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Auteur Sujet :

[topik unique] Génétique, biologie moléculaire et structurale.

n°4925907
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 24-02-2005 à 15:18:31  profilanswer
 

Reprise du message précédent :

Rasthor a écrit :

Et moi je suis là. [:dao]


 
[:lox]


---------------
Chacun pense ce qu'il veut... moi je veux ce que je pense
mood
Publicité
Posté le 24-02-2005 à 15:18:31  profilanswer
 

n°4926142
bank
grin and bear
Posté le 24-02-2005 à 15:40:53  profilanswer
 

RykM a écrit :

RT-PCR quanti aujourd'hui  [:dao]  
 
La manip' a 1000 euros  [:w3c compliant]


 
[:totoz]
 
Sybr ou probe? :o

n°4926177
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 24-02-2005 à 15:43:48  profilanswer
 

bank a écrit :

[:totoz]
 
Sybr ou probe? :o


 
Clontech pour le kit RT
 
et Roche pour la PCR quanti  [:dao]  
 
Avec le nombre d'echantillons que j'ai, ca va douiller   [:huit]


---------------
Chacun pense ce qu'il veut... moi je veux ce que je pense
n°4926372
Cardelitre
ಠ_ಠ ۞_۟۞ ┌( ಠ_ಠ)┘ סּ_סּ
Posté le 24-02-2005 à 16:03:19  profilanswer
 

Ca fait vite cher la RT suivant le type de sondes utilisées... :sweat:

n°4926810
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 24-02-2005 à 16:51:00  profilanswer
 

RykM a écrit :

Sigma  [:dao]


[:neo_xp]
Ils en ont en poudre et cest de la méthémoglobine.
C'est pour ça que ça me fait chier pour la spectro.
Donc j'en cherche en solution... :/


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La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
n°4927041
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 24-02-2005 à 17:09:33  profilanswer
 

NHam a écrit :

[:neo_xp]
Ils en ont en poudre et cest de la méthémoglobine.
C'est pour ça que ça me fait chier pour la spectro.
Donc j'en cherche en solution... :/


 
T'as qu'a la prelever sur toi  [:dao]  
 
Et Merck, t'as regarde ?  :p


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Chacun pense ce qu'il veut... moi je veux ce que je pense
n°4927121
bank
grin and bear
Posté le 24-02-2005 à 17:18:46  profilanswer
 

Cardelitre a écrit :

Ca fait vite cher la RT suivant le type de sondes utilisées... :sweat:


 
Les probes c'est pour les fillettes qui savent pas designer des primers :o
 
Bon le sybr, c'est bien cher aussi [:joce]

n°4934290
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 25-02-2005 à 13:42:27  profilanswer
 

RykM a écrit :

T'as qu'a la prelever sur toi  [:dao]  
 
Et Merck, t'as regarde ?  :p


Ouai, mais ils n'en vendent pas. :/
Pas grave je ferai une mesure d'absorbace à 430 nm. [:mrbrelle]


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La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
n°4934412
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 25-02-2005 à 13:54:20  profilanswer
 

Les prot' c'est pas plutot 280 ?  [:figti]


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Chacun pense ce qu'il veut... moi je veux ce que je pense
n°4934456
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 25-02-2005 à 13:57:31  profilanswer
 

Oui mais l'hémoglobine c'est 577 nm spé, et à 460 nm une grosse bande d'absorption plus ou moins commune à l'hémoglobine et la méthémoglobine.
http://www.snv.jussieu.fr/bmedia/ATP/spechbr.htm
Enfin il me semble.
Va juste falloir que je trouve le point isobestique Hémo/méthémo. [:atlantis]


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La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
mood
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Posté le 25-02-2005 à 13:57:31  profilanswer
 

n°4934509
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 25-02-2005 à 14:03:24  profilanswer
 

Tu veux faire quoi comme manip' en fait ?  :D


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Chacun pense ce qu'il veut... moi je veux ce que je pense
n°4934863
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 25-02-2005 à 14:54:25  profilanswer
 

Faire précipiter de l'hémoglobine au sulfate d'ammo par des élèves pour qu'ils comprennent comment ça fonctionne. :jap:
Du coup je trouvais assez sympas de faire précipiter une protéine coloré, comme ça c'est plus visuel... d'où l'hémoglobine. [:dawa]
EDIT: En plus les colorations protéiques (Bradford & Co) n'aiment pas trop les interférences avec le sulfate d'ammo, et:
- j'ai pas le temps de leur faire faire une dialyse.
- j'ai pas envie de me faire chier à leur faire faire une colonne pour désaler la solution sachant qu'il faudra récupérer des fractions etc et qu'on a que 4 heures.
Alors déjà leur faire faire une gamme ça va être marrant... :D
En plus l'absorption spécifique à 577 nm permet une détection facile au spectrphotomètre.
ça m'arrangeait bien.
MAIS il mentionnent sur le site de Sigma que l'hémoglobine est sous forme prépondérante méthémoglobine.
Et je vais pas m'amuser à la remettre en hémoglobine. :/
D'où ma question est-ce que ça se trouve en soution? Mais visiblement non. Ce qui ne m'étonne qu'à moitié... [:ddr555]


Message édité par NHam le 25-02-2005 à 14:56:48

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La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
n°4936918
Svenn
Posté le 25-02-2005 à 18:19:18  profilanswer
 

NHam a écrit :

Faire précipiter de l'hémoglobine au sulfate d'ammo par des élèves pour qu'ils comprennent comment ça fonctionne. :jap:
Du coup je trouvais assez sympas de faire précipiter une protéine coloré, comme ça c'est plus visuel... d'où l'hémoglobine. [:dawa]
EDIT: En plus les colorations protéiques (Bradford & Co) n'aiment pas trop les interférences avec le sulfate d'ammo, et:
- j'ai pas le temps de leur faire faire une dialyse.
- j'ai pas envie de me faire chier à leur faire faire une colonne pour désaler la solution sachant qu'il faudra récupérer des fractions etc et qu'on a que 4 heures.
Alors déjà leur faire faire une gamme ça va être marrant... :D
En plus l'absorption spécifique à 577 nm permet une détection facile au spectrphotomètre.
ça m'arrangeait bien.
MAIS il mentionnent sur le site de Sigma que l'hémoglobine est sous forme prépondérante méthémoglobine.
Et je vais pas m'amuser à la remettre en hémoglobine. :/
D'où ma question est-ce que ça se trouve en soution? Mais visiblement non. Ce qui ne m'étonne qu'à moitié... [:ddr555]


 
Chez Sigma, je sais qu'ils ont de l'hémoglobine et de la myoglobine lyophilisée. Ca doit être utilisable, je pense

n°4937366
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 25-02-2005 à 19:28:14  profilanswer
 

Svenn a écrit :

Chez Sigma, je sais qu'ils ont de l'hémoglobine et de la myoglobine lyophilisée. Ca doit être utilisable, je pense


Ouai c'est ce que j'ai trouvé, mais ils mettent qu c'est majoritairement sous forme méthémoglobine.
Or elle n'absorbe pas des masses à 577 nm contrairement à l'hémoglobine. :/
c'est pas de bol quand même.
Autrement, comme je disais, je mesure l'absorption à une longueur d'onde entre 406 et 430 nm comme ils mettent sur le site: http://www.snv.jussieu.fr/bmedia/ATP/spechbr.htm
De toute façon, je fais une gamme étalon d'hémoglobine, donc comme toutes les mesure seront faites de la même manière et que la solution de départ sera la même, ça devrait pas poser de problème...
Qu'est-ce que vous en pensez? [:opus dei]
EDIT: La solution de départ ne contiendra que de l'hémoglobine Sigma à 100 mg/L. Faudrait peut-être que je tampone d'ailleur. [:atlantis]


Message édité par NHam le 25-02-2005 à 19:29:43

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La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
n°4937378
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 25-02-2005 à 19:29:56  profilanswer
 

De toutes facons, tes etudiants n'y verront que du feu  :o


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Chacun pense ce qu'il veut... moi je veux ce que je pense
n°4937436
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 25-02-2005 à 19:37:16  profilanswer
 

Le problème c'est que:
- c'est pour un rapport qui va compter pour l'exam :/
- çà va être examiner par des profs le jour de l'oral, et qu'ils vont me poser des questions [:ula]
EDIt: pis encore! ça n'est qu'n TP fictif! Qui ne sera sans doute jamais appliqué... [:zytrasnif]


Message édité par NHam le 25-02-2005 à 19:38:42

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La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
n°4937458
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 25-02-2005 à 19:39:47  profilanswer
 

Et si tu prenais une autre prot' ?   :p


---------------
Chacun pense ce qu'il veut... moi je veux ce que je pense
n°4937480
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 25-02-2005 à 19:43:13  profilanswer
 

Une idée pour une protéine facilement dosable avec des quantitées de sulfate d'ammonium élevée?
Une protéine avec un chromophore...
Je faisais l'hémoglobine parce que c'est le premier truc qui m'est venu à l'esprit.
En plus il faut que ça soit facilement trouvable dans le commerce et pas trop cher. [:mrbrelle]
Que de contrainte...


---------------
La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
n°4937491
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 25-02-2005 à 19:44:32  profilanswer
 

NHam a écrit :

Une idée pour une protéine facilement dosable avec des quantitées de sulfate d'ammonium élevée?
Une protéine avec un chromophore...
Je faisais l'hémoglobine parce que c'est le premier truc qui m'est venu à l'esprit.
En plus il faut que ça soit facilement trouvable dans le commerce et pas trop cher. [:mrbrelle]
Que de contrainte...


 
On a le droit de la doser indirectement par son activite enzymatique ? [:tinostar]


---------------
Chacun pense ce qu'il veut... moi je veux ce que je pense
n°4939301
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 26-02-2005 à 00:38:46  profilanswer
 

RykM a écrit :

On a le droit de la doser indirectement par son activite enzymatique ? [:tinostar]


[:bap2703] Pour des première STL...bof. :/


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La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
n°4940631
Svenn
Posté le 26-02-2005 à 11:45:31  profilanswer
 

NHam a écrit :

[:bap2703] Pour des première STL...bof. :/


 
Tu prépares un examen comme l'aggreg ou le Capes ?

n°4940694
Svenn
Posté le 26-02-2005 à 11:58:27  profilanswer
 

NHam a écrit :

Ouai c'est ce que j'ai trouvé, mais ils mettent qu c'est majoritairement sous forme méthémoglobine.
Or elle n'absorbe pas des masses à 577 nm contrairement à l'hémoglobine. :/
c'est pas de bol quand même.
Autrement, comme je disais, je mesure l'absorption à une longueur d'onde entre 406 et 430 nm comme ils mettent sur le site: http://www.snv.jussieu.fr/bmedia/ATP/spechbr.htm
De toute façon, je fais une gamme étalon d'hémoglobine, donc comme toutes les mesure seront faites de la même manière et que la solution de départ sera la même, ça devrait pas poser de problème...
Qu'est-ce que vous en pensez? [:opus dei]
EDIT: La solution de départ ne contiendra que de l'hémoglobine Sigma à 100 mg/L. Faudrait peut-être que je tampone d'ailleur. [:atlantis]


 
Je pense pas que le problème soit lié spécifiquement à Sigma, mais je crois qu'il est général. Sauf erreur de ma part, l'hémoglobine subit une réaction chimique (oxydation par 02 je crois) qui la convertit en methémoglobine. Si tu tiens à utiliser l'hémoglobine, je vois deux solutions possibles
- Soit commander l'hémoglobine au dernier moment et dissoudre l'hémoglobine 10 minutes avant le début du TP,étant donné que l'hémoglobine sera probablement plus stable en poudre qu'en solution.
- Sinon, il doit être possible de rajouter un réducteur pour reconvertir la methémoglobine en hémoglobine. Il faudrait voir dans la littérature si tu peux pas faire ça en rajoutant du DTT ou du beta-mercaptoethanol.  
 
Je pense que tu retrouveras le problème avec tous les chromophores utilisant le fer, qui passe d'une charge 2+ à 3+ quand il est oxydé.
 
Si tu veux utiliser une autre protéine, une bonne idée serait de regarder dans les marqueurs de poids moléculaire. Les protéines utilisées coutent en général pas grand chose et dans les plus récents, il y a souvent des protéines colorées.  
Tu trouveras peut-être ton bonheur là-dedans.

n°4940786
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 26-02-2005 à 12:17:41  profilanswer
 

Svenn a écrit :

Tu prépares un examen comme l'aggreg ou le Capes ?


ouai...Les deux en fait.
Mais l'agreg j'ai aucune chance. [:chapi-chapo]


---------------
La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
n°4940793
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 26-02-2005 à 12:19:51  profilanswer
 

Svenn a écrit :

Je pense pas que le problème soit lié spécifiquement à Sigma, mais je crois qu'il est général. Sauf erreur de ma part, l'hémoglobine subit une réaction chimique (oxydation par 02 je crois) qui la convertit en methémoglobine. Si tu tiens à utiliser l'hémoglobine, je vois deux solutions possibles
- Soit commander l'hémoglobine au dernier moment et dissoudre l'hémoglobine 10 minutes avant le début du TP,étant donné que l'hémoglobine sera probablement plus stable en poudre qu'en solution.
- Sinon, il doit être possible de rajouter un réducteur pour reconvertir la methémoglobine en hémoglobine. Il faudrait voir dans la littérature si tu peux pas faire ça en rajoutant du DTT ou du beta-mercaptoethanol.  
 
Je pense que tu retrouveras le problème avec tous les chromophores utilisant le fer, qui passe d'une charge 2+ à 3+ quand il est oxydé.
 
Si tu veux utiliser une autre protéine, une bonne idée serait de regarder dans les marqueurs de poids moléculaire. Les protéines utilisées coutent en général pas grand chose et dans les plus récents, il y a souvent des protéines colorées.  
Tu trouveras peut-être ton bonheur là-dedans.


:jap:
Je regardais justement les réducteur, mais ce qu'ils proposent c'est la méthémoglobine réductase (à NADH)...Dans le genre pas cher on a vu mieux. [:mustang]


---------------
La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
n°4941552
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 26-02-2005 à 15:14:38  profilanswer
 

Svenn a écrit :


 
Si tu veux utiliser une autre protéine, une bonne idée serait de regarder dans les marqueurs de poids moléculaire. Les protéines utilisées coutent en général pas grand chose et dans les plus récents, il y a souvent des protéines colorées.  
Tu trouveras peut-être ton bonheur là-dedans.


J'avais pense a ca egalement, mais les marqueurs sont colores artificiellement bien sur, et tes prot' ne sont pas pures. En plus c'est pas donne, le petit tube Invitrogen je crois que c'est 80 euros  [:w3c compliant]


---------------
Chacun pense ce qu'il veut... moi je veux ce que je pense
n°4941828
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 26-02-2005 à 15:48:24  profilanswer
 

Au passage, le nouveau Cell est une immense review sur l'"aging", c'est passionnant  [:huit]
 
http://www.cell.com/


Message édité par RykM le 26-02-2005 à 15:48:49

---------------
Chacun pense ce qu'il veut... moi je veux ce que je pense
n°4941852
Svenn
Posté le 26-02-2005 à 15:52:15  profilanswer
 

RykM a écrit :

Au passage, le nouveau Cell est une immense review sur l'"aging", c'est passionnant  [:huit]
 
http://www.cell.com/


 
J'ai vu ça hier, ça a l'air super intéressant. J'avais peur de m'ennuyer dans le train Paris-Bales (encore pire que Paris-Strasbourg, il faut le prendre pour le croire), au moins j'aurais de quoi m'occuper.


---------------
Winning an Ig Nobel is like winning a Darwin Award, and you don’t have to die
n°4941891
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 26-02-2005 à 15:56:13  profilanswer
 

Svenn a écrit :

J'ai vu ça hier, ça a l'air super intéressant. J'avais peur de m'ennuyer dans le train Paris-Bales (encore pire que Paris-Strasbourg, il faut le prendre pour le croire), au moins j'aurais de quoi m'occuper.


 
Recherche de post-doc' ?  :D


---------------
Chacun pense ce qu'il veut... moi je veux ce que je pense
n°4950420
Rasthor
Posté le 27-02-2005 à 17:54:15  profilanswer
 

Y'a quoi comme journaux intéressants en biologie et autres sciences, que l'on peut trouver facilement en kiosque, en anglais ou français, pour pas trop cher et qui soit un poil plus techniques que Sciences&Vie ?

n°4950427
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 27-02-2005 à 17:54:59  profilanswer
 

La Recherche
 
Pour la Science
 
Biofutur (un peu cher)


---------------
Chacun pense ce qu'il veut... moi je veux ce que je pense
n°4950579
Rasthor
Posté le 27-02-2005 à 18:17:16  profilanswer
 

RykM a écrit :

La Recherche
 
Pour la Science
 
Biofutur (un peu cher)

Merci. :jap:

n°4950598
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 27-02-2005 à 18:19:41  profilanswer
 

De rien  :)


---------------
Chacun pense ce qu'il veut... moi je veux ce que je pense
n°4950632
Profil sup​primé
Posté le 27-02-2005 à 18:22:44  answer
 

Sciences & Avenir :o
 
Nature :o

n°4950646
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 27-02-2005 à 18:23:40  profilanswer
 


 
Nature, pas cher ? :/
 
Sinon y'a Science, Current Biology, EMBO reports ...... [:dao]


---------------
Chacun pense ce qu'il veut... moi je veux ce que je pense
n°4950660
Profil sup​primé
Posté le 27-02-2005 à 18:25:19  answer
 

RykM a écrit :

Nature, pas cher ? :/
 
Sinon y'a Science, Current Biology, EMBO reports ...... [:dao]


 
Suffit de l'emprunter en bibliothèque. Personnellement, acheter des magazines papier, bof, on les lit 3 fois puis direction grenier... préfère un PDF, ou une bonne bibliothèque des sciences :o


Message édité par Profil supprimé le 27-02-2005 à 18:25:39
n°4950702
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 27-02-2005 à 18:30:13  profilanswer
 


 
Je lis exclusivement on-line, et j'imprime quand un article m'interesse et qu'il necessite une petite biere pour etre pleinement compris. [:dao]


---------------
Chacun pense ce qu'il veut... moi je veux ce que je pense
n°4950714
Profil sup​primé
Posté le 27-02-2005 à 18:31:26  answer
 

RykM a écrit :

Je lis exclusivement on-line, et j'imprime quand un article m'interesse et qu'il necessite une petite biere pour etre pleinement compris. [:dao]


Ouais voilà... :jap:

n°4951863
Plam
Bear Metal
Posté le 27-02-2005 à 21:11:11  profilanswer
 

RykM a écrit :

Je lis exclusivement on-line, et j'imprime quand un article m'interesse et qu'il necessite une petite biere pour etre pleinement compris. [:dao]


 
 
Tu vas prendre de la brioche apres :o
 
edit : du bide quoi :o


Message édité par Plam le 27-02-2005 à 21:11:26

---------------
Spécialiste du bear metal
n°4951918
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 27-02-2005 à 21:24:04  profilanswer
 

Plam a écrit :

Tu vas prendre de la brioche apres :o
 
edit : du bide quoi :o


 
J'ai deja passe un an a Munich...  :D


---------------
Chacun pense ce qu'il veut... moi je veux ce que je pense
n°4951929
Plam
Bear Metal
Posté le 27-02-2005 à 21:26:16  profilanswer
 

RykM a écrit :

J'ai deja passe un an a Munich...  :D


 
ouch :o


---------------
Spécialiste du bear metal
n°4952533
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 27-02-2005 à 22:49:07  profilanswer
 

Bravo la science sur le forum... [:chapi-chapo]
On reconnait les geens sérieux. [:ddr555]


---------------
La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
mood
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Posté le   profilanswer
 

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