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Auteur Sujet :

[topik unique] Génétique, biologie moléculaire et structurale.

n°6172559
scholl is ​back
Rien ne lave plus à fond ...
Posté le 25-07-2005 à 12:41:27  profilanswer
 

Reprise du message précédent :
Bon, j'ai toujours pas réussi à avoir quelque chose de correct. J'ai une autre question. Pensez vous que une culture post electroporation sans antibios (j'utilise peni/strepto) peut influencer?? Style les pc12 avec des trous dans la membrane n'aiment pas les antibios :D  (notemment la streptomycine).


---------------
... que le bore en fusion :D
mood
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Posté le 25-07-2005 à 12:41:27  profilanswer
 

n°6174656
Profil sup​primé
Posté le 25-07-2005 à 17:37:58  answer
 

Hephaestos > OK :jap:

n°6174982
Svenn
Posté le 25-07-2005 à 18:31:09  profilanswer
 

scholl is back a écrit :

Bon, j'ai toujours pas réussi à avoir quelque chose de correct. J'ai une autre question. Pensez vous que une culture post electroporation sans antibios (j'utilise peni/strepto) peut influencer?? Style les pc12 avec des trous dans la membrane n'aiment pas les antibios :D  (notemment la streptomycine).


 
Les antibiotiques n'ont aucune raison de faire du mal à des cellules de rats, donc je ne pense pas que le problème vienne de là. Tu utilises quoi comme approche pour savoir si la transfection a marché ? (par exemple, marquage GFP, recherche de la protéine synthétisée en WB, ...)

n°6179150
scholl is ​back
Rien ne lave plus à fond ...
Posté le 26-07-2005 à 10:27:51  profilanswer
 

Svenn a écrit :

Les antibiotiques n'ont aucune raison de faire du mal à des cellules de rats, donc je ne pense pas que le problème vienne de là. Tu utilises quoi comme approche pour savoir si la transfection a marché ? (par exemple, marquage GFP, recherche de la protéine synthétisée en WB, ...)


 
Je fais des lames + recherche de la protéine synthétisée en WB. Sachant que ma protéine est couplée flag. Pour les lames je fais un double marquage avec un DAPI. Dans quelques expériences j'ai eu de belles bandes (mais évidemment avec très peu de protéines récupérées). Ma protéine est cytosolique et fait 37 kDa.  
 
J'ai une nouvelle piste et je suis en train de fouiller du coté de l'extraction protéique.. De plus je fais une lipofection cet après midi... (j'ai convaincu mon patron que si il en avait acheté ce n'était pas pour la regarder... :D)
 


---------------
... que le bore en fusion :D
n°6179344
Svenn
Posté le 26-07-2005 à 10:59:11  profilanswer
 

scholl is back a écrit :

Je fais des lames + recherche de la protéine synthétisée en WB. Sachant que ma protéine est couplée flag. Pour les lames je fais un double marquage avec un DAPI. Dans quelques expériences j'ai eu de belles bandes (mais évidemment avec très peu de protéines récupérées). Ma protéine est cytosolique et fait 37 kDa.  
 
J'ai une nouvelle piste et je suis en train de fouiller du coté de l'extraction protéique.. De plus je fais une lipofection cet après midi... (j'ai convaincu mon patron que si il en avait acheté ce n'était pas pour la regarder... :D)


 
Dans ce cas, une possibilité, c'est que le problème vienne de la protéine plutôt que de la transfection elle-même. Est-ce que ta protéine pourrait par exemple être difficile à replier ? Est-ce que tu arrives à produire ta protéine de façon satisfaisante dans un autre système (pas forcément en tranfection)?  Si ta protéine est naturellement présente en très faible quantité dans une cellule, elle pourrait très bien s'aggréger ou se dégrader quand tu la produis de façon plus intense. Cela pourrait notamment être le cas si ta protéine est naturellement associée à un cofacteur (autre protéine ou petite molécule) qui pourrait jouer un rôle de cofacteur. Cela est également souvent le cas quand ces protéines ont des régions peu ou pas repliées. A la louche, je dirais un domaine d'au moins 15 résidus très riche en G,S,D,E,T,P  
 
Une autre possibilité, c'est que ta protéine soit toxique et qu'elle tue les cellules dans lesquelles elle est produite.

n°6179638
scholl is ​back
Rien ne lave plus à fond ...
Posté le 26-07-2005 à 11:36:20  profilanswer
 

Svenn a écrit :

Dans ce cas, une possibilité, c'est que le problème vienne de la protéine plutôt que de la transfection elle-même. Est-ce que ta protéine pourrait par exemple être difficile à replier ? Est-ce que tu arrives à produire ta protéine de façon satisfaisante dans un autre système (pas forcément en tranfection)?  Si ta protéine est naturellement présente en très faible quantité dans une cellule, elle pourrait très bien s'aggréger ou se dégrader quand tu la produis de façon plus intense. Cela pourrait notamment être le cas si ta protéine est naturellement associée à un cofacteur (autre protéine ou petite molécule) qui pourrait jouer un rôle de cofacteur. Cela est également souvent le cas quand ces protéines ont des régions peu ou pas repliées. A la louche, je dirais un domaine d'au moins 15 résidus très riche en G,S,D,E,T,P  

Une autre possibilité, c'est que ta protéine soit toxique et qu'elle tue les cellules dans lesquelles elle est produite
.


 
Je dirais plutot ca en fait, vu la tronche des cellules 24h et 40h après transfection.
Sinon, ma protéine est juste un "bout" de protéine qui n'est pas censée être associée à un cofacteur. Il n'y a pas d'endogène. Elle possède deux domaines coil-coil et je ne sais pas si c'est difficile à plier ou pas.


---------------
... que le bore en fusion :D
n°6179699
Svenn
Posté le 26-07-2005 à 11:45:21  profilanswer
 

scholl is back a écrit :

Je dirais plutot ca en fait, vu la tronche des cellules 24h et 40h après transfection.
Sinon, ma protéine est juste un "bout" de protéine qui n'est pas censée être associée à un cofacteur. Il n'y a pas d'endogène. Elle possède deux domaines coil-coil et je ne sais pas si c'est difficile à plier ou pas.


 
En général, les domaines coiled-coil, ça se replie assez bien, mais chaque protéine est un cas particulier.
 
Sinon, d'après ce que tu me dis, je pense aussi qu'il s'agit d'un problème de protéine toxique pour ta cellule et que la transfection se fait correctement. La meilleure chose à faire serait de placer le gène codant pour ta protéine sous le contrôle d'un promoteur inductible. Cela te permettrait de produire ta protéine au dernier moment et de limiter l'effet sur les cellules.

n°6179802
Cardelitre
ಠ_ಠ ۞_۟۞ ┌( ಠ_ಠ)┘ סּ_סּ
Posté le 26-07-2005 à 11:57:11  profilanswer
 

Svenn a écrit :

La meilleure chose à faire serait de placer le gène codant pour ta protéine sous le contrôle d'un promoteur inductible. Cela te permettrait de produire ta protéine au dernier moment et de limiter l'effet sur les cellules.


Les lentiviral vectors de chez D. Trono sont particulièrement pratique pour ça si jamais...
 
http://tronolab.com/lentivectors.php


Message édité par Cardelitre le 26-07-2005 à 11:57:40
n°6179848
scholl is ​back
Rien ne lave plus à fond ...
Posté le 26-07-2005 à 12:01:50  profilanswer
 

Svenn a écrit :

En général, les domaines coiled-coil, ça se replie assez bien, mais chaque protéine est un cas particulier.
 
Sinon, d'après ce que tu me dis, je pense aussi qu'il s'agit d'un problème de protéine toxique pour ta cellule et que la transfection se fait correctement. La meilleure chose à faire serait de placer le gène codant pour ta protéine sous le contrôle d'un promoteur inductible. Cela te permettrait de produire ta protéine au dernier moment et de limiter l'effet sur les cellules.


 
 :jap: Clair que ca serait bien, limite faire une lignée... Mais je préfère garder ca en dernier recours vu qu'après on en aura plus besoin. Enfin bon je vais essayer de magouiller, je te tient au courant.  ;)  
 
Cardelitre--> c'est une pub ton post? :whistle:


---------------
... que le bore en fusion :D
n°6179912
Cardelitre
ಠ_ಠ ۞_۟۞ ┌( ಠ_ಠ)┘ סּ_סּ
Posté le 26-07-2005 à 12:10:24  profilanswer
 

scholl is back a écrit :


Cardelitre--> c'est une pub ton post? :whistle:


Meuh non... C'est un bon plan [:eraser17]

mood
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Posté le 26-07-2005 à 12:10:24  profilanswer
 

n°6180983
Hephaestos
Sanctis Recorda, Sanctis deus.
Posté le 26-07-2005 à 14:34:40  profilanswer
 

Ah, enfin un sujet on-topic à propos duquel je puisse converser normalement :
 
Les équipes de recherche française sont autorisées à faire de la recherche.
 
joie.
 
Vous avez plus qu'à prendre le train en route et à montrer aux coréens que c'est pas 5 ans de retard qui vous font peur !
 
http://www.lemonde.fr/web/article/ [...] 756,0.html

n°6181108
Cardelitre
ಠ_ಠ ۞_۟۞ ┌( ಠ_ಠ)┘ סּ_סּ
Posté le 26-07-2005 à 14:48:16  profilanswer
 

Hephaestos a écrit :

Ah, enfin un sujet on-topic à propos duquel je puisse converser normalement :
 
Les équipes de recherche française sont autorisées à faire de la recherche.
 
joie.
 
Vous avez plus qu'à prendre le train en route et à montrer aux coréens que c'est pas 5 ans de retard qui vous font peur !
 
http://www.lemonde.fr/web/article/ [...] 756,0.html


C'est vrai que les coréens s'en donnent à coeur joie avec les cellules souches depuis quelques temps... Ils sont sacrément moins emmerdés avec les questions éthiques visiblement. :ange:

n°6181194
scholl is ​back
Rien ne lave plus à fond ...
Posté le 26-07-2005 à 14:57:33  profilanswer
 

Cardelitre a écrit :

C'est vrai que les coréens s'en donnent à coeur joie avec les cellules souches depuis quelques temps... Ils sont sacrément moins emmerdés avec les questions éthiques visiblement. :ange:


 
C'est koi un coréen?? skoi l'éthique?? :??:  :??:  
 
Plus sérieusement, eh be, c'est pas trop tôt!


---------------
... que le bore en fusion :D
n°6181208
Cardelitre
ಠ_ಠ ۞_۟۞ ┌( ಠ_ಠ)┘ סּ_סּ
Posté le 26-07-2005 à 14:59:42  profilanswer
 

scholl is back a écrit :

C'est koi un coréen?? skoi l'éthique?? :??:  :??:  
 
Plus sérieusement, eh be, c'est pas trop tôt!


S'clair. Faut pas se leurer, de toute façon quelqu'un aurait fini par le faire, et vu le potentiel du domaine, c'est con que ça soit eux d'abord...  :whistle:

n°6181491
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 26-07-2005 à 15:33:25  profilanswer
 

Cardelitre a écrit :

S'clair. Faut pas se leurer, de toute façon quelqu'un aurait fini par le faire, et vu le potentiel du domaine, c'est con que ça soit eux d'abord...  :whistle:


 
 
Y'a pas qu'eux, aux UK ça n'a jamais été interdit... [:dao]


---------------
Chacun pense ce qu'il veut... moi je veux ce que je pense
n°6181604
Svenn
Posté le 26-07-2005 à 15:48:16  profilanswer
 

Hephaestos a écrit :

Ah, enfin un sujet on-topic à propos duquel je puisse converser normalement :
 
Les équipes de recherche française sont autorisées à faire de la recherche.
 
joie.
 
Vous avez plus qu'à prendre le train en route et à montrer aux coréens que c'est pas 5 ans de retard qui vous font peur !
 
http://www.lemonde.fr/web/article/ [...] 756,0.html


 
Etre autorisé à faire de la recherche sur les cellules souches, ça veut pas forcément dire que les équipes concernées auront les moyens de travailler. Wait and see  ;)

n°6181619
Cardelitre
ಠ_ಠ ۞_۟۞ ┌( ಠ_ಠ)┘ סּ_סּ
Posté le 26-07-2005 à 15:50:01  profilanswer
 

RykM a écrit :

Y'a pas qu'eux, aux UK ça n'a jamais été interdit... [:dao]


Et maintenant en Suisse, on a voté pour... [:dao]
Sont bien mes petits compatriotes. :bounce:

n°6182353
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 26-07-2005 à 17:17:36  profilanswer
 

Ah putain y'a un "early publication" dans Science sur les télomères et j'ai pas les codes  :fou:  
 
Pourtant je suis au labo, je comprends pas [:atog]


---------------
Chacun pense ce qu'il veut... moi je veux ce que je pense
n°6182378
Svenn
Posté le 26-07-2005 à 17:21:16  profilanswer
 

RykM a écrit :

Ah putain y'a un "early publication" dans Science sur les télomères et j'ai pas les codes  :fou:  
 
Pourtant je suis au labo, je comprends pas [:atog]


 
Tu peux donner les références, je vais voir si on peut l'avoir d'ici.

n°6182390
Cardelitre
ಠ_ಠ ۞_۟۞ ┌( ಠ_ಠ)┘ סּ_סּ
Posté le 26-07-2005 à 17:23:15  profilanswer
 

Celui là?
 

Citation :

Effects of Telomerase and Telomere Length on Epidermal Stem Cell Behavior
Ignacio Flores, María L. Cayuela, María A. Blasco*
 
A key process in organ homeostasis is the mobilization of
stem cells out of their niches. We show through analysis of
mouse models that telomere length, as well as the catalytic
component of telomerase, Tert, are critical determinants
in the mobilization of epidermal stem cells. Telomere
shortening inhibited mobilization of stem cells out of their
niche, impaired hair growth, and resulted in suppression
of stem cell proliferative capacity in vitro. In contrast,
Tert overexpression in the absence of changes in telomere
length promoted stem cell mobilization, hair growth, and
stem cell proliferation in vitro. The effects of telomeres
and telomerase on stem cell biology anticipate their role in
cancer and aging.


Message édité par Cardelitre le 26-07-2005 à 17:23:44
n°6182548
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 26-07-2005 à 17:48:30  profilanswer
 

Cardelitre a écrit :

Celui là?
 

Citation :

Effects of Telomerase and Telomere Length on Epidermal Stem Cell Behavior
Ignacio Flores, María L. Cayuela, María A. Blasco*
 
A key process in organ homeostasis is the mobilization of
stem cells out of their niches. We show through analysis of
mouse models that telomere length, as well as the catalytic
component of telomerase, Tert, are critical determinants
in the mobilization of epidermal stem cells. Telomere
shortening inhibited mobilization of stem cells out of their
niche, impaired hair growth, and resulted in suppression
of stem cell proliferative capacity in vitro. In contrast,
Tert overexpression in the absence of changes in telomere
length promoted stem cell mobilization, hair growth, and
stem cell proliferation in vitro. The effects of telomeres
and telomerase on stem cell biology anticipate their role in
cancer and aging.



 
 
Ouais c'est celui-la, apparamment c'est de la bombe atomique  [:huit]


---------------
Chacun pense ce qu'il veut... moi je veux ce que je pense
n°6182549
Profil sup​primé
Posté le 26-07-2005 à 17:48:41  answer
 

Cool, on va reparler de l'immortalité [:boidleau]
Enfin si c'est que la peau... nos cadavres conserveront un joli teint de pèche ad mortem aeternam, whééé.


Message édité par Profil supprimé le 26-07-2005 à 17:49:31
n°6182620
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 26-07-2005 à 18:01:00  profilanswer
 

Sur-expression de la télomérase in vivo et pas l'ombre d'une tumeur  [:xx_xx]  
 
Je veux voir l'artcle !![:e-te]


---------------
Chacun pense ce qu'il veut... moi je veux ce que je pense
n°6183123
scholl is ​back
Rien ne lave plus à fond ...
Posté le 26-07-2005 à 19:35:59  profilanswer
 

Cardelitre a écrit :

Celui là?
 

Citation :

Effects of Telomerase and Telomere Length on Epidermal Stem Cell Behavior
Ignacio Flores, María L. Cayuela, María A. Blasco*
 
A key process in organ homeostasis is the mobilization of
stem cells out of their niches. We show through analysis of
mouse models that telomere length, as well as the catalytic
component of telomerase, Tert, are critical determinants
in the mobilization of epidermal stem cells. Telomere
shortening inhibited mobilization of stem cells out of their
niche, impaired hair growth, and resulted in suppression
of stem cell proliferative capacity in vitro. In contrast,
Tert overexpression in the absence of changes in telomere
length promoted stem cell mobilization, hair growth, and
stem cell proliferation in vitro. The effects of telomeres
and telomerase on stem cell biology anticipate their role in
cancer and aging.



 
 
Putain ils vont faire fortune avec un un truc pareil!!!  :whistle:  
 
Bon,j'essaye demain au boulot.


---------------
... que le bore en fusion :D
n°6185433
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 27-07-2005 à 00:47:12  profilanswer
 

Personne pour m'envoyer l'article en pdf ?  :D


---------------
Chacun pense ce qu'il veut... moi je veux ce que je pense
n°6185455
Profil sup​primé
Posté le 27-07-2005 à 00:50:55  answer
 

cay ici le nouveau topic gsnalf ? :o

n°6185488
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 27-07-2005 à 00:57:50  profilanswer
 

Absolument pas  [:dao]  
 
Ici, on est sérieux  [:cosmoschtroumpf]


---------------
Chacun pense ce qu'il veut... moi je veux ce que je pense
n°6185510
Svenn
Posté le 27-07-2005 à 01:00:57  profilanswer
 

RykM a écrit :

Personne pour m'envoyer l'article en pdf ?  :D


 
MP  :o

n°6185894
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 27-07-2005 à 01:45:36  profilanswer
 

Merci Svenn  :D  
 
J'ai jamais lu un article aussi court  [:xx_xx]  
 
Jolies manip', mais y manque un paquet de contrôles  [:dao]  
 
Ils ont dû se faire taper sur les doigts par les referees, j'imagine que c'est pour cette raison que l'article est si court... on reste sur notre fin/faim  :p


---------------
Chacun pense ce qu'il veut... moi je veux ce que je pense
n°6196232
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 28-07-2005 à 10:22:08  profilanswer
 

Vous connaisez l'histoire du mec qui a ramené 25L de bières belges dans son sac à dos? [:opus dei]
Et ben il a besoin d'un massage!  [:dao]


---------------
La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
n°6231035
clementdou​sset
Posté le 02-08-2005 à 13:29:45  profilanswer
 

                             Salut,
 
Suis à la recherche d'études sur l'organisation neuronale du nématode.
Si vous pouviez m'aider.
Merci

n°6231136
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 02-08-2005 à 13:43:55  profilanswer
 

clementdousset a écrit :

Salut,
 
Suis à la recherche d'études sur l'organisation neuronale du nématode.
Si vous pouviez m'aider.
Merci


 
Lequel ?  [:dao]  
 
http://www.wormbase.org/
 
Le linéage cellulaire est décrit de manière exhaustive chez C.elegans, tu devrais pouvoir trouver quelques reviews ici: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi


---------------
Chacun pense ce qu'il veut... moi je veux ce que je pense
n°6231145
Hephaestos
Sanctis Recorda, Sanctis deus.
Posté le 02-08-2005 à 13:45:00  profilanswer
 

clementdousset a écrit :

Salut,
 
Suis à la recherche d'études sur l'organisation neuronale du nématode.
Si vous pouviez m'aider.
Merci


 
Ah oui, ce que j'ai oublié de vous préciser, mais vous l'avez peut-être remarqué au cours de votre première recherche : le petit nom de la bestiole en question, qui est une espèce de nématode, c'est Caenorhabditis elegans.
 
Vous avez une revue relativement récente qui parle de la chose, disponible ici : http://arjournals.annualreviews.or [...] Code=neuro
 
Envoyez moi un PM si vous voulez l'article complet.

n°6231292
Hephaestos
Sanctis Recorda, Sanctis deus.
Posté le 02-08-2005 à 13:57:49  profilanswer
 

RykM a écrit :

Lequel ?  [:dao]  
 
http://www.wormbase.org/
 
Le linéage cellulaire est décrit de manière exhaustive chez C.elegans, tu devrais pouvoir trouver quelques reviews ici: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi


 
Tien, ça me fait penser que je voulais créer un topic depuis quelques temps à ce sujet, alors voila :
 
http://forum.hardware.fr/hardwaref [...] 7426-1.htm

n°6231365
scholl is ​back
Rien ne lave plus à fond ...
Posté le 02-08-2005 à 14:04:20  profilanswer
 

Perso je fait mes recherches avec pubmed et google tout court. :D  
 
Sinon, pour mes transfections, je suis passé à la lipofectamine, ben ya pas photo, j'ai un rendement de récupération de ma protéine 10 fois supérieur aux electroporations... :sol:  
 
Problème résolu.


---------------
... que le bore en fusion :D
n°6231935
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 02-08-2005 à 15:00:58  profilanswer
 

scholl is back a écrit :

Perso je fait mes recherches avec pubmed et google tout court. :D  
 
Sinon, pour mes transfections, je suis passé à la lipofectamine, ben ya pas photo, j'ai un rendement de récupération de ma protéine 10 fois supérieur aux electroporations... :sol:  
 
Problème résolu.


 
Lipofectamines c'est qu'on essaye en 1er généralement  :whistle:


---------------
Chacun pense ce qu'il veut... moi je veux ce que je pense
n°6232039
scholl is ​back
Rien ne lave plus à fond ...
Posté le 02-08-2005 à 15:15:50  profilanswer
 

RykM a écrit :

Lipofectamines c'est qu'on essaye en 1er généralement  :whistle:


 
voui, je suis d'accord, mais le but était de réussir à electroporer correctement... Pour éviter d'utiliser la lipofectamine qui coute très cher. (Putain de labo fauché  :whistle: )
 
Chez les cellules COS par exemple, on electropore très bien avec de meilleurs résultats que pour la lipofectamine. ca dépend des cellules, stou :D


---------------
... que le bore en fusion :D
n°6246933
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 04-08-2005 à 15:06:09  profilanswer
 

Clonage d'un chien par une equipe coreenne, dans Nature aujourd'hui... [:dao]  
 
http://www.nature.com/nature/journ [...] 6641a.html
 
 
edit: c'est une 1ere mondiale of course   :sol:


Message édité par RykM le 04-08-2005 à 15:06:51
n°6247050
Profil sup​primé
Posté le 04-08-2005 à 15:17:30  answer
 

Super... on va avoir quelques millions de 'première mondiale' si ça continue... premier clonage d'un renard, premier clonage d'un loup, premier clonage d'un coyote, premier clonage d'un dingo, premier clonage d'un teckel, premier clonage d'un fox-terrier... [:kiki] :D

n°6247602
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 04-08-2005 à 16:41:25  profilanswer
 

T'es vraiment lourd quand tu t'y mets  [:huit]  
 
Le chien restait une espece compliquee a cloner pour plusieurs raisons... reste plus qu'a esperer qu'on n'arrive jamais a percer le mystere du clonage de l'espece paulus benjanus  [:cosmoschtroumpf]  


---------------
Chacun pense ce qu'il veut... moi je veux ce que je pense
n°6247712
Profil sup​primé
Posté le 04-08-2005 à 17:01:04  answer
 

RykM a écrit :

T'es vraiment lourd quand tu t'y mets  [:huit]  
 
Le chien restait une espece compliquee a cloner pour plusieurs raisons... reste plus qu'a esperer qu'on n'arrive jamais a percer le mystere du clonage de l'espece paulus benjanus  [:cosmoschtroumpf]


Pas besoin, je sais me reproduire par mes propres moyens [:draculax]
(pas toi ? :o)

mood
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