Reprise du message précédent :
Envoie l'article et je te dis ca dans la seconde. Enfin c'est pas compliqué un flavo.

L'article ??  
C'est beaucoup d'articles tous les numéros depuis qu'ils sont sortis ...
 
- Ageing mechanisms .
- Experimental gerontology .
- Ageing Research Reviews

Le monsieur te parlait pas à toi
La mention des flavos aurait pu et même du te mettre la puce à l'oreille...

tu scriptes la récupération des trucs à coup de Perl ou de bash

de toute façon, ça te servira bien un jour ou l'autre de connaitre ça

t'as pas du comprendre l'idée de la requête  

 
Fin de journée , fatigue toussa .... J'ai lu la phrase a moitié ...
 

 
Errr , je m'y connais autant en info qu'en perroquets péruviens .
C'est des langages rapides a apprendre ?
 

 
Je suis pas le seul a m'être fait avoir on dirait

Avais pris au pied de la lettre.  
La mailing list ne tourne plus? Faudra actualiser pour moi, je consulte plus l'adresse de Freiburg.

Y'a quoi comme blog bio / bioinfo sympa a suivre ?

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oui merci   j'ai effacé le message

Je dois utiliser R

Je compatis.

j'ai essayé de négocier pour passer à Perl + GNUPlot mais ils veulent pas    
Matlab non plus parce que c'est pas open source

use Statistics::R

Non, mais R c'est tres bien.
C'est juste penible quand tu dois tres des donnees complexes. Mais on s'y fait.

R c'est imbitable.

C'est gratuit, puissant, scriptable, modulable et ça tourne sous unix.
 
Trouve un autre logiciel de stat qui fait mieux que ça.

la gueule de la syntaxe

Nan mais au bout d'un moment faut arrêter quoi, "de facto standard" mon cul, la communauté représente 1% des scientifiques du monde entier, ils ont le culot de prétendre être assez significatifs pour définir des standards...

T'as autre chose de mieux a proposer, selon les criteres que j'ai dit plus haut ? Si oui, je suis preneur.  

Ces critères ne sont pas judicieux je trouve. Je pense que Matlab est la bonne solution pour ce genre de tâches, parce que pour le coup c'est une plate-forme vraiment standard utilisée par une grande portion des scientifiques quand il s'agit de ne pas trop faire de l'informatique. Et à mon sens c'est le critère le plus important. Le coût, faut pas déconner, pour le prix de douze licences tu t'achètes 200 µL de primer. la puissance, lol, comme si l'environnement de développement était le critère important pour un programme performant. Pourquoi pas du fortran pendant qu'on y est ?
 
Scriptable et modulable, ouais, Matlab aussi c'est bon.
 
Enfin je sais bien que je ne convaincrai personne hein, de toutes façons même si c'est une communauté insignifiante c'est une communauté, et du coup ils ont leurs habitudes et ils en changeront pas si tout ce qu'ils ont à gagner c'est une meilleure intégration dans la communauté scientifique.

J'avoue, Matlab est aussi un choix pertinant.

Je suis d'accord avec Hephaestos.
 
Quitte à 'programmer' dans un langage à la con, je préfère Matlab à R.

+1  
 
 mais c'est pas gratuit et tout le monde ne peux pas se permettre Matlab. SciLab est aussi une alternative

Salut les biomous

Dites, quelqu'un pourrait m'expliquer par quel genre de mécanisme on peut arriver à une bestiole comme la bactérie qui buzze en ce moment là, et qui utilise de l'arsenic à la place du phosphore, tant pour l'ADN que pour l'ATP ?

Un système hybride phosphore-arsenic (genre dans la molécule d'ADN un coup du phosphore, un coup de l'arsenic lol, et dans les mythos qu'on dit à la fois de l'ATP et de l'ATAr), c'est viable ou ça implique une substitution complète en un seul coup ?

euh. Je suis pas sûr qu'on puisse dire que cette forme de vie découle d'une vie préalable basée sur le P, si ? Il y a peut être toute une chaine basée sur l'As. Et si ça s'est fait à partir du P, c'était peut être sur des formes de vie bien plus anciennes (simples) que cette bactérie

Ben non puisque son code génétique la situe très près d'une autre espèce de bactérie n'ayant pas cette capacité. On sait très bien la situer sur l'arbre des bactéries.

Par contre, entre temps, j'ai lu la réponse à une de mes questions : ça marcherait en "hybride", cette bactérie là pourrait aussi bien utiliser du P que du As, et elle alterne suivant les conditions à la disponibilité de chacun des éléments. Actuellement, ils essayent de trouver dans le même environnement, une bactérie qui n'aurait pas la capacité d'utiliser P ou As, mais n'utiliserait QUE As (et pour elle, c'est donc le P qui serait toxique).

Ca me semble assez dingue quand-même.

à quand une bactos avec du Si ? on pourra faire des semi conducteurs bio

il y a déjà pas mal de microorganismes qui produisent du Si (enfin, du SiO2)

 
Oui c'est une decouverte qui troue carrement le c*l.  
 
La NASA essaye de la faire briller pour justifier ses vols vers Mars etc mais d'un point de vue "vieille biologie a la papa" c'est juste enorme.
On savait les bacteries incroyablement versatiles concernant leur capacite a metaboliser et tirer de l'energie de tout et n'importe quoi, mais dans le cas present on est face a autre chose.
J'ai pas lu le papier mais d'apres l'abstract, on retrouve de l'arsenic dans l'ADN et les prot' !! C'est du delire  

C'etait le vieux film Projet Andromede.

ATAs tu veux dire ?

Oui non mais dans son ADN et tout et tout    
(sur wiki toutes les pages sur l'arsenic ou le lac mono ont déjà été éditées )

 
Dans l'ADN et dans l'ATP encore ouais, mais dans les prot ??? Ca veut donc dire donc qu'elle utilise d'autres acides-aminés, d'autres ARN-t  
Et ça n'affecte pas du tout le repliement des protéines cette substitution ?

Non, mais les acides amines restent les memes.

Seulement, une proteine, c'est n'est pas que des acides amines. Il y aussi les PTM:

http://en.wikipedia.org/wiki/Postt [...] dification
Posttranslational modification (PTM) is the chemical modification of a protein after its translation. It is one of the later steps in protein biosynthesis for many proteins.

Et donc, au lieu d'avoir des protein phosphorylees, on a des proteines arsenylees. Et comme c'est des modifs qui sont souvent sur des acides amines exterieurs, ca n'affecte pas le repliement.

 
Il s'agit de phosphorylations, souvent impliquees dans le signalling ou changement de conformation des prot'  

Qui affectent le repliement ???

sur France inter dans la Tête au carré, débat intéressant. Podcast possible

oui, on dirait que la brigade du fake est deja sur l'affaire

 
Non non, la phosphorylation se fait apres, une charge negative locale comme le phosphate peut inhiber une activite enzymatique (kinase etc), former une nouveau domaine de reconnaissance pour le recrutement d'une autre prot', ou au contraire empecher une interaction.
Les phospho c'est vaste