Reprise du message précédent :

 
C'est vrai qu'un labo suisse a court d'argent, ca me paraissait bizarre  

 
C'est peut-être une basse vengeance du service séquençage après que tu aies ralé avant-hier    
 
 

 
Un jour, il faudra qu'on pense à établir un classement des plus mauvaises excuses pour expliquer une absence de résulats    
 
Je propose d'ajouter
"C'est pas de ma faute, la room temperature était à 37°" (très utilisé depuis quelques jours   )

Ouais rigole mais c'est vraiment emmerdant quand tu veux faire une ligation à 16°C et que ton bain-marie chauffe comme une soupière...
 
Edit: sinon y en a une que j'ai beaucoup utilisée aussi c'est "J'y peux rien, c'est des anticorps Santa Cruz! "

 
"La viscosite du PEG a change le volume a pipeter    C'est pas ma faute si on a des pipet-man de merde   "

 
Je vois que quelque soit le sujet et quelque soit le labo, les problèmes sont partout les mêmes  

 
Curieusement, quand je vois tous mes cristaux fondre à cause de la chaleur après avoir mis des semaines à pousser, j'ai moins envie de rire  

 
 
Ca, c'est l'excuse qui cloue le bec a n'importe quel boss  

Une excuse de bioinformaticien:
"J'y peux rien si mes alignements foirent, ils ont séquencé le génome comme des porcs. "

 
Sauf que ca, c'est reel    
 
J'ai trouve 3 erreurs d'annotation en 40kb    
 
J'imagine a l'echelle d'un genome entier  

Je connais un génome où ils ont utilisé deux haplotypes....et ils ont fusionné le tout !
54'000 gènes, ça le fait. Le supra-génome.  

Dans news@nature hier:
 

 
http://www.nature.com/news/2006/06 [...] 724-5.html
 

 
A mon avis, ça sera encore bien pire à gérer parce que c'est une pollution silencieuse qui ne devient détectable que quand il est beaucoup trop tard pour faire quoique ce soit.

Joli papier dans PLoS Genetics d'hier qui montre silencing specifique (par siRNA) d'un allele qui differe du sauvage que d'une seule base.    
 
http://genetics.plosjournals.org/p [...] 020140.eor
 
Rappelons que ce journal est "open source"  

Ca veut dire qu'on peut modifier les articles comme on veut ?  

 
C'est pas sympa de troller sur les articles des autres

 
C'est une revue avec ou sans referee ?

 
Nan je me suis trompe, c'est "open bar"    
 
Tout le monde peut se servir  

 
Tu rigoles j'espere    
 
PLoS c'est voue a depasser Nature et Science d'ici qq annees    
 
Donc oui y'a des referees et c'est du gros calibre  

 
J'avoue que je ne la connais pas du tout    
 
disons qu'il y a des revues online sans referee, c'est pour ça que je posais la question  

 
PLoS Biology etait a 14.5 d'IF sa 1ere annee....
 
Maintenant y'a PLoS Genetics, Medecin, Genomic, etc  

C'est quoi ce topik Hotshot    

 
Ah oui, quand même    
 
Ca fait combien d'articles par semaine / mois ?

Pas tant que ca, c'est mensuel. Mais "mis a jour" quotidiennement avec le systeme de "early publication"
 
Les IF sont tres haut...

http://www.plos.org/journals/index.html

 
D'ailleurs, j'aimais bien la première version du sondage:
 
"Pour ou contre le string
1- Pour
2- Pour"
 
 

Oui bon c'était tab-powered

 
En fait, ce journal a occupé la niche écologique laissé libre par l"Embo qui a pas mal baissé depuis qu'il est associé à Nature

 
EMBO J s'est un peu tire une balle dans le pied avec EMBO Report  aussi  
 

 
Joli en effet    
 
Les pharamaceutiques peuvent louer le ciel qu'elles aient pas encore mis au point l'administration des siRNA, ça a permis de réaliser entre temps que les si sont pas tous "single-nucleotide specific" comme on pouvait lire dans les articles d'y a 2-3 ans et éviter 2-3 giga-procès par la même
 
En passant, j'aime bien le "The experiment using P17 was lost." de la légende de la fig.4. Ca arrive pas qu'à soi

Un papier assez important sortis il y a deux trois semaines dans Cell et qui m'avait échappé, heureusement que Nature a fait un "News and views" dessus ("Inside the cage", p360 du Nature d'aujourd'hui).  
Vous connaissez tous ce qui est à mon avis le plus grand ennemi du biologiste et la plus grande source de co***ries publiées, à savoir l'aggrégation des protéines. Cette aggrégation est souvent due à un mauvais repliement, mauvais repliement qui peut être réparé par des protéines spécialisées, les chaperonines. Les plus célèbres d'entre elles sont probablement GroEL et GroES, qui font une bonne partie du boulot chez E. Coli et qui sont donc à ce titre indispensables quand on veut exprimer une nouvelle protéine en Coli. SI GroEL-GroES arrivent à replier cette protéine, c'est gagné, sinon c'est perdu.
Ce complexe GroEL-GroES fonctionne comme un shaker : tu as une grande cavité dans laquelle tu mets la protéine, tu secoues, tu apportes plein d'ATP et à la fin, la protéine est repliée. Les auteurs ont réussi à "tuner" ce complexe pour modifier la taille de la cavité. Le résultat, ils obtiennent des "petites" cavités qui marchent mieux que la WT pour les petites protéines et des "grandes" cavités qui marchent mieux pour les grandes protéines que la WT.
Bref, des progrès en vue (et pas seulement en bactérie) pour tous ceux qui veulent exprimer des protéines hors de leur système d'origine    
 
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez [...] med_docsum

D'ailleurs, tant que j'y suis, j'en profite pour mentionner un article dans ce même numéro de Nature, sur les différentes façons de répondre à une épidémie de grippe aviaire et les effets attendus. Les grandes lignes de l'article sont très simples à comprendre même si on n'est pas du tout un spécialiste du domaine. Ca changera des informations de la presse "grand public", où on sent que les journalistes ne comprennent pas 10% de ce qu'ils écrivent    
 
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez [...] med_docsum

Delaÿte-moi ça vite fait

 
Ca me semble plus prudent, meme si je ne suis pas sur que ce topic soit modéré  

Tu fais chier, j'ai pas envie d'envoyer des MP à tout le monde  

Ben maÿrde, j'ai raté l'info... allez, faites pas les pédés, tfacon aucun modo passe jamais par ici...

Paraît que dans un autre univers, Hephaestos s'appelle Fastos    
 
Comprendra qui comprendra  

Ich bin Schnappi, das kleine Krokodil    
Komm aus Ägypten, das liegt direkt am Nil
Zuerst lag ich in einem Ei
dann schni-,schna-,schnappte ich mich frei

Damned, ya une validation de modo nécessaire, je peux pas (encore) accéder à l'autre univers...

Ca prend pas trop de temps  

Revenons a nos moutons    
 
Superbe papier dans Nature genetics d'auj avec le mapping d'un gene de susceptibilte au cancer du poumon chez la souris    
 
Rappelons que nous sommes face a une strategie de "forward genetic" tres compliquee pour les mammiferes, qui fait appelle aux SNP et aux differentes souches de labo    
 
http://www.nature.com/ng/journal/v [...] g1849.html

Bon, ben moi ça m'a pris 5 mn

 
Leur modo est pas connecté, c'est ça le problème