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Auteur Sujet :

[topik unique] Génétique, biologie moléculaire et structurale.

n°10394670
Yvounet2
Posté le 16-01-2007 à 21:51:42  profilanswer
 

Reprise du message précédent :

RykM a écrit :

C'est pour du public


 
Bon alors oui "a ce qu'il se dit", c'est mieux que le sud de la Suisse, mais effectivement, faut supporter le dialecte, et le centre ville est minuscule car c'est surtout une ville hyper industrielle. :(  
 
Tu pourra toujours visiter l'Alsace  :hello: mais bon ça fera pas 2ans non plus  :heink:  
 
Maintenant pour le ski, je dirais 1h/1h30 pour la première  :) , mais faut me confirmer, par contre moins le choix que vers Geneve.  
Comme c'est un de mes facteurs de choix également, je privilégie Genève/Lausanne pour la montagne.

mood
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Posté le 16-01-2007 à 21:51:42  profilanswer
 

n°10394910
Cardelitre
ಠ_ಠ ۞_۟۞ ┌( ಠ_ಠ)┘ סּ_סּ
Posté le 16-01-2007 à 22:14:15  profilanswer
 

RykM a écrit :

Je louche sur l'ISREC et le FMI de Bale  [:huit]  
 
Lausanne c'est a combien de temps en voiture de la station de ski la plus proche ? :whistle:


La plus proche en bagnole ça doit être 30-40 minutes... [:huit]

n°10394933
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 16-01-2007 à 22:15:34  profilanswer
 

Cardelitre a écrit :

La plus proche en bagnole ça doit être 30-40 minutes... [:huit]


 
Les Diablerets ?  :??:  
 
T'ain je mets une grosse option sur l'ISREC  [:huit]

n°10394956
Cardelitre
ಠ_ಠ ۞_۟۞ ┌( ಠ_ಠ)┘ סּ_סּ
Posté le 16-01-2007 à 22:19:19  profilanswer
 

RykM a écrit :

Les Diablerets ?  :??:


Ouais ça doit être la première station valable depuis Lausanne, c'est tout près...
 

RykM a écrit :

T'ain je mets une grosse option sur l'ISREC  [:huit]


Si tu peux c'est cool. D'autant que Lausanne c'est quand même vachement plus animé et agréable à vivre que Bâle.

n°10395246
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 16-01-2007 à 22:48:33  profilanswer
 

Bah RDV en Suisse alors  [:nidnogar]  
 
On verra tout ca dans qq mois...

n°10395474
Cardelitre
ಠ_ಠ ۞_۟۞ ┌( ಠ_ಠ)┘ סּ_סּ
Posté le 16-01-2007 à 23:09:23  profilanswer
 

RykM a écrit :

Bah RDV en Suisse alors  [:nidnogar]  
 
On verra tout ca dans qq mois...


Pense au passage à redescendre un peu de ce savoureux breuvage doré dont nos amis en kilt ont le secret... :o

n°10395622
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 16-01-2007 à 23:23:01  profilanswer
 

Cardelitre a écrit :

Pense au passage à redescendre un peu de ce savoureux breuvage doré dont nos amis en kilt ont le secret... :o


 
En echange d'une meule de gruyere, pq pas  :o

n°10395730
Cardelitre
ಠ_ಠ ۞_۟۞ ┌( ಠ_ಠ)┘ סּ_סּ
Posté le 16-01-2007 à 23:31:17  profilanswer
 

RykM a écrit :

En echange d'une meule de gruyere, pq pas  :o


We've got a deal.  [:glaurung]


Message édité par Cardelitre le 16-01-2007 à 23:45:52
n°10395866
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 16-01-2007 à 23:44:47  profilanswer
 

Yvounet2 a écrit :

Et les "pas hybrides" ARN/ARN (double brin quoi), j'ai même vu cet été à une conf un gars qui a joué avec des quadruple brins, le 1 apparié avec 2 apparié avec 3 et apparié avec 4 lui même apparié avec 1, je sais plus par contre si c'était :
- pour le fun de la structure,
- un truc qui existe temporairement à un moment,
- utile pour quelque chose.


 
 :jap:

n°10398166
bank
grin and bear
Posté le 17-01-2007 à 11:55:22  profilanswer
 

Un papier qui était sorti en décembre dernier dans science express qui remet (un peu :whistle: ) en question le réflexe:
 
[réception du séquencage]
- hm une mutation.... ouarf c'est bon elle est silencieuse
 

Citation :

A "Silent" Polymorphism in the MDR1 Gene Changes Substrate Specificity


 
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez [...] med_docsum
 

Citation :

Gottesman’s hunch is that the apparently ‘silent’ SNP has an effect on the rate of translation from mRNA to protein, thereby disrupting the assembly of the P-gp pump. It’s a bit like coiling up a garden hose, he suggests. If a gardener proceeds slowly and steadily, the hose coils up nice and neatly. If, however, the task is rushed, the hose ends up in a horrible mess.  
 
‘Proteins this big fold and insert in the membrane while they are being translated,’ said Gottesman. ‘Even small changes in the rate of translation can change protein folding in a subtle way that affects the ability of the protein to interact with substrates and inhibitors.’


 
http://www.rsc.org/chemistryworld/ [...] 120602.asp

mood
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Posté le 17-01-2007 à 11:55:22  profilanswer
 

n°10409877
Black Mess​iah
La réponse est 42
Posté le 18-01-2007 à 14:41:58  profilanswer
 

;)  ;) YESSSSS!
 
Je suis super content, après 2 ans d'attente, la protéine dont j'avais résolu la structure en stage 3 mois (de la transfo au premier jeu de données, j'ai du partir avant la résolution de la structure) est enfin accessible sur rcsb (ID:2fyf pour ceux que ca interessera).
 
Mis a part le temps assez court pour trouver la structure (3 mois c'est trop de la boulette), je suis super content parce que mon zoli crystal diffracte à 1,50A...
 
Désolé pour ce moment d'autocongratulation, mais fallait que ca sorte  :pt1cable:  
 
Comme quoi j'aurai fait un bon scientifique (peut etre), mais bon tant pis je suis parti pour etre consultant en marketing / strat. Quand je lis ca, je me dis: " Nimporte quoi..."
 
Voila, dsl encore mais je voulais faire partager ma joie avec les autres! ;)


---------------
Qui fait le malin tombe dans le ravin...
n°10410218
hephaestos
Sanctis Recorda, Sanctis deus.
Posté le 18-01-2007 à 15:09:30  profilanswer
 

Black Messiah a écrit :


Comme quoi j'aurai fait un bon scientifique.


 
Un bon biologiste tu veux dire...
 
Cristalliser une protéine. En trois mois. Félicitations.  [:hephaestos]

n°10410222
hephaestos
Sanctis Recorda, Sanctis deus.
Posté le 18-01-2007 à 15:09:38  profilanswer
 

Ah ouais, :o

n°10410392
Svenn
Posté le 18-01-2007 à 15:20:46  profilanswer
 

hephaestos a écrit :

Un bon biologiste tu veux dire...
 
Cristalliser une protéine. En trois mois. Félicitations.  [:hephaestos]


 
C´est bien, 3 mois. Ca m´a pris 4 ans pour cristalliser ma proteine et ca m´a coute la moitie de mes cheveux  :o  
(Nan, je precise tout de suite, ce n´est pas la keratine de H. Sapiens que j´ai cristallisée  :o )
 
 
D´ailleurs, c´est extremement formateur la cristallo des proteines, on apprend plein de choses en biologie, chimie, physique, traitement de donnees, etc. Bien que tu sois un vil physicien, je considere que ta situation est encore recuperable. Ce que tu vas faire, c´est que tu vas aller acheter une dizaine d´oeufs au supermarche et tu vas cristalliser l´ovalbumine qui y a dedans. Je veux les photos des cristaux demain matin avec les cliches de diffraction. En plus, vu que tu es a Grenoble tu as l´ESRF juste a cote, c´est beaucoup plus facile  :o

n°10411949
Yvounet2
Posté le 18-01-2007 à 17:43:04  profilanswer
 

Svenn a écrit :

D´ailleurs, c´est extremement formateur la cristallo des proteines, on apprend plein de choses en biologie, chimie, physique, traitement de donnees, etc.


 
Héhé moi j'attaque dans moins de 2 semaine la cristallo !  Enfin, j'attaque en stage pour de vrai, parcequon a déja fait des cristaux et analyser du hkl, mais jamais fait mumuse avec la machine (juste une fois regarder), j'aurais mes prots a moi et je pourrais en faire ce que je veux.
 
Par contre les photos, à Sanofi c'est niet  :sweat:  tout comme le portable, les dispositifs de stockage de données (tiens j'ai pas demandé pour le papier  :lol:  ) et internet  :kaola:

n°10411990
bank
grin and bear
Posté le 18-01-2007 à 17:45:54  profilanswer
 

Svenn a écrit :


Bien que tu sois un vil physicien, je considere que ta situation est encore recuperable. Ce que tu vas faire, c´est que tu vas aller acheter une dizaine d´oeufs au supermarche et tu vas cristalliser l´ovalbumine qui y a dedans. Je veux les photos des cristaux demain matin avec les cliches de diffraction. En plus, vu que tu es a Grenoble tu as l´ESRF juste a cote, c´est beaucoup plus facile  :o


 
Bon sang mais je me disais bien que sa tête me disait qqch! J'étais à un congrès à Grenoble l'année dernière, j'avais fait une photo d'un type qui prêchait dans un parc.
 

Spoiler :

http://img299.imageshack.us/img299/6818/hephieonhissoapboxth9.jpg


 
:d

n°10414147
Svenn
Posté le 18-01-2007 à 21:43:18  profilanswer
 

Yvounet2 a écrit :

Héhé moi j'attaque dans moins de 2 semaine la cristallo !  Enfin, j'attaque en stage pour de vrai, parcequon a déja fait des cristaux et analyser du hkl, mais jamais fait mumuse avec la machine (juste une fois regarder), j'aurais mes prots a moi et je pourrais en faire ce que je veux.


 
Le synchrotron, c'est sympa quand tu y vas la premiere fois, il y a toujours un côté magique à "convertir" des cristaux en clichés de diffraction. Par contre, ça devient rapidement lourdingue de passer 8 heures (ou beaucoup plus si affinités) dans un batiment aussi convivial qu'un hangar  :o

n°10414314
lumi
Posté le 18-01-2007 à 22:05:30  profilanswer
 

demain partiel de spa [:totoz] (structure des prot et des ac nucleiques..)
 
 
ADN, helice alpha, base, sucre, phosphate, feuillet beta, tournents, acides aminés, appariements de base, brins paralleles etc....
:pt1cable:


Message édité par lumi le 18-01-2007 à 22:05:41
n°10416350
Profil sup​primé
Posté le 19-01-2007 à 03:58:29  answer
 

bank a écrit :

Bon sang mais je me disais bien que sa tête me disait qqch! J'étais à un congrès à Grenoble l'année dernière, j'avais fait une photo d'un type qui prêchait dans un parc.
 


 
:d


 
[:xp1700]

n°10422874
XamamaX
Posté le 19-01-2007 à 20:55:18  profilanswer
 

Bonsoir, venant juste de foirer mon examen de biochimie et commençant à préparer celui de biocellulaire, un truc que je ne saisi pas.
Dans le mécanisme de l'apoptose , pourquoi aprés la condensation de la chromatine et du cytoplasme, l'ADN se fragmente ?
Merci à celui qui éclairera ma lanterne :)

n°10423219
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 19-01-2007 à 21:51:24  profilanswer
 

XamamaX a écrit :

Bonsoir, venant juste de foirer mon examen de biochimie et commençant à préparer celui de biocellulaire, un truc que je ne saisi pas.
Dans le mécanisme de l'apoptose , pourquoi aprés la condensation de la chromatine et du cytoplasme, l'ADN se fragmente ?
Merci à celui qui éclairera ma lanterne :)


 
Par l'action de nucleases  :)

n°10423398
Svenn
Posté le 19-01-2007 à 22:24:01  profilanswer
 

Tu as repondu a la question "comment?" et pas "pourquoi?"  :whistle:  
 
Personnellement, je ne connais pas la réponse, mais ça semble logique qu'une cellule en apoptose (et notamment son génome) doive être entièrement démontée pour éviter toute inflammation ?

n°10423515
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 19-01-2007 à 22:39:47  profilanswer
 

Svenn a écrit :

Tu as repondu a la question "comment?" et pas "pourquoi?"  :whistle:  
 


 
C'etait un peu l'idee  :D

n°10423556
Yvounet2
Posté le 19-01-2007 à 22:45:19  profilanswer
 

Svenn a écrit :

Le synchrotron, c'est sympa quand tu y vas la premiere fois, il y a toujours un côté magique à "convertir" des cristaux en clichés de diffraction. Par contre, ça devient rapidement lourdingue de passer 8 heures (ou beaucoup plus si affinités) dans un batiment aussi convivial qu'un hangar  :o


 
Ah ouais mais non, moi je parlais d'une petite source de lumière dans le labo ou je vais bosser, pas tout de suite la grosse artillerie :-) faut que je fasse mes armes d'abord !
 
Tiens d'ailleurs j'ai vu passer une proposition de thèse à l'ESRF, RX + poudres appliquées aux protéines  :sol: , bon m'ont pas recontactés  :cry:

n°10424121
greentea
Posté le 20-01-2007 à 00:10:38  profilanswer
 

XamamaX a écrit :

Bonsoir, venant juste de foirer mon examen de biochimie et commençant à préparer celui de biocellulaire, un truc que je ne saisi pas.
Dans le mécanisme de l'apoptose , pourquoi aprés la condensation de la chromatine et du cytoplasme, l'ADN se fragmente ?
Merci à celui qui éclairera ma lanterne :)

Parce qu'il faut bien limiter le nombre de divisions cellulaires (environ 60) pour éviter d'arriver à des cellules boîteuses suite aux divisions successives.  :??:  
Et puis, faut laisser la place aux jeunes. [:adodonicoco]

n°10424204
XamamaX
Posté le 20-01-2007 à 00:21:59  profilanswer
 

greentea a écrit :

Parce qu'il faut bien limiter le nombre de divisions cellulaires (environ 60) pour éviter d'arriver à des cellules boîteuses suite aux divisions successives.  :??:  
Et puis, faut laisser la place aux jeunes. [:adodonicoco]

 
 
Hu ? Tu parles de semenescence replicative la non ? Avec limites de Hayflick, raccourcisement des télomères ect ect ... ?
 
Sinon un amis m'a repondu à la même question que c'était surtout pour désactiver l'ADN qui pourrait être viral/tumoral ...

n°10424253
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 20-01-2007 à 00:29:54  profilanswer
 

XamamaX a écrit :

Hu ? Tu parles de semenescence replicative la non ? Avec limites de Hayflick, raccourcisement des télomères ect ect ... ?
 
Sinon un amis m'a repondu à la même question que c'était surtout pour désactiver l'ADN qui pourrait être viral/tumoral ...


 
Senescence  [:aloy]  
 
Et il se trompe. Certaines lignees cellulaires epitheliales ont un potentiel replicatif "presque" sans limite.
Pour revenir a ta question, il est tres hasardeux de poser des questions du type "pourquoi" en science et en biologie particulierement.  
L'apoptose est un phenomene complexe et divers, bien caracterise dans le cas du systeme immunitaire (lympho-T et selection des lympho-B) ou l'on comprend bien POURQUOI il est necessaire d'eliminer l'ADN cible (porteur de virus ou de mauvais remaniement genetique codant pour les anti-corps).
Il est egalement bien compris en reponse a p53 dans le cas de cellules endommagees et genetiquement instables.
 
 
 

n°10424267
Cardelitre
ಠ_ಠ ۞_۟۞ ┌( ಠ_ಠ)┘ סּ_סּ
Posté le 20-01-2007 à 00:31:18  profilanswer
 

XamamaX a écrit :


Dans le mécanisme de l'apoptose , pourquoi aprés la condensation de la chromatine et du cytoplasme, l'ADN se fragmente ?


Disons qu'en biol la question du pourquoi reste assez floue et soumise à l'interprétation en général... On peut assez bien dire comment, mais le pourquoi c'est une autre question. La réponse facile et rigoureusement exacte c'est "parce que". En fait d'un point de vue évolutif si ce mécanisme existe c'est qu'il apporte un bénéfice net par rapport à s'il n'existait pas. Maintenant on peut faire différentes suppositions, genre l'ADN non fragmenté a une action inflamatoire passé un certain seuil, ou alors découper l'ADN le rend plus facile à réassimiler et donc évite les pertes (ce qui me paraît le plus probable personnellement, étant donné que le mécanisme de l'apoptose est essentiellement un système de démantèlement ordonné de la cellule histoire d'éviter le gaspillage et les agressions liées aux "déchets" ).
Mais bon, à moins de faire une souris k-o pour les nucléases impliquées (pour autant que ça n'ait pas déjà été fait), je ne vois pas trop comment on pourrait répondre à la question du pourquoi là comme ça...

n°10424306
bank
grin and bear
Posté le 20-01-2007 à 00:39:01  profilanswer
 

Citation :

DNA fragmentation is a hallmark of apoptosis (programmed cell death). However, the biological function of apoptotic DNA fragmentation remains unclear. ...


 
2006 :d
 

Citation :

... These data, in combination with published reports on the existence of tumor-specific gene mutations/deletions in the DFF/CAD genes in human cancer samples, suggest that apoptotic DNA fragmentation factor is required for the maintenance of genetic stability and may play a role in tumor suppression.


 
http://www.pubmedcentral.nih.gov/a [...] d=16432220


Message édité par bank le 20-01-2007 à 00:40:04
n°10445832
Profil sup​primé
Posté le 22-01-2007 à 18:19:06  answer
 

Bonsoir !

 

J'ai poursuivi aujourd'hui mon cours d'immuno de TS, et on a vu notamment la réaction immunitaire face au VIH.
J'ai 2-3 choses qui me laissent perplexe:

 

- On a vu que de maniere générale, le taux de lymphocytes T4 (LT4) diminuait au cours des années, et que le taux d'anti corps et de lymphocytes T8 (LT8) augmentait tres fortement. Pourtant, ces AC et LT8 ne permettent pas au virus de se multiplier, puisque pas de protéine CD4 sur sa membranne cellulaire.

 

Si le taux de LT4 diminue, et que celui de LT8 augmente, pourquoi le virus n'est-t-il pas stoppé dans sa multiplication ? et aussi pourquoi les LT8+AC sont inefficaces ?

 

Apres je me demandais (c'est tres naif sans doute, mais je n'ai pas énormément de connaissances dans ce domaine), si on découvre qu'un individu possède le virus (par la présence d'AC spécifiques), ne serait-il pas possible de tuer tous ses LT4, afin que le virus ne se multiplie plus, et lui en ré-injecter une fois celui-ci mort ? (l'individu etant placé dans une chambre hermétique)

 


Voilà, la derniere doit etre stupide, mais je voulais savoir :D

 

Merci :jap:

Message cité 1 fois
Message édité par Profil supprimé le 22-01-2007 à 18:22:10
n°10446047
Svenn
Posté le 22-01-2007 à 18:44:56  profilanswer
 


 
Les LT8 et LB ont besoin d'un ordre venant des LT4 pour se multiplier. Donc sans LT4, il n'y a pas de reponse specifique possible.
 

Citation :

Apres je me demandais (c'est tres naif sans doute, mais je n'ai pas énormément de connaissances dans ce domaine), si on découvre qu'un individu possède le virus (par la présence d'AC spécifiques), ne serait-il pas possible de tuer tous ses LT4, afin que le virus ne se multiplie plus, et lui en ré-injecter une fois celui-ci mort ? (l'individu etant placé dans une chambre hermétique)


 
En theorie, on devrait pouvoir eliminer les LT4 de l'organisme, on y arrive bien avec les LB chez les leucemiques. Mais ca ne sauverait pas un malade du sida etant donne que le HIV est egalement present dans d'autres cellules a un niveau plus faible ( cellules dendritiques surtout ). Et la, il n'y a vraiment rien a faire.

n°10446163
Profil sup​primé
Posté le 22-01-2007 à 18:58:21  answer
 

Merci beaucoup :jap:
 
Par curiosité, on entend parler de découvertes qui pourraient aider a combattre le HIV, ca en est ou ?

n°10446180
Svenn
Posté le 22-01-2007 à 19:00:07  profilanswer
 


 
Je suis un peu plus loin de la virolgie desormais et je n'ai pas de nouvelles vraiment fraiches a ce sujet  ;)

n°10447025
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 22-01-2007 à 20:43:39  profilanswer
 


 
Il me semble que la voie "vaccin" a essuye de tres nombreux echecs, la derniere news qui me vient a l'esprit vient des cellules NK (Natural Killer) qui expliquerait la resistance observee de certaines prostituees africaine.  [:cosmoschtroumpf]

n°10447445
Svenn
Posté le 22-01-2007 à 21:26:42  profilanswer
 

Pour ce qui est des vaccins, j'entends pas grand chose non plus donc c'est pas bon signe. Peut-être que l'approche vaccinale n'est pas adaptée pour un virus qui sait très bien se mettre à l'abri du système immunitaire :/

n°10447470
ElfiK
Make U'r choice Oo'
Posté le 22-01-2007 à 21:29:38  profilanswer
 

kewl j'ai que 5 pages de retard.  [:draculette]

n°10456138
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 23-01-2007 à 20:50:51  profilanswer
 

Tain ma purif' de prot sur colonne nickel, elle est toute pourrite :/

 

Svenn, est-ce que je peux poster demain le gel coomassie et avoir ton avis  :whistle:

Message cité 2 fois
Message édité par RykM le 23-01-2007 à 20:51:12
n°10456239
Profil sup​primé
Posté le 23-01-2007 à 21:00:08  answer
 

RykM a écrit :

Tain ma purif' de prot sur colonne nickel, elle est toute pourrite :/
 
Svenn, est-ce que je peux poster demain le gel coomassie et avoir ton avis  :whistle:


 
ispice di coomasse :ange:

n°10456408
lumi
Posté le 23-01-2007 à 21:17:55  profilanswer
 

chez la droso c'est quoi l'histoire de la recombinaison ?
en meiose y'en a pas du tout ? ou c'est juste chez les males que y'en pas ?  
 
edit : bon au final c'est effetivement uniquement chez le male

Message cité 1 fois
Message édité par lumi le 23-01-2007 à 22:06:21
n°10456816
Svenn
Posté le 23-01-2007 à 22:00:47  profilanswer
 

RykM a écrit :

Tain ma purif' de prot sur colonne nickel, elle est toute pourrite :/
 
Svenn, est-ce que je peux poster demain le gel coomassie et avoir ton avis  :whistle:


 
Oui, bien sur.
 
Et meme dans le cas ou le diagnostic est plutot "  :cry:  ", il y a de toute facon plein de choses a tenter pour corriger le probleme  :o


Message édité par Svenn le 23-01-2007 à 22:00:56
n°10456928
radioactif
Mighty mighty man
Posté le 23-01-2007 à 22:10:23  profilanswer
 

Tiens, je pose mon drapal.

mood
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Posté le   profilanswer
 

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