aussi faire de la bonne recherche en étant dans l'industrie (genre pharma ou alimentaire).

Je ne connais pas bien le système français. Si tu veux faire de la génétique, regarde du coté de la Biologie moléculaire et cellulaire:
http://www.ens-lyon.fr/DSVT/BMC/bmc.html
http://www.licbio.ens.fr/cursus.php
http://www.ens-cachan.fr/pagesmast [...] index.html
 
Je ne sais pas si il y'a d'autres ENS que Paris et Lyon.

 
Y'a 3 ENS, Ulm, Cachan et Lyon.

 
C'est la meilleur voie (sinon la fac')  

J'ai donné les bons sites ?
Tu as fait l'ENS ?

 
J'ai roule ma bosse a celle de Lyon  

 
Salut, je plaisantais pour les suicides
 
J'ai écris des choses assez négatives mais je pense que, concernant les aspects les moins attrayants de la recherche, c'est bien de cela qu'il s'agit.
 
Charge de travail: si tu veux arriver à qqch (ce qqch a un nom: publier ton travail dans un journal. C'est la carotte ultime du chercheur: sans publications (dans de bons journaux), tu n'as aucune chance de poursuivre ta carrière au-delà d'un post-doc ou deux), y a pas de miracle: il faut beaucoup travailler. Les chercheurs brillants sont ceux qui bossent beaucoup et surtout d'une manière efficace. Il y a aussi une bonne part de chance, c'est-à-dire tomber au bon moment, dans le bon labo avec un projet prometteur et concrétisable. (Généralement ça implique le sacrifice du doctorant précédent qui s'est cassé les dents sur le sujet pendant 4 ans   )
 
Salaire: tu peux en vivre. Par contre, j'imagine mal comment gérer une famille en thèse, au niveau pécunier et surtout temporel (à moins d'être en physique   ). Faut faire ça plus tard.
 
Débouchés: la grosse inconnue. Sur ma volée de licence (60 personnes), je pense qu'il y a qu'une seule personne dont on est sûr qu'elle va devenir prof à l'uni (et c'est pas moi ). Ca se voyait dès la première année de licence. Pour le reste, une bonne moitié est complètement sortie de la voie de la recherche après le diplôme (dea?) (devenus prof (lycée, collège, maternelle) ou ont suivis d'autre voies qui n'ont rien à voir). Sur l'autre moitié qui a fait une thèse, je pense que la moitié va arrêter après. Qu'est-ce qu'ils vont faire après? Personne ne sait vraiment. A priori, soit elles partent dans l'industrie (et ne touchent plus vraiment de près la recherche à proprement parler) soit elles divergent dans un métier qui a rien à voir mais qui peut apprécier ce que tu as appris pendant ta thèse (gérer un projet, se gérer soi-même, interactions avec les autres chercheurs, débrouillardise globale).
Il reste donc 15 personnes, qui vont faire un post-doctorat. Cela implique quasi systématiquement de partir à l'étranger (dans la mesure où c'est très bien vu sur ton c.v.). Et après... je sais pas. (edit: mais je pense pas qu'il y en aura plus de 2 ou 3 qui pourront monter leur propre labo).
 
 

 
  de plus tu as l'impression (concrète) de poser une pierre (unique) à un édifice (pour faire dans le lyrisme )
 

 
Non, en aucun cas.
 
Wala, je prétends pas que c'est la vérité absolue mais c'est ce que je, et la plupart de mes co-thésards, pense.