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Auteur Sujet :

[topik unique] Génétique, biologie moléculaire et structurale.

n°7798275
Profil sup​primé
Posté le 02-03-2006 à 18:59:36  answer
 

Reprise du message précédent :

Rasthor a écrit :

[:kzimir]
 
N'empêche, si vous saviez quel est mon rêve ultime, vous me traiteriez de gardien de camp nazi. [:cupra]


Vas-y balance, t'es suisse, t'as l'immunité diplomatique neutralité toussa

mood
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Posté le 02-03-2006 à 18:59:36  profilanswer
 

n°7798348
Rasthor
Posté le 02-03-2006 à 19:07:24  profilanswer
 


Mon rêve ultime serait un immense batiment, séparé en deux salles:
une salle avec une sorte de puits: on jette un organisme dedans (mort ou vif, peu importe. :o). Ensuite, cet organisme est automatiquement séparé en différents organes, tissus, etc... (enfin, dépend de sa diversification, une éponge sera différente d'un cheval). Chaque ADN de chaque tissus est ensuite extrait, de même que les ARN et les protéines. Une fois les extractions effectuées, tout ça est séquencés automatiquement et proprement et devient des données numériques (ATCG et les 20aa). Ces données numériques transitent ensuite dans l'autre salle, qui contient une multitude de super-computer, chargé d'une part d'assemblé le génome de façon propre et net, et d'autre part d'analyser le génome, d'en prédire les protéines, les promoteurs, les séquences non-codantes. Tout ça étant relié aux différentes bases du monde entier, style swissprot, pfam, interpro, etc, etc....
Et en fin de processus, on récupère les DVD contenant toutes ces données. [:dao]

n°7798356
bank
grin and bear
Posté le 02-03-2006 à 19:08:14  profilanswer
 
n°7798388
Rasthor
Posté le 02-03-2006 à 19:11:01  profilanswer
 


Je sais, c'est un peu trop utopiste. [:dao]

n°7798401
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 02-03-2006 à 19:12:02  profilanswer
 

RykM a écrit :

Ca va chier, je ferai mes PCR direct sur la souris vivante, allez hop, tout le monde dans la machine [:extazaille]


Le plus dure c'est de rentrer la souris dans le tube PCR. [:bap2703]


---------------
La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
n°7798433
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 02-03-2006 à 19:13:40  profilanswer
 

Rasthor a écrit :

Je sais, c'est un peu trop utopiste. [:dao]


:eek2:


---------------
La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
n°7798458
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 02-03-2006 à 19:15:46  profilanswer
 

NHam a écrit :

Le plus dure c'est de rentrer la souris dans le tube PCR. [:bap2703]


 
 
Nan nan, je referme la machine sur un bout de viande vivant avec qq coup de pipettes pour que ça rentre  [:dao]

n°7798461
Rasthor
Posté le 02-03-2006 à 19:16:02  profilanswer
 


On pourrait commencer par plus modeste, genre ne prendre que l'ADN et le séquencer (au lieu d'aller dans les tissus et les ARN).

n°7798479
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 02-03-2006 à 19:18:12  profilanswer
 

Rasthor a écrit :

On pourrait commencer par plus modeste, genre ne prendre que l'ADN et le séquencer (au lieu d'aller dans les tissus et les ARN).


Et on commencerait par un organisme Suisse? [:ddr555]

Message cité 1 fois
Message édité par NHam le 02-03-2006 à 19:18:30

---------------
La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
n°7798490
Rasthor
Posté le 02-03-2006 à 19:18:54  profilanswer
 

NHam a écrit :

Et on commencerait par un organisme Suisse? [:ddr555]


L'Edelweiss ?  :whistle:

mood
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Posté le 02-03-2006 à 19:18:54  profilanswer
 

n°7798499
Rasthor
Posté le 02-03-2006 à 19:20:12  profilanswer
 

N'empêche, une fois que ma méthode est au point, on pourra économiser de nombreuses vies animales qui auraient dues être sacrifiées par un séquençage comme fait actuellement. :D

n°7798531
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 02-03-2006 à 19:22:42  profilanswer
 

Rasthor a écrit :

N'empêche, une fois que ma méthode est au point, on pourra économiser de nombreuses vies animales qui auraient dues être sacrifiées par un séquençage comme fait actuellement. :D


Genre en prendre 1 pour en sauver des millier?
A la jurassik porc? [:carambar eloustic]


---------------
La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
n°7798587
Rasthor
Posté le 02-03-2006 à 19:28:06  profilanswer
 

NHam a écrit :

Genre en prendre 1 pour en sauver des millier?
A la jurassik porc? [:carambar eloustic]

[:thalis]


Message édité par Rasthor le 02-03-2006 à 19:28:16
n°7800172
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 02-03-2006 à 22:13:38  profilanswer
 

[:dracula]


---------------
La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
n°7803628
Profil sup​primé
Posté le 03-03-2006 à 11:12:14  answer
 

Rasthor a écrit :

Mon rêve ultime serait un immense batiment, séparé en deux salles:
une salle avec une sorte de puits: on jette un organisme dedans (mort ou vif, peu importe. :o). Ensuite, cet organisme est automatiquement séparé en différents organes, tissus, etc... (enfin, dépend de sa diversification, une éponge sera différente d'un cheval). Chaque ADN de chaque tissus est ensuite extrait, de même que les ARN et les protéines. Une fois les extractions effectuées, tout ça est séquencés automatiquement et proprement et devient des données numériques (ATCG et les 20aa). Ces données numériques transitent ensuite dans l'autre salle, qui contient une multitude de super-computer, chargé d'une part d'assemblé le génome de façon propre et net, et d'autre part d'analyser le génome, d'en prédire les protéines, les promoteurs, les séquences non-codantes. Tout ça étant relié aux différentes bases du monde entier, style swissprot, pfam, interpro, etc, etc....
Et en fin de processus, on récupère les DVD contenant toutes ces données. [:dao]


Bon.
Commence par apprendre le C++.

n°7803750
Rasthor
Posté le 03-03-2006 à 11:29:45  profilanswer
 

Je me suis mis au Python, c'est bieng. :jap:

n°7804918
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 03-03-2006 à 13:48:54  profilanswer
 

Rasthor a écrit :

Je me suis mis au Python, c'est bieng. :jap:


Le rebol c'est mieug. :jap:

Message cité 1 fois
Message édité par NHam le 03-03-2006 à 17:01:01

---------------
La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
n°7805050
Rasthor
Posté le 03-03-2006 à 14:02:45  profilanswer
 

NHam a écrit :

Le ribol c'est mieug. :jap:


Celui de Carl Sassenrath ? Sympa, mais on fait la même chose en python. [:cupra]
 
http://forum.hardware.fr/forum2.ph [...] page=1&p=1

n°7806844
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 03-03-2006 à 16:59:57  profilanswer
 

Rasthor a écrit :

Celui de Carl Sassenrath ? Sympa, mais on fait la même chose en python. [:cupra]
 
http://forum.hardware.fr/forum2.ph [...] page=1&p=1


J'en sais rien, je suis pas programmeur pour deux sous, alors je ne fait que colporter les choses qu'on me dit.
A savoir l'objet c'ets bien! :o


---------------
La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
n°7806852
Rasthor
Posté le 03-03-2006 à 17:00:45  profilanswer
 

NHam a écrit :

J'en sais rien, je suis pas programmeur pour deux sous, alors je ne fait que colporter les choses qu'on me dit.
A savoir l'objet c'ets bien! :o


Python est objet. [:dao]

n°7806860
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 03-03-2006 à 17:01:28  profilanswer
 

Rasthor a écrit :

Python est objet. [:dao]


Peut-être...j'en ai aucune idée. :o


---------------
La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
n°7806863
Profil sup​primé
Posté le 03-03-2006 à 17:01:40  answer
 

Rasthor a écrit :

Python est objet. [:dao]


Non ! Python est grand serpent qui serre fort fort :o

n°7806875
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 03-03-2006 à 17:02:26  profilanswer
 


Un gros calin? [:opus dei]


---------------
La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
n°7806914
Cardelitre
ಠ_ಠ ۞_۟۞ ┌( ಠ_ಠ)┘ סּ_סּ
Posté le 03-03-2006 à 17:05:38  profilanswer
 
n°7806938
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 03-03-2006 à 17:07:41  profilanswer
 
n°7806953
Cardelitre
ಠ_ಠ ۞_۟۞ ┌( ಠ_ಠ)┘ סּ_סּ
Posté le 03-03-2006 à 17:09:17  profilanswer
 

RykM a écrit :

Il a l'air de bien connaître la direction [:dao]


C'est parce que ça doit sentir le furet... [:rhetorie du chaos]

n°7806970
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 03-03-2006 à 17:11:40  profilanswer
 

RykM a écrit :

Il a l'air de bien connaître la direction [:dao]


Tu veux nous montrer ton gros serpent?

Cardelitre a écrit :

C'est parce que ça doit sentir le furet... [:rhetorie du chaos]


L'écureuil. [:aloy]
 

Spoiler :

C'est vendredÿ! [:ocolor]


Message édité par NHam le 03-03-2006 à 17:11:48

---------------
La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
n°7807463
Svenn
Posté le 03-03-2006 à 18:19:56  profilanswer
 

RykM a écrit :

Il a l'air de bien connaître la direction [:dao]


 
Normal, ça détecte les sources de chaleur, ces bestioles  :whistle:  

n°7807725
Svenn
Posté le 03-03-2006 à 18:44:18  profilanswer
 

Sinon, pour revenir aux choses sérieuses, il y a un article dans le Nature de cette semaine qui devrait faire exploser les scores en terme de nombre de citations : les auteurs ont mis au point une nouvelle technique de RMN qui permet d'étudier des protéines beaucoup plus grosses qu'auparavant. Avant la limite, c'était environ 200 résidus, leur méthode permet d'atteindre 400, soit le double. L'autre intérêt que je vois, c'est au niveau des petites protéines membranaires, dont la structure était infaisable par RMN auparavant (et quasiment infaisable par les autres méthodes), et qui deviennent accessibles. Il y a un paquet de structures de protéines essentielles qui pourraient sortir dans les années qui viennent grace à ce papier  :jap:  
 
Par contre, je dois avouer que si je comprends très bien l'intérêt de l'article, je n'ai pas compris grand chose au principe  :whistle:

n°7807796
Rasthor
Posté le 03-03-2006 à 18:50:26  profilanswer
 

Svenn a écrit :

Sinon, pour revenir aux choses sérieuses, il y a un article dans le Nature de cette semaine qui devrait faire exploser les scores en terme de nombre de citations : les auteurs ont mis au point une nouvelle technique de RMN qui permet d'étudier des protéines beaucoup plus grosses qu'auparavant. Avant la limite, c'était environ 200 résidus, leur méthode permet d'atteindre 400, soit le double. L'autre intérêt que je vois, c'est au niveau des petites protéines membranaires, dont la structure était infaisable par RMN auparavant (et quasiment infaisable par les autres méthodes), et qui deviennent accessibles. Il y a un paquet de structures de protéines essentielles qui pourraient sortir dans les années qui viennent grace à ce papier  :jap:


Kurt Wuthrich n'avait justement pas eu le prix Nobel pour ça ? :??:

n°7807807
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 03-03-2006 à 18:51:29  profilanswer
 

Svenn a écrit :

Sinon, pour revenir aux choses sérieuses, il y a un article dans le Nature de cette semaine qui devrait faire exploser les scores en terme de nombre de citations : les auteurs ont mis au point une nouvelle technique de RMN qui permet d'étudier des protéines beaucoup plus grosses qu'auparavant. Avant la limite, c'était environ 200 résidus, leur méthode permet d'atteindre 400, soit le double. L'autre intérêt que je vois, c'est au niveau des petites protéines membranaires, dont la structure était infaisable par RMN auparavant (et quasiment infaisable par les autres méthodes), et qui deviennent accessibles. Il y a un paquet de structures de protéines essentielles qui pourraient sortir dans les années qui viennent grace à ce papier  :jap:  
 
Par contre, je dois avouer que si je comprends très bien l'intérêt de l'article, je n'ai pas compris grand chose au principe  :whistle:


Y'aurai moyen de récupérer ça?  [:gilbert gosseyn]


---------------
La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
n°7807821
Svenn
Posté le 03-03-2006 à 18:52:08  profilanswer
 

Rasthor a écrit :

Kurt Wuthrich n'avait justement pas eu le prix Nobel pour ça ? :??:


 
Disons qu'on doit en être à moins d'une dizaine de protéines membranaires résolues par RMN et qu'avant ce papier, la quasi-totalité d'entre elles étaient infaisables. Ce papier ouvre le champ à beaucoup de nouvelles protéines  ;)  

n°7807848
Svenn
Posté le 03-03-2006 à 18:54:13  profilanswer
 

NHam a écrit :

Y'aurai moyen de récupérer ça?  [:gilbert gosseyn]


 
Si, donne-moi ton adresse mail en MP  ;)  

n°7807882
Rasthor
Posté le 03-03-2006 à 18:57:07  profilanswer
 

Communiqué de presse: Le Prix Nobel de Chimie 2002
 
le 9 octobre 2002
 
L'Académie Royale des Sciences de Suède a décidé d'attribuer le Prix Nobel de Chimie de l'année 2002 pour
 
”le développement de méthodes d’identification et d’analyse structurale de macromolécules biologiques”,
 
pour moitié collectivement à
 
John B. Fenn
Virginia Commonwealth University, Richmond, USA,
 
et à
 
Koichi Tanaka
Shimadzu Corp., Kyoto, Japon
 
”pour le développement de méthodes de désorption-ionisation douces pour l’analyse par spectrométrie de masse des macromolécules biologiques”
 
et pour l’autre moitié à
 
Kurt Wüthrich
École Polytechnique Fédérale (EPF) de Zurich, Suisse, et The Scripps Research Institute, La Jolla, USA
 
”pour le développement de la spectroscopie par résonance magnétique nucléaire pour l’identification de la structure tridimensionnelle des macromolécules en solution”.
 
Ah oui, c'est pas pareil. :D
 

n°7807913
Svenn
Posté le 03-03-2006 à 19:01:30  profilanswer
 

Rasthor a écrit :

Communiqué de presse: Le Prix Nobel de Chimie 2002
 
le 9 octobre 2002
 
L'Académie Royale des Sciences de Suède a décidé d'attribuer le Prix Nobel de Chimie de l'année 2002 pour
 
”le développement de méthodes d’identification et d’analyse structurale de macromolécules biologiques”,
 
pour moitié collectivement à
 
John B. Fenn
Virginia Commonwealth University, Richmond, USA,
 
et à
 
Koichi Tanaka
Shimadzu Corp., Kyoto, Japon
 
”pour le développement de méthodes de désorption-ionisation douces pour l’analyse par spectrométrie de masse des macromolécules biologiques”
 
et pour l’autre moitié à
 
Kurt Wüthrich
École Polytechnique Fédérale (EPF) de Zurich, Suisse, et The Scripps Research Institute, La Jolla, USA
 
”pour le développement de la spectroscopie par résonance magnétique nucléaire pour l’identification de la structure tridimensionnelle des macromolécules en solution”.
 
Ah oui, c'est pas pareil. :D


 
Le problème des protéines membranaires, c'est qu'il faut les solubiliser par un détergent. En RMN, on a donc le signal de la protéine qui se superpose au signal du détergent. Au minimum, le détergent "correspond à environ 100 résidus", sachant qu'il ne faut pas dépasser 200 au total. D'où l'intérêt de pousser la limite à 400  ;)

n°7807934
Rasthor
Posté le 03-03-2006 à 19:04:02  profilanswer
 

C'est cool en tout cas. Chaque protéine résolue donne un modèle pour mes prédictions par homologie. :D

n°7808061
Rasthor
Posté le 03-03-2006 à 19:15:55  profilanswer
 

http://forum.hardware.fr/forum2.ph [...] 0#t7808036
 
Merde. :sweat:
Mais la Science a un vrai soucis de communication ou bien ? :??:

n°7808214
thermoclin​e
Geek intelligent
Posté le 03-03-2006 à 19:30:36  profilanswer
 

Bah, en meme temps tu cherches a lui enseigner les sciences a coup de tractopelles sur un debat dit limite vu qu'il ouvre sur des questions philosophiques non resolues.

n°7812797
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 04-03-2006 à 11:18:57  profilanswer
 

c'est moi ou le topic a été supprimé? [:ienchangel]


---------------
La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
n°7812862
Rasthor
Posté le 04-03-2006 à 11:31:50  profilanswer
 

NHam a écrit :

c'est moi ou le topic a été supprimé? [:ienchangel]


QUel topic ???

n°7813354
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 04-03-2006 à 13:01:00  profilanswer
 

Rasthor a écrit :

QUel topic ???


Celui-là:
http://forum.hardware.fr/forum2.ph [...] 0#t7808036  
ça me dirige sur le truc de la peine de mort et puis ça me jète. :/


Message édité par NHam le 04-03-2006 à 13:01:08

---------------
La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
mood
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