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Auteur Sujet :

[topik unique] Génétique, biologie moléculaire et structurale.

n°12686522
Rasthor
Posté le 14-09-2007 à 10:37:06  profilanswer
 

Reprise du message précédent :
Question pour ceux qui utilisent des logiciels de visualisation de molécules en 3D (PyMOL, Molmol, Rasmol, SwissPDBviewer, etc, etc...).
 
Vous utilisez des claviers-souris standard, ou bien y'a du matos qui marchent mieux pour ces logiels. (souris avec plus de 3 boutons, clavier avec touches spéciales, etc...)
 
Par exemple, la souris Apple Mighty mouse a une utilisation spéciale dans Pymol. (scrolling horizontal je crois).

mood
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Posté le 14-09-2007 à 10:37:06  profilanswer
 

n°12686847
merlin_67
Arrangeur d'angles farfelus
Posté le 14-09-2007 à 11:13:22  profilanswer
 

Rasthor a écrit :

Question pour ceux qui utilisent des logiciels de visualisation de molécules en 3D (PyMOL, Molmol, Rasmol, SwissPDBviewer, etc, etc...).
 
Vous utilisez des claviers-souris standard, ou bien y'a du matos qui marchent mieux pour ces logiels. (souris avec plus de 3 boutons, clavier avec touches spéciales, etc...)
 
Par exemple, la souris Apple Mighty mouse a une utilisation spéciale dans Pymol. (scrolling horizontal je crois).


 
pour ma part je n'ai que la matos de base...


---------------
Les vers de terre s'enfoncent dans le sol pour ne pas tomber amoureux des étoiles.
n°12686856
merlin_67
Arrangeur d'angles farfelus
Posté le 14-09-2007 à 11:14:47  profilanswer
 

Rasthor a écrit :


Susumo Ohno est encore pas mal cité. (1970). [:dao]


 
je ne connais que yoko
 
[:anauff]


---------------
Les vers de terre s'enfoncent dans le sol pour ne pas tomber amoureux des étoiles.
n°12702796
Svenn
Posté le 16-09-2007 à 14:07:50  profilanswer
 

Pour ceux qui s'ennuient, il y a un futur topouic de qualitay ici  [:huit]  
 
http://forum.hardware.fr/hfr/Discu [...] #t12702446
 
Edit : en fait, il est en train d'ouvrir plein de topics de qualité. J'aurais préféré qu'il se concentre sur un seul parce que là il va se prendre un mass delete et on ne pourra plus jouer avec  :(


Message édité par Svenn le 16-09-2007 à 14:14:12
n°12703171
Profil sup​primé
Posté le 16-09-2007 à 15:12:12  answer
 

Fred999 a eu raison de la SQFP je crains :/

n°12703795
Svenn
Posté le 16-09-2007 à 17:11:46  profilanswer
 


 
Je n'avais pas vu ses autres "oeuvres", ca relevait plus de l'amendement Cracotte 78 que de l'amendement SQFP :/

n°12896065
the veggie​ boy
Who's taking my Lorazepam?
Posté le 06-10-2007 à 17:32:00  profilanswer
 

Bonjour à tous, je réveille un peu ce topic pour vous poser une question d'ordre pratique :

 

je suis actuellement étudiant ingénieur en biomédical (nouvelle formation dispensée à l'université de Liège), et je suis en 4ème année. J'aimerais réaliser mon TFE à l'étranger l'année prochaine, si possible dans un pays non-francophone.

 

Le domaine qui m'intéresse est la bioinformatique (computational genomics, toussa).

 

J'ai évidemment pris contact avec un de mes profs pour lui faire part de mon désir de partir, mais je me disais que certains ici auraient peut-être des informations intéressantes.

 

Bref, si vous connaissez une université avec un bon département de bioinfo, quelques cours intéressants à suivre (je dois prendre 30 crédits de cours au total sur ma dernière année, le reste étant pris par le TFE), dans un endroit sympa, n'hésitez pas à faire signe :)

 

Bon, je ne suis pas biologiste, donc j'imagine que par rapport à beaucoup mon background n'est pas très conventionel (en gros, formation d'ingénieur avec pas mal de cours d'info et quelques cours de biomed (biochimie, génétique, physio moléculaire (oui moi aussi j'ai du étudier des voies de signalisation que j'ai oublié 1 semaine après :sarcastic: :whistle:) et physio des systèmes. Plus des cours plus 'techniques' comme un cours de bioinfo que j'ai cette année (où on se base sur le bouquin computational genomics de nello cristianini (qui a fait une petite conf' vendredi d'ailleurs, assez intéressante, en gros sur l'utilisation de matlab et la toolbox bioinfo pour calculer des distances génétiques, et il citait comme exemples des souches du sars, et une comparaison sapiens/neanderthal), mais aussi des cours de biomécanique (on est en ingé...), modélisation (cours généraux + cours de modélisation bio), etc.)

 

Merci d'avance pour vos éventuels réponses et conseils ;)


Message édité par the veggie boy le 06-10-2007 à 17:32:53

---------------
blacklist
n°12902444
Rasthor
Posté le 07-10-2007 à 11:24:31  profilanswer
 

C'est quoi le TFE ? Travail de Fin d'Etudes ?
 
En bioinfo, y'aurait la Suisse, avec quatre gandes villes clés dans le domaine: Genève, Lausanne, Bâle (Basel) et Zürich (Zürick). Leurs universités sont réunies pour la bioinfo dans le cadre de l'Institut Suisse de Bioinformatique (ISB / SIB): http://www.isb-sib.ch/
Avec les différents groupes de recherche: http://www.isb-sib.ch/groups/intro.htm
 
Sinon en Suisse, il y'a aussi un nouveau truc qui vient de sortir, c'est SystemsX.ch, une initiative dans la biologie des systèmes (Systems Biology): http://www.systemsx.ch/
 
Genève, Lausanne, Neuchatel sont francophone, Fribourg, Berne, Bâle et Zurich allémaniques.

n°12903783
the veggie​ boy
Who's taking my Lorazepam?
Posté le 07-10-2007 à 15:18:28  profilanswer
 

Oui, travail de fin d'étude. L'équivalent d'un mémoire quoi ;)


---------------
blacklist
n°12910251
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 08-10-2007 à 11:23:44  profilanswer
 

C'est la semaine des Nobel, qui lance les paris ? [:dao]  
 
En medecine, le topik Bio Mol de Hfr  :jap:  
 
PLus serieusement, David Lane, ou Rivkun.
Reponse dans qq heures. [:nidnogar]

mood
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Posté le 08-10-2007 à 11:23:44  profilanswer
 

n°12910521
bank
grin and bear
Posté le 08-10-2007 à 11:51:23  profilanswer
 

RykM a écrit :

C'est la semaine des Nobel, qui lance les paris ? [:dao]  
 
En medecine, le topik Bio Mol de Hfr  :jap:  
 
PLus serieusement, David Lane, ou Rivkun.
Reponse dans qq heures. [:nidnogar]


 
Bon, je suppose que tout le monde est déjà au courant de ce (*) Nobel pour cette équipe espagnole qui a déterminé que les rats ne savaient pas faire la différence entre le japonais et le néerlandais quand ils sont parlés à l'envers.  :jap:  
 
http://www.improbable.com/ig/ig-pastwinners.html
 
 
*

Spoiler :

Ig

n°12910576
Svenn
Posté le 08-10-2007 à 11:59:04  profilanswer
 

Ca y est, les resultats sont la !
 
Heureusement que l'imposture Hwang a ete decouverte a temps, on aurait pu decerner le prix Nobel a un excroc sinon :o

n°12911522
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 08-10-2007 à 14:06:24  profilanswer
 

Et merde, encore des ricains :o  
 
La recolte a commence...

n°12912412
Svenn
Posté le 08-10-2007 à 15:39:06  profilanswer
 

RykM a écrit :

Et merde, encore des ricains :o  
 
La recolte a commence...


 
Tu noteras que les 3 laureats du jour sont europeens de naissance mais que deux sont americains d'adoption :/

n°12919483
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 09-10-2007 à 13:14:31  profilanswer
 

Svenn a écrit :

Ca y est, les resultats sont la !
 
Heureusement que l'imposture Hwang a ete decouverte a temps, on aurait pu decerner le prix Nobel a un excroc sinon :o


Il parrait que ces cellules "souches" bien que non clone sont parthénogénétique... Est-ce vrai?


---------------
La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
n°12919621
bank
grin and bear
Posté le 09-10-2007 à 13:29:01  profilanswer
 

NHam a écrit :


Il parrait que ces cellules "souches" bien que non clone sont parthénogénétique... Est-ce vrai?


 
Ouaip:
 
http://www.cellstemcell.com/conten [...] 0907000677
 
l'ironie de l'histoire, c'est que ça représente une avancée, à mon sens, plus intéressante que le clonage initialement annoncé :d

n°12919679
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 09-10-2007 à 13:34:08  profilanswer
 

Clair qu'il s'est plus décédibilisé parce qu'il a voulu fournir des fausses preuves que parce qu'il n'a pas eu le résultat escompté. [:ddr555]


Message édité par NHam le 09-10-2007 à 13:39:11

---------------
La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
n°12921874
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 09-10-2007 à 16:49:12  profilanswer
 

Un francais Nobel de Physique  :sol:

n°12922151
Svenn
Posté le 09-10-2007 à 17:11:00  profilanswer
 

RykM a écrit :

Un francais Nobel de Physique  :sol:


 
En physique, c'est pas si rare que ca quand meme : depuis 1991, ca fait 4 francais sur 40 laureats. C'est surtout en medecine que c'est dramatique  :whistle:

n°12922341
lokilefour​be
Posté le 09-10-2007 à 17:22:52  profilanswer
 

Svenn a écrit :


 
En physique, c'est pas si rare que ca quand meme : depuis 1991, ca fait 4 francais sur 40 laureats. C'est surtout en medecine que c'est dramatique  :whistle:


 
 
Anéffé
 
 
http://blog.foreignpolicy.com/node/system/files?file=images/Douste-Blazy.jpg


---------------

n°12934183
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 10-10-2007 à 20:18:49  profilanswer
 

Ah putain, je viens d'eclater une bouteille de BSA  :fou:  
 
Rapide coup d'oeil pour en recommander... 150 euros... oups :whistle:

n°12934455
Svenn
Posté le 10-10-2007 à 20:46:17  profilanswer
 

RykM a écrit :

Ah putain, je viens d'eclater une bouteille de BSA  :fou:  
 
Rapide coup d'oeil pour en recommander... 150 euros... oups :whistle:


 
Tu vas dans ton carouf local, tu achetes 12 oeufs, tu recuperes les blancs et tu as tes 500 ml de solution concentree d'ovalbumine. Je suis sur que ca marche aussi bien que la BSA pour 90% des applications. Dans les 10% de cas restants, tu pourras toujours utiliser les oeufs pour faire de la meringue, ça ne sera pas perdu  [:huit]

n°12934904
Svenn
Posté le 10-10-2007 à 21:20:49  profilanswer
 

Citation :

Des médecins australiens ont révélé mercredi avoir administré trois jours de suite à un touriste italien des doses régulières de vodka pour lui sauver la vie après qu'il se fut empoisonné.
 
L'homme âgé de 24 ans avait été transporté dans un hôpital du nord du Queensland il y a deux mois après avoir ingéré une quantité importante d'un produit potentiellement mortel que l'on trouve dans l'antigel, dans ce qui semble avoir été une tentative de suicide.
 
Les médecins de l'hôpital Mackay Base avaient alors jugé que la meilleure façon de sauver la vie de cet homme inconscient était d'inverser les effets du poison, du glycol d'éthylène, en lui administrant de l'alcool pharmaceutique.
 
Le docteur Pascal Gelperowicz a expliqué que lorsque les stocks d'alcool pharmaceutique de l'hôpital ont été épuisés, ils ont été chercher une caisse de bouteilles de vodka pour poursuivre le traitement.
 
"Nous sommes rapidement venus à bout des fioles d'alcool à 100% et nous avons décidé que la meilleure façon d'administrer dès lors de l'alcool à notre patient était de le lui faire passer par le biais d'une sonde nasogastrique", a indiqué Dr Gelperowicz.
 
Le patient a reçu l'équivalent de trois verres standard de vodka par heure pendant trois jours dans l'unité de soins intensifs, a précisé Dr Todd Fraser, un collègue du Dr Gelperowicz.
 
"Heureusement pour lui, il avait été placé par l'équipe médicale dans un coma artificiel pendant la majeure partie du traitement", a-t-il indiqué à l'Australian Broadcasting Corporation.
 
"Quand il s'est réveillé, je pense que sa gueule de bois était belle et bien partie", a-t-il ajouté.
 
Bien qu'insolite, ce traitement a été approuvé par les responsables hospitaliers.
 
"Les administrateurs de l'hôpital ont également été très compréhensifs quand nous leur avons expliqué les raisons pour lesquelles nous avons acheté une caisse de vodka", s'est amusé le Dr Fraser.
 
Le patient s'est complètement remis de son empoisonnement et a pu quitter l'hôpital 20 jours plus tard.


 
Quand ils essaient des nouveaux traitements en Australie, ils ne font pas semblants  [:huit]  
 
On aurait fait ça sur un lapin, on avait tous les groupes anti-vivisection sur le dos  :o

n°12934937
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 10-10-2007 à 21:23:59  profilanswer
 

C'est le Dr House local qui supervisait le tout ? :o

n°12935086
Svenn
Posté le 10-10-2007 à 21:37:05  profilanswer
 

RykM a écrit :

C'est le Dr House local qui supervisait le tout ? :o


 
Dans la prochaine saison de la série, ils vont bien adapter cette histoire pour en faire un épisode. C'est bien dans l'esprit en tout cas  :o


Message édité par Svenn le 10-10-2007 à 21:37:20
n°12939782
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 11-10-2007 à 12:45:28  profilanswer
 

RykM a écrit :

Ah putain, je viens d'eclater une bouteille de BSA  :fou:  
 
Rapide coup d'oeil pour en recommander... 150 euros... oups :whistle:


T'achète ça chez qui? [:le kneu]


---------------
La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
n°12940102
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 11-10-2007 à 13:18:03  profilanswer
 

NHam a écrit :


T'achète ça chez qui? [:le kneu]


 
BDH, c'est pour faire des IF  [:dao]

n°12940667
cloud1109
Posté le 11-10-2007 à 14:03:04  profilanswer
 

Bonjour les amis  :jap:  
 
Je suis a la recherche d'une bonne ame qui pourrait m'envoyer ce papier :  
 
Mammalian Stress Granules and Processing Bodies.
 
Kedersha N, Anderson P.
 
Methods Enzymol. 2007;431:61-81
 
 
PMID: 17923231
 
Merci  :hello:

n°12944333
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 11-10-2007 à 19:04:08  profilanswer
 

cloud1109 a écrit :

Bonjour les amis  :jap:  
 
Je suis a la recherche d'une bonne ame qui pourrait m'envoyer ce papier :  
 
Mammalian Stress Granules and Processing Bodies.
 
Kedersha N, Anderson P.
 
Methods Enzymol. 2007;431:61-81
 
 
PMID: 17923231
 
Merci  :hello:


 
J'ai pas access au journal  [:figti]

n°12944351
Svenn
Posté le 11-10-2007 à 19:05:51  profilanswer
 

RykM a écrit :


 
J'ai pas access au journal  [:figti]


 
Moi non plus  [:airforceone]

n°12948576
cloud1109
Posté le 12-10-2007 à 01:00:52  profilanswer
 

Bah merde  :cry:  
 
Des autres bonnes ames dans des labos de bourgeois qui ont acces a tout?  :whistle:

n°12950174
bank
grin and bear
Posté le 12-10-2007 à 11:06:53  profilanswer
 

cloud1109 a écrit :

Bah merde  :cry:  
 
Des autres bonnes ames dans des labos de bourgeois qui ont acces a tout?  :whistle:


 
pas accès non plus [:spamafote]

n°12951027
merlin_67
Arrangeur d'angles farfelus
Posté le 12-10-2007 à 12:36:32  profilanswer
 

cloud1109 a écrit :

Bah merde  :cry:  
 
Des autres bonnes ames dans des labos de bourgeois qui ont acces a tout?  :whistle:


le CNRS a arrêté son abonnement en fin d'année dernière ...


---------------
Les vers de terre s'enfoncent dans le sol pour ne pas tomber amoureux des étoiles.
n°12951390
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 12-10-2007 à 13:27:00  profilanswer
 

Cloud ==> envoye un mail a l'auteur, essaye de le flatter, ca marche tres svt  :o

n°12968544
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 14-10-2007 à 17:26:50  profilanswer
 

Ah putain  :fou:  
 
On peut perdre contre la Nll Zelande, l'Australie, ca ne me derange pas  [:cosmoschtroumpf]  
A la rigueur contre l'Ecosse, l'Irlande voire meme l'Argentine  [:cosmoschtroumpf]  
 
MAIS PAS CONTRE LES ANGLAIS, putain  :fou:  
 
Demain je vais pas au labo, ranafout'  :o  
Je dirais a mon chef que j'ai besoin d'une journee de reflexion pour planifier les manip' et commencer a rediger mon papier  [:dao]

n°12969116
Svenn
Posté le 14-10-2007 à 18:57:11  profilanswer
 

RykM a écrit :

Ah putain  :fou:  
 
On peut perdre contre la Nll Zelande, l'Australie, ca ne me derange pas  [:cosmoschtroumpf]  
A la rigueur contre l'Ecosse, l'Irlande voire meme l'Argentine  [:cosmoschtroumpf]  
 
MAIS PAS CONTRE LES ANGLAIS, putain  :fou:  
 
Demain je vais pas au labo, ranafout'  :o  
Je dirais a mon chef que j'ai besoin d'une journee de reflexion pour planifier les manip' et commencer a rediger mon papier  [:dao]


 
En fait, tu veux aller en Suisse faire ton post-doc parce que tu es sur qu'on ne perdra jamais contre ce pays, c'est bien ça ? :o

n°12969193
bank
grin and bear
Posté le 14-10-2007 à 19:07:34  profilanswer
 

Svenn a écrit :


 
En fait, tu veux aller en Suisse faire ton post-doc parce que tu es sur qu'on ne perdra jamais contre ce pays, c'est bien ça ? :o


 
Il n'y a pas que le rugby/foot dans la vie   :o  
 

Citation :

Curling - Championnat du monde  
15ème journée  
Suisse - France - 16h30  
Victoire de la Suisse après 5 manches  
 
Au championnat d'Europe en 2006 , la Suisse avait gagné 8-6 en match d'ouverture contre la France , la Suisse a ensuite remporté ces championnats du monde !  
La France termina 7ème sur 10 .  
 
Les suisses semblent malgré tout au-dessus des français , ils ne sont pas champion d'Europe sans raison , l'enjeu de ce match devrait les stimuler encore plus et c'est la meilleure équipe qui devrait l'emporter donc la Suisse ! Ils devraient prendre les commandes dés le début de la partie c'est pourquoi je vais jouer les suisses qui mènent après 5 manches !


 
On la ramène moins du coup  :fou:  :o

n°12973693
Profil sup​primé
Posté le 15-10-2007 à 07:48:20  answer
 

[:rofl]
décidément... on est MAUVAIS §§§

n°12975616
Svenn
Posté le 15-10-2007 à 13:24:16  profilanswer
 

J'ai decouvert ce week-end que Hfr etait une reference jusque dans le Tyrol  :o  
 
http://img90.imageshack.us/img90/7586/tirolertageszeitungso7.jpg

n°12998582
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 17-10-2007 à 18:01:20  profilanswer
 

J'adore ce genre de papier  :D  
http://genetics.plosjournals.org/p [...] en.0030175
 
L'abstract qui fait qq lignes:
Two recently published papers describe nuclear DNA sequences that were obtained from the same Neanderthal fossil. Our reanalyses of the data from these studies show that they are not consistent with each other and point to serious problems with the data quality in one of the studies, possibly due to modern human DNA contaminants and/or a high rate of sequencing errors.
 
Reglement de compte... [:huit]

n°12998671
Svenn
Posté le 17-10-2007 à 18:11:07  profilanswer
 

RykM a écrit :

J'adore ce genre de papier  :D  
http://genetics.plosjournals.org/p [...] en.0030175
 
L'abstract qui fait qq lignes:
Two recently published papers describe nuclear DNA sequences that were obtained from the same Neanderthal fossil. Our reanalyses of the data from these studies show that they are not consistent with each other and point to serious problems with the data quality in one of the studies, possibly due to modern human DNA contaminants and/or a high rate of sequencing errors.
 
Reglement de compte... [:huit]


 
Je ne sais pas lequel des deux papiers est faux mais il y a au moins un des deux groupes qui a bien boulaytise  :o

mood
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