Reprise du message précédent :

 
Non non, la phosphorylation se fait apres, une charge negative locale comme le phosphate peut inhiber une activite enzymatique (kinase etc), former une nouveau domaine de reconnaissance pour le recrutement d'une autre prot', ou au contraire empecher une interaction.
Les phospho c'est vaste    

Euh, je vois pas en quoi l'arsenic est surprenant... C'est comme des bêtes qui utilisent du cuivre à la place du fer dans leur hème, c'est pittoresque mais bon voilà quoi.
Encore tu m'aurais dit "plutonium au lieu de phosphore", là ok, d'une faut aller le trouver ton plutonium et de deux bonjour les dégats radiogéniques pour la machinerie cellulaire...

Oui mais seulement dans l'heme non ? Ici la substitution serait appliquée partout on dirait.

Ben tout de même, on ne parle pas de changer juste un atome dans un des très nombreux machins quelconques comme l'hémoglobine, mais de changer carrément la composition chimique de l'ADN et de la source d'énergie des cellules, c'est tout de même autre chose que ton machin au cuivre là.
 
Par contre, visiblement c'était "prévisible", vu que ça a été volontairement recherché. Y'a t'il d'autres substitutions "prévisibles" de ce style pour remplacer un autre des éléments C, H, N, O, P, S ?  
 
On parle souvent du Si pour remplacer le C mais ça semble très peu crédible pour des raisons d'énergie de liaison. Quid des autres ? Se à la place de S par exemple (dans certains acides aminés par ex), c'est possible ou pas ?  

 
Ca n'a rien a voir    
 
Le cuivre et le fer sont juste des accepteurs passifs a electrons, ici l'arsenic a remplace le phosphate dans la molecule d'ADN.

 
Je sais que des labo (un ancien collegue fait son post-doc la-dessus) essayent de synthetiser des amino acid completement artificiel afin de les incorporer dans les prot' mais rien de bien exotique, toujours du CHNOP  

Ca s'est déja vu des sélénocystéine naturelles (code U) (je sais plus chez qui)

 
Ben oui et donc ? si les propriétés de chaque élément sont à peu près les mêmes, c'est plutôt assez "logique" que ça puisse à l'occasion (bon, ok, tous les 3 milliards d'années quoi) être interchangeable... peu importe dans quelle molécule...

est ce que le fer est commun à toutes les formes de vie ?

Ben non, pas plus que le phosphore
Mais bon, je vois pas le rapport avec la choucroute

Sauf que la, c'est la première fois qu'ils voient ca avec un changement dans l'ADN. D'où l'importance du truc.

Ben l'ADN c'est juste une molécule "comme une autre", y a rien de magique... je vois pas pourquoi on pourrait pas remplacer le phosphore par du gloubiboulguium ayant les mêmes propriétés que P

 
Ben tout de même, si l'arsenic est toxique pour nous (notamment à l'état de pudding), c'est justement parce qu'il n'est pas fonctionnellement interchangeable mais qu'il s'interchange quand-même de temps en temps du fait des similarités, et que ça fout le bordel.  
 
Et puis quand-même, modifier la formule de l'ADN et de l'ATP et que ça marche malgré tout, moi ça m'épate

Ben on peut. Mais on vient seulement d'en avoir la preuve maintenant.

Bah après ce qui pourra être intéressant c'est de voir comme se déroule cette transition d'un point de vu moléculaire car en dehors de cette bactos si tu feed en arsenic bah mis à part crever ça fait pas grand chose Ce qui voudrait dire que la bactos du lac Mono possède ce qu'il faut pour l'incorporation de l'arsenate au lieu du phosphate.

Et j'ai également une petite question y'a déjà eu des campagnes de mutagénèse aléatoire sur une bactos foin pour la faire survivre à un milieu riche en Arsenic? J'ai cherché un peu mais bon pas trouvé grand chose... Car étant donné que le phosphate et l'arsenate sont proches on peut pas imaginé une mutation acquise par la bactos? Façon opéron qui se remet en route lorsqu'il y a trop d'Arsenic dans le milieu? Parce que bon on m'aurait dit "ouais on a trouvé une bactos qui utilise l'arsenate à la place du phosphate" j'aurai dit "ok cool c'est énorme!" Mais là trouver une bactos qui switch (qu'en labo d'ailleurs vu qu'IRL la bactos utilise du P) j'ai un poil plus de mal à imaginer qu'elle est conservée ce mécanisme de switch. Autant pour un pathway alternatif je veux bien mais jusqu'à dans la structure de l'ADN

Le mieux sera d'avoir le genome de cette bacterie arsenic-compatible et de sa plus proche voisine qui ne fonctionne qu'au phosphore.
Ce sera surement fait dans les prochains mois.

ca va foutre en l'air les séquenceurs ouais

Ah oui, j'avais pas pensé à ce problème.

Bah le mieux resteur à faire de la spectro non? J'ai pas lu l'article vu que j'ai plus accès mais en lisant à droit à gauche y'a pas mal de septiques qui disent que dans la publi, il manque justement une "bête" extraction de l'adn + spectro pour montrer qu'il y a bien de l'Arsenate dans le squelette de l'ADN de cette bactos. Mais bon n'ayant pas accès j'ai pas pu vérifier par moi même

Bah je vois pas pourquoi : tu mets la bacto en mode full-phosphore avant de passer son ADN au séquenceur et roulez, non ?

ben il me semble que dans ce cas là ce n'est plus la même bactérie...
 
cf. http://scienceblogs.com/pharyngula [...] d_life.php
 

Bah ça pourrait être intéressant non pas de séquence car avec la séquence on fera quoi? De la prédiction de gène qu'on ne connait pas?
 
Mais plutôt faire un transcriptome de la bactos en milieu phosphore et en milieu arsenic.
 
Pour les gènes qu'on connait pas, je sais pas s'il y a des nouvelles techniques mais bon on peut toujours prendre de l'arsenic / arsenate et faire de l'affinité avec pour chopper les prot qui les utilisent et séquencer les prot pour avoir les gènes non? A moins qu'on connaisse déjà des prot capable de tripatouiller l'arsenic/l'arsenate?

On pourrait deja comparer les genes qui sont differents par rapport aux bacteries qui ne marchent pas en Arsenic.

 
Ouais vu le "faible" nombre de gènes ça reste envisageable, c'est vrai  
J'ai tendance à avoir le réflexe de passer directement par de la génétique fonctionnelle plutôt que du séquençage, vu qu'à l'époque où je "cherchais" ma bestiole était po séquençable

Au fait Aragorn tu fais quoi maintenant ?

 
Plus de vraiment de "science" Je suis Ingé conseil en microbio

Y'en a parmi vous qui ont lu le papier  
 
These data also indicated
evidence for the presence of arsenate in small molecular
weight metabolites (e.g., arsenylated analogs of NADH, ATP,
glucose, acetyl-CoA) as well as arsenylated proteins where
arsenate would substitute for phosphate at serine, tyrosine and
threonine residues (1, 11) (table S3).
 
 
La vache  

Good science or bad science?
 
J'y croyais a ce papier... j'ai envie d'y croire, mais tout le monde n'est pas dans ce cas la apparament
 
http://rrresearch.blogspot.com/201 [...] nasas.html
 
L'auteur de ce blog marque quelques points quand-meme...
Faudrait voir la reponse des auteurs

Ah oui, en effet  

Putain moi aussi je veux un science alors

Passe ta thèse d'abords.

 
Thanks for the link
 
(j'adore les commentaires, ça se taquine gentiment )
 

Y'a pas plus "someone is wrong on internet" qu'un putain de scientifique.

"someone is wrong on THE internet"

et ?

T'as pas compris, faut t'expliquer ?

oui  

incoming blinkage

Quand il s'agit de sa propre vanne, expliquer n'est blinker