Reprise du message précédent :
Personne ici n'a utilisé ce système?

non désolé

Poste officiellement accepte a Geneve    
 
Attention les Suisses, va y avoir une invasion de C. elegans  

Félicitations

 
Tu commences quand ?

 
Entre Mars et Juin.

Précis

Dites, si vous aviez des infos sur comment un phage helper excise un autre phage, ce serait [g]vraiment[/i] le bienvenu. j'ai passé l'après midi a essayé de boucler ce putain de truc, je me perd plus qu'autre chose

Alors, je crois, après avoir passé mon samedi la dessus, avoir compris le pourquoi du comment (enfin du moins, en gros )

Déjà, la publication du premier système zap/bluescript est accessible gratuitement ici

Alors, dans les grandes lignes... On a un phage (zap) modifié, dans lequel on a intégré un plasmide pBluescript présentant un gène de résistance à l'ampiciline, un MCS avec 6 sites de clonage unique, une ori de puc.

Le truc qui n'était absolument pas clair, c'est que cette séquence plasmidique a été insérée de façon particulière dans zap. En amont, on trouve la séquence initiatrice d'ori F1, et en aval, la séquence terminatrice de d'ori F1.

Dans un premier temps, on insère l'ADNC dans le MCS. Puis on infecte nos bactéries, et on fait une sélection blanc/bleue des plages de lyse.

On extrait les phages encapsidés qui nous intéressent, et on les co-transfecte avec un phage helper  F1 dans une souche bactérienne adaptée.

Ce phage helper a une particularité : il est muté de façon à  empêcher la réplication de son génome dans la cellule hôte, mais il a toujours la possibilité de reconnaitre une F1 ori. Il possède également de quoi encapsider les ADN potentiellement synthétisés.

Du coup, les séquence d'initiation et de terminaison d'ori F1 vont permettre, du fait de leur positionnement, de répliquer le pBluescript entier et son insert. Il sera ensuite encapsidé (grâces aux protéines traduites depuis le gène II du phage helper), et excrété.

Il ne reste "plus" qu'à le "purifier", infecter une nouvelle souche bactérienne adaptée, et, grâce à l'origine de réplication puc qu'il contient, il se comportera comme un banal plasmide.

Ouf

Maintenant, quelques questions restent en suspend. Comment fait le phage lambda zap 2 pour se multiplier? Il n'est mention nulle part de son origine de réplication. et surtout... POURQUOI CES PUTAIN DE "SOUS UNITÉS" DE F1 ori N'APPARAISSENT PAS SUR LA CARTE DU PHAGE LABDA ZAP 2??

A votre avis, je suis dans le vrai, maintenant?

Ca me rapelle la facon dont je génère mes bacmides en transformant des bactéries équipées d'un helper... Par contre je connais pas les détails technique du mécanisme de transfert, désolé...

Quelqu'un à accès au journal "Applied Biochemistry and Biotechnology" ?

Et plus particulièrement cette pub :

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed [...] d_RVDocSum

Merci!

L'est vide ton lien  

 
Pubmed me pète une erreur quand je veux retourner sur la pub... Et il pante aussi sur n'importe quelle query...
 

 
Poly-beta-hydroxybutyrate Production by Fast-Growing Rhizobia Cultivated in Sludge and in Industrial Wastewater.
 
16 sept 2008

Arf, j'ai pas    
 
Desole

Merci quand même
 
Le lien a l'air de refonctionner, si quelqu'un a accès ça m'aiderait

le bon lien: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18795238
 
 par contre je trouve pas le full text

J'ai !
 
Envoye ton mail par mp.

Ici:
http://www.springerlink.com/content/8173410q0135k115/

je l'ai uppé: http://www.zshare.net/download/52555650d78e0f7b/

Pas sur que ça soit légal de faire comme ça.

même en suisse?

 
Ah les Suisses    
 
Des vrais labos avec des vrais moyens    
 
Plus que qq mois  

Tu parles, j'ai plein de journaux de pharma que je n'ai pas.

 
Merci beaucoup

Je l'ai, mais j'ai été un peu lent!

Se faire doubler par un suisse, c'est le comble    

En fait, j'avais vu le message hier soir.. Mais en rentrant du stade (je bosse à l'OL hein! pas supporter!), les orteils à 2 doigts de l'angelure et de l'ablation, le ventre vide, j'ai préféré vaquer égoïstement à des occupation plus centrées sur ma petite personne, comme manger, ou prendre une douche...  

Pour ceux et ceuses qui connaissent bien le domaine des labos internationaux... Selon vous, dans quelle institut, voire quelle équipe, aux US il serait très enrichissant de travailler, dans le domaine de la cancéro (techniques de pointe tout ça tout ça...)?
 
Ma question est vague? Sans déconner?

Tu as déjà un partenariat avec les US ou tu veux te pointer là-bas genre "bonjour j'aime vos techniques de pointe, j'aimerai travailler avec vous?"
 
Et c'est dans le cardre de quoi? Master? thèse? Post-Doc?

Je ne pense qu'en cancero, on utilise réellement des techniques de pointes, pas plus que dans les autres labo de biochimie ou biologie moléculaire.
Sinon y'a la Suisse qui sont sur-équipés.

En fait, je ne fais que me renseigner. Je devrai faire un stage en M2 l'année prochaine, de 6 mois, que je compte bien faire à l'étranger. Mais ma méconnaissance de "qui fait quoi" rend le tout un peu hasardeux.  
 
Le coup des "techniques de pointes", serait pour avoir une formation sur ce qui se fait actuellement, et avoir une bonne vision sur ce qu'il sera possible de faire dans les années futures.
 
Et voir comment la recherche se passe, ailleurs.

La suisse pour l'équipement et la proximité, les us pour voir ce que c'est, sinon y'a l'australie qui est apparement pas mal niveau équipement
 
Mais sinon ce que tu peux faire c'est éplucher la biblio et voir en fonction des technique de pointe que tu aimerais pratiquer, quels labos les utilisent!

C'est plus tellement necessaire d'aller aux US.
Y'a de tres bons labos richissimes en Europe.
 
Pour ex, mon futur chef vient des US, il est rentre en Suisse y'a 2 ans et il me dit qu'y a pas photo, il a bcp plus de moyens en Suisse.  
 
Mais ne me faites pas dire  que ce que j'ai pas dit, les US ca reste tres tres fort et dans tous les domaines.

Niveau équipement, les Pays-Bas sont pas mal du tout non plus.

 
Tout a fait  

En fait, y'a que la France où ça fait un peu tiers-monde...

 
Fake, il y a aussi Monaco où ils n'ont pas le moindre labo de bio potable  

Drap, vu que la bio cell est une des matières les plus interessantes de P1 j'envisage eventuellement de me réorienter là dedans.
 
C'est quoi le parcours pour faire chercheur toussa ? Faut un doctorat j'imagine, à votre avis quelle fac parisienne est la meilleure en bio ?

 
Pour faire chercheur, il faut bien sur un doctorat et surtout beaucoup de patience et de motivation par les temps qui courent. Mais au vu de la situation actuelle, ça ne peut que s'améliorer d'ici la fin de doctorat  
 
Si tu tiens à rester en France par la suite, il faut viser les meilleurs instituts, ce sont eux qui ont le plus d'argent pour recruter. Sur Paris, il y en a un certain nombre mais parmi ceux-ci, je pense que l'Institut Curie puis l'Institut Pasteur sont les plus intéressants. Il me semble que beaucoup de chercheurs de Curie enseignent à Jussieu (à confirmer !) et ça peut donc être une bonne idée d'aller y faire tes études, ça te permettra de prendre contact avec les chercheurs dont les thématiques t'intéressent le plus.

Vu que j'suis déjà à Jussieu ça serait plus pratique effectivement
 
(bons profs à Jussieu, mon prof de bio cell, en plus d'être prof et à l'hosto, dirige aussi un labo de recherche à Jussieu un truc sur les membranes des cellules épithéliales, ça serait à cause de lui si j'devrais suivre des études là dedans )

C'est normal les prof de médecine sont médecins + enseignant + chercheur.
 
Si tu vas à la fac tu pourra devenir chercheur ou enseignant chercheur.
 
La fac on s'en cogne un peu c'est la thématique qui prime, ya de très bonne petite fac sur certain domaine et de grand fac moins bonne dans d'autre.