[topik unique] Génétique, biologie moléculaire et structurale.

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Auteur	Sujet : [topik unique] Génétique, biologie moléculaire et structurale.

bank

grin and bear

Reprise du message précédent :
Y en a parmi vous qui font du siRNA? Je suis sur le point d'en commander, pour l'instant je me fais un petit mix entre les recommendations du site du Whitehead institute, de http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez [...] uery_hl=29 , saupoudré d'un petit coup de MWG et avec une double-crème siDirect Japan. Et pour parfaire le tout, je compte peut-être regarder du côté des structures secondaires de mes mRNA

Bon, je sais, je devrais juste en commander 3 et tester mais bon...

Z'avez d'l'expérience là d'dans?

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RykM

t'as de beaux gènes, tu sais..

bank a écrit :

Y en a parmi vous qui font du siRNA? Je suis sur le point d'en commander, pour l'instant je me fais un petit mix entre les recommendations du site du Whitehead institute, de http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez [...] uery_hl=29 , saupoudré d'un petit coup de MWG et avec une double-crème siDirect Japan. Et pour parfaire le tout, je compte peut-être regarder du côté des structures secondaires de mes mRNA

Bon, je sais, je devrais juste en commander 3 et tester mais bon...

Z'avez d'l'expérience là d'dans?

Perso j'en ai pas besoin (C.elegans powa [:huit] ) mais je sais que des compagnies te les design et garantissent le resultat.

Je vais essayer de retrouver le nom...

bank

grin and bear

RykM a écrit :

Perso j'en ai pas besoin (C.elegans powa [:huit] ) mais je sais que des compagnies te les design et garantissent le resultat.

Je vais essayer de retrouver le nom...

Nan t'embête pas, j'avais aussi vu ces compagnies. Mais ça coûte trop cher (qqch comme 200$ voire plus par design) et de toute manière ça marche quand même bien la plupart du temps. Je vais juste en tester 3 et on verra bien. De toute manière, il vaut mieux tester toujours un certain nombre pour déterminer si le phénotype que tu observes est pas sirna spécifique.

Danke

RykM

t'as de beaux gènes, tu sais..

bank a écrit :

OK :hello:

Cardelitre

ಠ_ಠ ۞_۟۞ ┌( ಠ_ಠ)┘ סּ_סּ

bank a écrit :

Moi j'en avais fait un peu, mais je les avais designé moi-même selon certaines recommandations... Ensuite ça dépend du moyen que tu veux utiliser: transfection directe des siRNAs, vecteur d'expression transitoire, expression stable dans une lignée... Pour ces deux derniers le système basé sur le vecteur pSuper est bien rodé, va jeter un coup d'oeil...

http://www.oligoengine.com/Home/mid_prodPSUPER.html

bank

grin and bear

Cardelitre a écrit :

Merci

En fait, je vais utiliser le système inductible de Trono (à base de lenti donc).

http://tronolab.com/tet_krab.php

NHam

Stop, look and listen.

Désolé, je participe pas beaucoup ses derniers temps , mais je suis un peu pris par mon démanagement, et après j'aurais pas forcément le net avant un moment. [:spamafote]
Donc je lurkerais sur le topic jusqu'à septembre. [:ddr555]

---------------
La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.

Cardelitre

ಠ_ಠ ۞_۟۞ ┌( ಠ_ಠ)┘ סּ_סּ

bank a écrit :

Merci

En fait, je vais utiliser le système inductible de Trono (à base de lenti donc).

http://tronolab.com/tet_krab.php

Très bon choix. :jap:
Ils ont déjà largement fait leur preuves...

RykM

t'as de beaux gènes, tu sais..

Gros papier dans Cell aujourd'hui, co-auteurs Steve Elledge et DePinho (2 gros pontes) qui nous offrent un joli screen à base de RNAi. En gros de la "forward genetic" sur des cellules humaines [:huit] pour aller à la pêche aux tumor suppressor genes. [:dao]

abstract

Message édité par RykM le 17-06-2005 à 16:43:57

RykM

t'as de beaux gènes, tu sais..

Ralala, pas cons les mecs, ils ont une banque de shRNA (à peu près 9000 ORF) associés à une séquence unique de 60nt qui leur sert de code-barre; hybridation sur puce après un tour de PCR et le tour est joué [:huit]

Respect [:dao]

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bank

grin and bear

Chaud, chaud, chaud :bounce:

Citation :

Stem cell division is regulated by the microRNA pathway

One of the key characteristics of stem cells is their capacity to divide for long periods of time in an environment where most of the cells are quiescent. Therefore, a critical question in stem cell biology is how stem cells escape cell division stop signals. Here, we report the necessity of the microRNA (miRNA) pathway1, 2, 3, 4 for proper control of germline stem cell (GSC) division in Drosophila melanogaster. Analysis of GSCs mutant for dicer-1 (dcr-1), the double-stranded RNaseIII essential for miRNA biogenesis, revealed a marked reduction in the rate of germline cyst production. These dcr-1 mutant GSCs exhibit normal identity but are defective in cell cycle control. On the basis of cell cycle markers and genetic interactions, we conclude that dcr-1 mutant GSCs are delayed in the G1 to S transition, which is dependent on the cyclin-dependent kinase inhibitor Dacapo, suggesting that miRNAs are required for stem cells to bypass the normal G1/S checkpoint. Hence, the miRNA pathway might be part of a mechanism that makes stem cells insensitive to environmental signals that normally stop the cell cycle at the G1/S transition.

http://www.nature.com/nature/journ [...] 03816.html

Message édité par bank le 20-06-2005 à 11:18:51

RykM

t'as de beaux gènes, tu sais..

bank a écrit :

Chaud, chaud, chaud :bounce:

Pas mal, en effet [:dao]

M'enfin on est au tout début de la compréhension de Dicer et ses amis, ça m'étonnerait pas que d'autres fonctions "basales" soient démontrées d'ici peu [:huit]

Message édité par RykM le 21-06-2005 à 02:09:08

Rasthor

[:drapo]

RykM

t'as de beaux gènes, tu sais..

Rasthor a écrit :

[:drapo]

Bienvenu Rasthor :hello:

Rasthor

RykM a écrit :

Bienvenu Rasthor :hello:

Merci. Ca a l'air sympa ce topic, je découvre. Y'a de l'avenir dans la biologie ?

RykM

t'as de beaux gènes, tu sais..

Rasthor a écrit :

Merci. Ca a l'air sympa ce topic, je découvre. Y'a de l'avenir dans la biologie ?

Ouais, et les biologistes, ça plaît aux meuf :sol:

Rasthor

RykM a écrit :

Ouais, et les biologistes, ça plaît aux meuf :sol:

Cool ! Je vais m'inscrire à la fac dans ce cas !

Mais c'est pas trop dur comme études ?

Rasthor

A part ça, y'a quoi comme livre que tout bon biologiste (orienté génétique et moléculaire) se doit d'avoir lu au moins une fois dans sa vie ?

Profil supprimé

Campbell pour la base

RykM

t'as de beaux gènes, tu sais..

Le Campbell est plutôt 1er cycle, c-a-d très large, intéressant mais dépassé dès la Licence.
Tu prends Biologie Moléculaire de la Cellule de DeBoeck université, c'est très bien.

Profil supprimé

Bah après tu prends toute la collection DeBoeck comme ça t'es tranquille pour toute la bio mol/génétique et ses à-côtés : embryo, éco...

Rasthor

Merci pour vos conseils, mais je pensais à d'autres livres, moins scolaire, comme un livre de Gould ou autre.

Profil supprimé

Des bouquins de vulgarisation en bio mol / génétique pure, euh... [:mlc]
Encore en embryo, Maynard-Smith... en génétique des pops, Dawkins... en évodévo, Gould ou Chaline...

RykM

t'as de beaux gènes, tu sais..

Sir Eccles pour la neuro-physio, "ni dieu ni gène" de Kupiec pour une réflexion sur l'hérédité (avec qq notions philosophiques...)

Sinon "Nature" et "Science" chaque semaine [:dao]

thermocline

Geek intelligent

http://www.amazon.com/exec/obidos/ [...] s&n=507846

http://www.amazon.com/exec/obidos/ [...] s&n=507846

---------------
Les bureaucrates: "S'ils tombaient d'un immeuble, il leur faudrait une semaine pour s'ecraser." "All I ever wanted All I ever needed Is here in my arms Words are very unnecessary They can only do harm Enjoy the silence"

Rasthor

thermocline a écrit :

http://www.amazon.com/exec/obidos/ [...] s&n=507846

J'ai deja l'edition Three de ce livre.

thermocline

Geek intelligent

Rasthor a écrit :

J'ai deja l'edition Three de ce livre.

Three, ce doit etre l'epoque des dinosaures

Completement oublie cuila:
http://www.amazon.com/exec/obidos/ [...] 8&v=glance

bank

grin and bear

thermocline a écrit :

Three, ce doit etre l'epoque des dinosaures

Completement oublie cuila:
http://www.amazon.com/exec/obidos/ [...] 8&v=glance

La base

Petite pensée pour un pote qui va passer un oral de thèse (en plus de l'oral de présentation de la thèse même). Le sujet c'est:

1600 pages à réviser [:sweet purple]

Rasthor

bank a écrit :

La base

Petite pensée pour un pote qui va passer un oral de thèse (en plus de l'oral de présentation de la thèse même). Le sujet c'est:

http://images.amazon.com/images/P/ [...] ZZZZZ_.jpg

1600 pages à réviser [:sweet purple]

Oh merde... :sweat:
C'est dans quelle uni / domaine ?

Rasthor

thermocline a écrit :

Three, ce doit etre l'epoque des dinosaures

Je ne suis pas jeune non plus.

RykM

t'as de beaux gènes, tu sais..

bank a écrit :

T'y passeras un jour, toi aussi [:rhetorie du chaos]

bank

grin and bear

Rasthor a écrit :

Oh merde... :sweat:
C'est dans quelle uni / domaine ?

à Genf en biolo
Toi t'es où exactement? Lausanne?

RykM a écrit :

T'y passeras un jour, toi aussi [:rhetorie du chaos]

Heureusement non

En fait, c'est le traitement infligé pour les thésards qui ont vendu leur âme au diable: ceux qui sont dans le privé

Moi j'ai des cours à choix pendant les 2 premières années (bien plus utile comme mêthode quand même)

Message édité par bank le 26-06-2005 à 22:15:36

RykM

t'as de beaux gènes, tu sais..

bank a écrit :

à Genf en biolo
Toi t'es où exactement? Lausanne?

Heureusement non

En fait, c'est le traitement infligé pour les thésards qui ont vendu leur âme au diable: ceux qui sont dans le privé ;)

Moi j'ai des cours à choix pendant les 2 premières années (bien plus utile comme mêthode quand même)

J'aime bien le concept, on peut leur jeter des cailloux à la fin de la soutenance [:dao]

Rasthor

bank a écrit :

à Genf en biolo
Toi t'es où exactement? Lausanne?

J'étais à Lausanne. [:aloy]

NHam

Stop, look and listen.

Rasthor a écrit :

[:drapo] forcement...

Posté le 20-11-2004 à 19:31:50

Rasthor a écrit :

[:drapo]

Rasthor a écrit :

Merci. Ca a l'air sympa ce topic, je découvre. Y'a de l'avenir dans la biologie ?

[:urd]
Tu t'es fais lobotomisé entre temps? [:dracula]

---------------
La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.

Profil supprimé

Nan mais attends là, le potentiel d'action il a pris son temps, c'est tout, y a pas mort d'homme, et puis il est Suisse...

lebidibule

Rasthor a écrit :

A part ça, y'a quoi comme livre que tout bon biologiste (orienté génétique et moléculaire) se doit d'avoir lu au moins une fois dans sa vie ?

J'ai souvenir d'un petit bouquin très interessant : collection Science, Olivier Chassande.
Biologie moleculaire et cellulaire.
C'est tout un tas d'exercices pour comprendre les notions de bases du genre ampification par PCR ,cartes de restrictions, stratégies de clonages, plasmides, transfection, exons/introns...
Très concret.

Le CAMPBELL est un excellent livre de chevet.
Sans doute ne va t'il pas assez loin, mais est ce son role ?
Il permet d'acquerir de bonnes bases puis éventuellement de creuser les themes qui nous interessent.

J'adore en tout cas en lire quelques pages de temps en temps...

big e

Comment s'appellent encore les petits bouquins rouges très sympas, relativement complets..?

Svenn

big e a écrit :

Comment s'appellent encore les petits bouquins rouges très sympas, relativement complets..?

Tu parles du petit livre rouge de Mao ? Y a pas beaucoup de biologie dedans quand même

NHam

Stop, look and listen.

Svenn a écrit :

Tu parles du petit livre rouge de Mao ? Y a pas beaucoup de biologie dedans quand même

J'osais pas la faire celle-là. :jap:

---------------
La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.

Svenn

NHam a écrit :

J'osais pas la faire celle-là. :jap:

Je me suis dévoué

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