Reprise du message précédent :

Alors pourquoi t'es surpris qu'il fasse de l'info ?

 
C'etait plutot le combo "info + cinema" qui m'a fait reagir    
 
Bref, recentrons  

 
Ben j'avoue que c'est un peu le saut dans l'inconnu là.
 
[3615Mylife]
 
A la base je voulais faire de l'informatique pure, mais à un moment je me suis demandé si je voulais vraiment faire ça jusqu'à 65 ans... et là j'ai réalisé que la Vie (comment ça marche toute cette fantastique machinerie?) est quelque chose qui m'a toujours beaucoup intéressé... Donc qu'est-ce qui m'intéresse en bio ? A priori, je dirais "un peu tout", étant donné que je ne connais pas encore vraiment tout ce qu'on peut y faire !  
 
Maintenant, la formation que l'EPFL propose m'a grandement séduite, car elle débouche sur un tas des thèmes (études sur le fonctionnement du cerveau, bio-ingéniérerie, etc) qui semblent vraiment tous plus captivants les uns que les autres ! (En tous cas d'après ce que j'ai pu voir dans les différents labos qu'on nous fait visiter). Donc on va dire que j'attends un peu de voir ce qui m'intéresse le plus    
 
[/3615Mylife]
 

Je dis juste bonsoir...en coup de vent.
enfin si c'est un coup de vent de deux heures comme hier soir

 
En plus c'est vendredi, donc

Et moi je pars.... peut-être à plus tard.

C'est ce que je pensais...

Bon aller au lit!
A demaing!

Yep, j'ai entendu dire ça aussi, pas de bol pour les genevois et tant mieux pour nous

Bonjour la dérive du topic. Je propose de le renommer en "chat entre étudiants en bio".

 
Tu espérais quoi, un cours magistral ? un copier-coller de Yahoo! News ?

Je ne sais pas quoi te répondre.

Nan, mais continuez à discuter. Mais bon, faudrait renommer le topic quoi.

Tu veux qu'on parle de quelque chose de précis ?  

Je ne pense pas.
On est un peu parti en torche c'est vrai, mais là on va se reprendre.

 
 
I'm waiting....  

J'ai un peu relancé la discussion...

OK je fais mijoter...

Dans 20 minutes chrono, je suis loin....  

Alors la super histoire de labo sur la radioactivité:
 
Je faisais des tests de prolifération sur des cellules humaines.
Pour quantifier la division, je mesurais l'incorporation de 3H-Thymidine, que j'ajoutais 18h avant la mesure.
Toute la partie ou je manipulais la Thymidine se faisait dans la salle de radioactivité bien entendu.
 
Présentation de la salle de radioactivité:
Une porte, simple poignée que tout le monde utilisait avec ses gants contaminés bien entendu. (tu viens de la salle de culture avec tes gants  contaminés, et tu ressors sans enlever les gants que tu as utilisé dans la salle de radioactivité bien entendu... )  
Le meilleur est à venir...les outils de travail des agents d'entretien se trouve dans le sas d'entrée. Par conséquent, à chaque fois qu'ils viennent prendre le matériel, ils se contaminent, mais ça ne choque personne.
 
Alors j'en reviens à ma manip:
(Le même épisode c'est produit plusieur fois.)
Je vais pour ajouter la Thymidine dans le milieu.
Je prépare la hotte et les ustensiles, je commence le travail.
Au bout de quelques minutes, des cosmonautes arrivent:
"il faut pas rester là on va faire injecter de 131I à des rats..."
Moi:
"J'en ai pas pour longtemps, 2 minutes et j'ai terminé."
Ben nan, ils pouvaient pas attendre! Et vas-y que je te ramène l'iode etc.    
Moi je me magne de finir.
Ouf, je sors peu après qu'ils aient commencé.
ça c'est pas trop grave encore...    
 
quelques heures plus tard, une nana vient avec son directeur de recherche:
"C'est irradié jusque là!!!!" s'exclame-t-elle!
"Mais nan! Là c'est limite tu peux quand même utiliser la hotte (celle où je manipulais)"
Mon oeil...la salle était complètement irradiée, faut pas se foutre de la gueule du monde! (J'ai vérifié...)
 
Mais visiblement ça choque toujours personne...
 
Précisions:
1/ Ils ne préviennent pas quand ils font des manips dangereuses
2/ Ils commencent que tu sois là ou pas
3/ Ils te laissent manipuler dans des salles contaminées
4/ C'est franchement honteux de laisser les techniciens venir se faire pourrir la tronche par la radioactivité etc
Là je dis bravo!

Sympa.

Et ça c'est une anecdote...j'ai le même genre de truc avec le BET.
A la fin je devenais parano.
Les mecs qui cultivent sans gants,ceux qui touchent tout avec leurs gants contaminés...

On vit pas longtemps dans ce métier
C'est beau la science...

recentrons, recentrons.  
 
Je vous rappelle la thematique actuelle: virologie.

 
C'est un grand classique.  
 
Moi j'aime bien les gens qui font bouillir leur agarose avec le BET qu'est deja dedans  
 
plein de vapeur partout  

Histoire d'être didactiques (sans quoi ce sera effectivement une discussion de bistro labo), c'est quoi BET ? à part une variété de CON ?

 
Bromure d'Ethidium    
 
C'est un inter-calant de l'ADN qui reagit aux UV.
 
Donc tu visualises l'ADN dans tes gels d'agarose.
 
 
edit: accessoirement c'est evidemment un mutagene tres puissant  

Et c'est accessoirement un agent mutagène, donc c'est assez désagréable quand un type fait joujou avec en n'en foutant partout
 
Edit: boourdel! grillaid par l'edit...

z'ètes pas bavards sur la viro là...
EDIT: Est-ce qu'il existe une intégrase/transposase spécifique de site chez l'homme?

 
Moi je suis pas virologue    Faut appeler Svenn    
 
Sinon 2eme question, je pense pas, faudrait un retrotransposon, mais peut etre  

Parce qu'en définitive, le problème de la thérapie gènique utilisant les vecteurs viraux, c'est l'insertion.
Si on pouvait utiliser une intégrases spécifique ça devrais marcher.
Il me semble que certains phages s'intègrent en lysogènie de façon spécifique dans une séquence donnée.
Serait-il possible d'utiliser ce genre d'enzyme chez nous?
Que de question auxquelles je ne peux pas (encore) répondre...

 
Si on ne se limite pas a l'homme y a plein d'integrases site-specifique.
 
Le pbm reste pourtant le meme : avec ton phage comment tu integres d'abord la sequence reconnue dans le genome humain
 
C'est le pbm de l'oeuf et de la poule

 
du serpent qui se mort la queue

Je comprends pas ce que tu veux dire...

Ma question formulée différement:
L'intégration du gène d'intérêt ne peut-elle pas être réalisé avec d'autres enzymes que celles du virus?
Du genre tu modifies ton vecteur pour y intègrer un autre gène d'enzyme.

 
Le mecanisme quel qu'il soit reconnait une sequence specifique et fait son travail,    
 
Cette sequence n'est pas presente dans ton ADN, tu dois donc d'abord l'integrer, et comment ?  

Oui d'accord, mais vu la taille de notre gènome, on devrait bien trouver une séquence qui colle...(ou une enzyme qui colle avec une séquence présente chez nous)
Sans parler des séquences qui seront très proches, et qui pourraient éventuellement être utilisées dans une très faible proportion.
 
Et puis on arrive bien à améliorer des enzymes telles que la Taq etc.
Pourquoi on n'essairait pas de faire la même chose avec des intégrases spécifiques, pour modifier légèrement leur site de reconnaissance?

 
Ca c'est tres tres chaud   je me souviens avoir pose la meme question a un Prof quand j'etais a la fac.  
 
En gros etre capable de prevoir la structure  3D de la prot' pour qu'elle reconnaisse AATTGGCCGT (par ex) et ensuite calculer quels acides amines il faut mettre cote-a-cote pour que le repliment global fasse que tel ou tel residu se retrouvera pile poil ou il faut, c'est de la SF pour l'instant.
 
Mais je sais que des super-calculateur (aux US) tente le coup.

A la limite, il faudrait remplacer par des acides aminés proches, pour pas trop perturber le structure 3D.
En revanche je vois pas l'intérêt d'essayer de calculer quelque chose qu'il est extrêmement difficile de prévoir...du simple fait de la production d'un élément phagique chez l'homme.
Le plus astucieux ne serait-il pas de tenter des mutations ponctuelles d'AA et de tester les enzymes obtenues?
On est bien re-dans le sujet là?

 
Ouep' on est dans le sujet (Biologie structurale   )  
 
C'est un travail de fou   en revanche il existe deja une sorte de banque de donnees que sont les enzymes de restrictions ==> si tu ouvres le catalogues "England New Lab" tu pleures    
Des centaines de sequnces differentes sont reconnues et on connait la structure 3D de certaines de ces enzymes.  
 
DOnc je pense que certains labo doivent bosser la-dessus.
 
Par contre faire le meme raisonnement mais avec des composes plus simples, ca existe deja (l'anti-protease contre le HIV a ete produit de cette maniere) tu cristallise ta cible puis tu elabores quelle structure 3D pourrait interagir, ensuite tu synthetises le bazar