Reprise du message précédent :

 
Umlaut  

 
de plus l'affinité GST-GSH est assez pourrie (dans les 10^-5); tu dois compter 50% de rendement grand max.
J'essaie la colonne cobalt lundi   tu utilises laquelle ?

 
TALON de Clontech    
 
http://www.clontech.com/products/d [...] 88&tabno=2
 

wahou c'est spectaculaire. C'est quel type de prot? membranaire ou soluble ?
au temps pour moi, il s'agit de pub clontech

 
On a des resultats assez similaires au labo sur des proteines solubles en colonne de cobalt. Par contre, on perd souvent 50% de la proteine
 
 
Edit : je corrige, j'ai melange cobalt et nickel. On a clairement des resultats plus propres en cobalt qu'en nickel  

 
Je vais te poster l'une des miennes, tu vas etre sur le cul  

[img][/img]
 
Les bandes en-dessous, c'est de la degradation, j'ai verifie par WB.

Pour la petite histoire, c'est une prot' soluble exprimee chez les BL-21, le buffer est au CHAPS avec une pellete de NaCl (2M ), du Sarkozyl, un soupcon de Triton, un peu de Tween, du Glycerol et du Beta Mercapto  

 
Tu es vraiment sur que ta proteine est soluble ?  

 
 
Dans le Tris avec "seulement" 0.3M de NaCl elle est soluble, mais pour cette manip j'en voulais des kilos   donc petit cocktail de detergent    
 
J'en ai tire plusieurs mg, c'etait pour faire des anticorps  

 
Je me disais aussi. Avec un traitement pareil, seule la proteine prion doit rester au fond du tube  

 
Le prion, je te le traite au guanidium 9M

ça c'est de la solubilisation au pied de biche...  

questions orthographe : genes orthologues ou hortologues ?
 
 

 
La reponse est dans la question  

Pourtant on est Samedi...

 
+1
 
Impressionnant.
 
Qu'est-ce que c'est beau !
 
   
 

y'a encore qq'un ?
 
le repliement de type TIM :
 
inclut des brins Beta antiparallele ? V ou F
les brins Beta sont reliés par des connexions croiées ? V ou F
 
 
merci d'avance

 
Le TIM barrel, c'est un tonneau beta parallele a 8 brins et 8 helices. Par contre, je ne vois pas ce que tu appelles des "connexions croisees"

 
 
en fait si c'est du parallele c'est forcement croise
 
--->
 
--->
 
 
pour relier les deux il faut "croiser"
 
 
contrairmeent a ca :
 
<---
 
--->

questions de prot homolgues :
 
correspondent a un processus d'evolution convergente ou divergente?  
meme nombre de domaine ?
 

Putain encore une defaite face a l'Ecosse    
 
Ca fait 3 ans que je vis en Ecosse, on s'est tjs fait taper (Rugby, Foot)    
L'ambiance dans le pub ce soir    
 
C'est une malediction, bordel  

faut que tu finisse ta these fissa pour qu'on puisse recommencer à gagner contre eux

Je pose ma question ici aussi puisque c'est de la biochimie  
 
2 questions donc :  
 
-La METHIONINE c'est un acide 2 amino 4 methyl thiobutyrique selon mon cours mais je ne vois pas d'où sort le "4 methyl" en regardant la forme semi dev.
 
-Avec 5 carbones, on utilise souvent le prefixe "pent", mais parfois aussi "val" (enfin valérique), pourquoi ?
 
Merci

 
2-amino-4-methylsulfanylbutanoic acid en notation internationale
le méthyle correspond au CH3 en bout de chaîne (après le "thiol" ).
regarde la formule développée ici, c'est très pratique pubchem:
http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/su [...] gi?cid=876
 

 
ça c'est la joie entre les anciens termes de pharma utilisés en biochimie et les termes des chimistes puristes    
 
 

Rugby?

En fait c'est pas "4-méthy etc" mais "4-méthylthio".
Enfin bon, je suis d'accord que c'est pas top clair à la lecture.

 
L'annee derniere aux VI nations, ils nous ont tappes  

 
It's ok, merci !  

 
Pour être exact le prof a écrit "4methyl thiobutyrique", enfin bon c'est de l'ordre du détail pour moi.  

Je me doute.
C'était juste pour souligner le fait que le groupement en 4 n'est pasun méthyl mais un "méthylthio".

Bon, mettons que Albert E. a publié un papier en 1905, que je n'ai pas lu et dans lequel il établit une formule lambda. Max P., 10 ans plus tard, réutilise la formule telle quelle en citant Albert.

Et moi, en 2007, j'ai lu le papier de Max P., et je veux utiliser la formule... je cite qui ? Albert, sachant que je n'ai jamais lu son travail, ou Max, sachant que ce n'est pas lui qui a établi la formule ?

Je citerais Albert E.  

 
Etant donne qu´Albert E et Max P sont biologistes, la logique voudrait que tu te conformes aux regles implicites qui existent en biologie en la matiere. Pour schematiser, tu ne cites pas les papiers de plus de 20-25 ans, a moins que l´article cite soit un point fondamental de ton raisonnement. Quasiment plus personne ne cite par exemple Laemmli 1970 ou Mullis 1986 alors que la grosse majorite des articles publies en bio aujourd´hui se basent dessus

on essaie au max de toujours citer le papier d'origine... et en général on ne cuisine pas trop la personne sur la connaissance de la biblio  

Si tu veux absolument citer quelqu´un, c´est bien entendu Albert E qu´il faut citer.

Ok

Susumo Ohno est encore pas mal cité. (1970).

Par contre si ça peut te rassurer Svenn, en physique c'est pareil, tout le monde ne cite que les travaux de moins de vingt ans parce que ça donne l'impression que la recherche présentée est moderne (et pis c'est plus pratique, les papiers sont onlines), mais généralement le boulot a été fait de façon tout aussi complète au début du siècle... (celui d'avant, hein...).

Question pour ceux qui utilisent des logiciels de visualisation de molécules en 3D (PyMOL, Molmol, Rasmol, SwissPDBviewer, etc, etc...).
 
Vous utilisez des claviers-souris standard, ou bien y'a du matos qui marchent mieux pour ces logiels. (souris avec plus de 3 boutons, clavier avec touches spéciales, etc...)
 
Par exemple, la souris Apple Mighty mouse a une utilisation spéciale dans Pymol. (scrolling horizontal je crois).