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Auteur Sujet :

[topik unique] Génétique, biologie moléculaire et structurale.

n°22500743
merlin_67
Arrangeur d'angles farfelus
Posté le 07-05-2010 à 14:37:33  profilanswer
 

Reprise du message précédent :

Svenn a écrit :


 
D´apres l´article, le transfert de gene se serait produit des neanderthaliens vers sapiens et non l´inverse. Donc si il y avait eu une erreur de ce type, il aurait a priori fallu qu´ils contaminent de l´ADN de sapiens avec le l´ADN neanderthalien, il faudrait vraiment que ce soient des gros boulays.


sauf si le tech est un néanderthalien  [:gordon shumway]


---------------
Les vers de terre s'enfoncent dans le sol pour ne pas tomber amoureux des étoiles.
mood
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Posté le 07-05-2010 à 14:37:33  profilanswer
 

n°22510205
crepator4
Deus ex machina
Posté le 08-05-2010 à 06:34:02  profilanswer
 

merlin_67 a écrit :


as tu vu un nutritionniste, car bon l'apport en vitC ne se fait pas que par les fruits !
ensuite, l'excipient, comment dire... ça évite que tu crèves si tu te l'injectes...  :D


 
Le nutritionniste je sais meme pas si ça existe dans mon coin... (province) mais je suis tres/trop specifique question regime... :D  
 
suis pas fan des piqures ,je vais eviter de l'injecter, meme en lavement... :o (du a quoi le risque ?,un "choc" du a l'acidité ? )
 
En fait j'ai retrouvé mon stress (dextrogyre= pas ou peu d'activité vitaminique) :
http://forum.lixium.fr/v-10464427.htm  en fait la secretaire a du se melanger les pinceaux dans les termes...  
mais d'apres le codex et la notice c'est la bonne bete , http://news.reseau-concept.net/ima [...] 000_18.pdf
 
...du coup un mois au placard le sachet,failli le bazarder... :/

Message cité 1 fois
Message édité par crepator4 le 08-05-2010 à 06:35:26

---------------
...survivre à ses Medecins...
n°22518881
merlin_67
Arrangeur d'angles farfelus
Posté le 09-05-2010 à 12:25:54  profilanswer
 

crepator4 a écrit :


 
Le nutritionniste je sais meme pas si ça existe dans mon coin... (province) mais je suis tres/trop specifique question regime... :D  


yen a partout dans tous les CHU ! c'est étrange ton truc/requête  [:klemton]


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Les vers de terre s'enfoncent dans le sol pour ne pas tomber amoureux des étoiles.
n°22522770
crepator4
Deus ex machina
Posté le 09-05-2010 à 19:49:44  profilanswer
 

non mais j'ai pas trop cherché en fait ... ;)  
,je suis dans une petite ville et les vrais competences sont rares ...l'hopital etant pire que tout...
(sinon question régime ,je suis intolerant a 80%/90% de la bouffe +transit perturbé :D ,peu de fruit legume sinon c'est le boxon,le nutri il se pend  )  
 
La depuis 3ans j'avais laissé tout ça un peu de coté,la tete dans le guidon sur un projet (disons ,que y'avais des choix a faire),mais la ,la réalité me rattrape ... carence a recombler d'urgence ne serait ce que pour mes nonos /immunité :D


Message édité par crepator4 le 09-05-2010 à 20:10:59

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...survivre à ses Medecins...
n°22533896
_tchip_
Posté le 10-05-2010 à 17:53:05  profilanswer
 

Marrant de voir comment ceux qui n'arrêtent pas de pester contre lemodedevieàl'occidentale sont les premiers à réclamer leur petite pilule, tout en s'inscrivant dans la démarche du toujours moins cher :o


---------------
He likes the taste...
n°22618113
syr01
Hystérie connective
Posté le 18-05-2010 à 00:02:42  profilanswer
 

Je ne suis pas bien certain de pouvoir apporter une réponse à ta question mais je suis curieux... Expérimentalement, comment ça se passe? Dans quel système cellulaire travailles tu? Comment tu fais pour injecter des microsomes "avant" ou "après" traduction? [:klemton]


---------------
\o/ Haut-fait "Première Page" achevé le 28-05-2011 \o/
n°22620033
Svenn
Posté le 18-05-2010 à 09:39:47  profilanswer
 


 
Tu en es vraiment sur ? [:ocube]
 

Spoiler :

La grosse proteine n'a justement pas ete transloquee quand les microsomes sont ajoutes apres coup ==> elle est sensible aux proteases et non N-glycosylee donc non sensible a l'endo H ==> Translocation co-traductionnelle au moins dans ce cas

n°22620513
Svenn
Posté le 18-05-2010 à 10:22:43  profilanswer
 

Difficile a dire sans en savoir plus sur la proteine, sans plus d'infos on estoblige de rester aux hypotheses. Voila cependant comment je vois les choses :
 
On a un competition entre replieemnt et translocation. Dans un contexte normal (avec microsome), le repliement est lent donc la proteine est immediatement transloquee et se replie dans la lumiere du RE.  
En l'absence de microsome, la proteine commence a se replier mais elle le fait de facon aberrante en l'absence de glycosylations et des chaperonnes du RE. De surcroit, un proteine de grande taille est en general plus  delicate a replier. On parvient donc a une proteine mal repliee et/ou agregee, le peptide signal n'est plus accessible au translocon et donc la proteine n'est pas transloquee.


Message édité par Svenn le 18-05-2010 à 10:22:56
n°22626852
syr01
Hystérie connective
Posté le 18-05-2010 à 18:53:06  profilanswer
 

Si je peux me permettre, je comprends pas toute la manip... Les microsomes sont bien là pour mimer le RE? [:klemton]


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\o/ Haut-fait "Première Page" achevé le 28-05-2011 \o/
n°22626963
Svenn
Posté le 18-05-2010 à 19:01:27  profilanswer
 

Les microsomes sont des fragments de membranes de RE (contenant les lipides et la machinerie proteique). Ce sont des compartiments fermes : les proteines secretees sont donc transloquees a l'interieur des microsomes

mood
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Posté le 18-05-2010 à 19:01:27  profilanswer
 

n°22627224
syr01
Hystérie connective
Posté le 18-05-2010 à 19:28:38  profilanswer
 

Si je comprends bien, pendant/après traduction, les protéines issues des ARN "petit" et "moyen" passent dans les microsomes où elles sont N-glycosylées. Du coup, la protéase ne fait rien tandis que l'endoH sépare la protéine de ses mannoses, d'où la taille plus faible.

 

Pour l' ARN long, la protéine synthétisée peut être transloquée dans le microsome pendant sa traduction et son destin suit celui de ses petites amies.

 

Par contre, si les microsomes sont ajoutés après, la protéine est incapable d'être transloquée dans le microsome (elle est trop grosse / conformation pas terrible / peptide signal qui en prend un coup / pores pas contents ou que sais-je...), du coup elle n'est pas dégradée par la protéase, et, comme elle n'est pas N-glycosylée (puisqu'incapable de passer dans le microsome), l'endo H n'a aucun effet sur elle.

 

Bien.

 

Mais les COS-7 n'ont pas un RE et un golgi? Pourquoi les protéines n'y seraient pas N-glycosylée?

 

Ou alors je rate vraiment quelque chose [:petrus75]

Message cité 1 fois
Message édité par syr01 le 18-05-2010 à 19:29:11

---------------
\o/ Haut-fait "Première Page" achevé le 28-05-2011 \o/
n°22627347
Svenn
Posté le 18-05-2010 à 19:41:45  profilanswer
 

syr01 a écrit :

Si je comprends bien, pendant/après traduction, les protéines issues des ARN "petit" et "moyen" passent dans les microsomes où elles sont N-glycosylées. Du coup, la protéase ne fait rien tandis que l'endoH sépare la protéine de ses mannoses, d'où la taille plus faible.
 
Pour l' ARN long, la protéine synthétisée peut être transloquée dans le microsome pendant sa traduction et son destin suit celui de ses petites amies.
 
Par contre, si les microsomes sont ajoutés après, la protéine est incapable d'être transloquée dans le microsome (elle est trop grosse / conformation pas terrible / peptide signal qui en prend un coup / pores pas contents ou que sais-je...), 1-du coup elle n'est pas dégradée par la protéase, et, comme elle n'est pas N-glycosylée (puisqu'incapable de passer dans le microsome), l'endo H n'a aucun effet sur elle.
 
Bien.
 
2- Mais les COS-7 n'ont pas un RE et un golgi? Pourquoi les protéines n'y seraient pas N-glycosylée?
 
Ou alors je rate vraiment quelque chose [:petrus75]


 
1- Dans le milieu reactionnel, il y a juste l'interieur et l'exterieur des microsomes. L'interieur correspond a la lumiere du RE (ou ls proteines secretees sont glycosylees/repliees) et l'exterieur au cytoplasme (on y trouve les ribosomes). Les proteines non transloquees sont donc bloquees a l'exterieur et accessibles aux proteases (on n'observe aucune bande sur le gel correspondant a cette condition).
 
2- Les COS7 sont des cellules de mammiferes et a ce titre elles ont tout l'attirail classique des eucaryotes avec un RE et un Golgi. Cependant, la N-glycosylation se produit dans la lumiere du RE apres translocation. DOnc en l'absence de translocation, la proteine ne peut pas etre N-glycosylee.

n°22627419
syr01
Hystérie connective
Posté le 18-05-2010 à 19:51:23  profilanswer
 

Svenn a écrit :


 
1- Dans le milieu reactionnel, il y a juste l'interieur et l'exterieur des microsomes. L'interieur correspond a la lumiere du RE (ou ls proteines secretees sont glycosylees/repliees) et l'exterieur au cytoplasme (on y trouve les ribosomes). Les proteines non transloquees sont donc bloquees a l'exterieur et accessibles aux proteases (on n'observe aucune bande sur le gel correspondant a cette condition).


My mistake, ma fourche a langué, il fallait lire "la protéine est dégradée" :D

Svenn a écrit :


2- Les COS7 sont des cellules de mammiferes et a ce titre elles ont tout l'attirail classique des eucaryotes avec un RE et un Golgi. Cependant, la N-glycosylation se produit dans la lumiere du RE apres translocation. DOnc en l'absence de translocation, la proteine ne peut pas etre N-glycosylee.


Mais c'est justement ça que je ... Ah putain mais ouais, apprends à lire gros :o La traduction se fait in vitro, pas dans les COS-7 :D
 
C'est bon, je crois que je l'ai :D
 
Merci [:bodette]


---------------
\o/ Haut-fait "Première Page" achevé le 28-05-2011 \o/
n°22687835
Aragorn Le​ Rouge
Posté le 23-05-2010 à 16:15:12  profilanswer
 

Qui veut synthétiser des bactéries [:dawa]
 
http://www.sciencemag.org/cgi/rapi [...] 0719v1.pdf
 
N'empêche sacré boulot [:implosion du tibia] mais y'en a déjà pour crier qu'il a ouvert la boîte de Pandore :/
 
Et ici un résumé du travail de Venter:
 
http://www.sciencemag.org/cgi/reprint/328/5981/958.pdf


---------------
@avd.racing The margin between success and drama is fractional. - Jacky Ickx
n°22742976
yamazaki
Still just a rat in a cage?
Posté le 27-05-2010 à 22:23:36  profilanswer
 

En recherche de thèse, je regarde actuellement du coté de Göttingen (Graduate School for Neurosciences and Molecular Biosciences aka GGNB). Quelqu'un connait? Y est passé une semaine en vaconference? En train sans s'arreter? Connait un gus qui a entendu parler d'un gars qui a une connaissance dont la femme du cousin a vu une émission qui en parlait à la TV? [:tinostar]

n°22745991
Profil sup​primé
Posté le 28-05-2010 à 10:35:33  answer
 

Göttingen c'est plein de géologues :o

n°22746021
merlin_67
Arrangeur d'angles farfelus
Posté le 28-05-2010 à 10:37:10  profilanswer
 

yamazaki a écrit :

En recherche de thèse, je regarde actuellement du coté de Göttingen (Graduate School for Neurosciences and Molecular Biosciences aka GGNB). Quelqu'un connait? Y est passé une semaine en vaconference? En train sans s'arreter? Connait un gus qui a entendu parler d'un gars qui a une connaissance dont la femme du cousin a vu une émission qui en parlait à la TV? [:tinostar]


tu peux postuler chez moi  [:o_doc] Nancy, c'est bien aussi  

Spoiler :

[:xla]


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Les vers de terre s'enfoncent dans le sol pour ne pas tomber amoureux des étoiles.
n°22746117
Svenn
Posté le 28-05-2010 à 10:43:42  profilanswer
 

merlin_67 a écrit :


tu peux postuler chez moi  [:o_doc] Nancy, c'est bien aussi  

Spoiler :

[:xla]



 
Oui enfin la Lorraine au bout d´une heure tu t´y ennuies deja. D´ailleurs je ne comprends meme pas qu´il y ait encore des habitants la-bas, c´est un peu comme le Limousin en fait. Il faut vraiment que tu aies un super sujet de these a proposer parce que ca sera sa seule occupation pour les trois quatre six annees a venir :/

n°22746162
Rasthor
Posté le 28-05-2010 à 10:46:41  profilanswer
 

yamazaki a écrit :

En recherche de thèse, je regarde actuellement du coté de Göttingen (Graduate School for Neurosciences and Molecular Biosciences aka GGNB). Quelqu'un connait? Y est passé une semaine en vaconference? En train sans s'arreter? Connait un gus qui a entendu parler d'un gars qui a une connaissance dont la femme du cousin a vu une émission qui en parlait à la TV? [:tinostar]


Tu cherches quel sujet ?

n°22746464
merlin_67
Arrangeur d'angles farfelus
Posté le 28-05-2010 à 11:05:03  profilanswer
 

Svenn a écrit :


 
Oui enfin la Lorraine au bout d´une heure tu t´y ennuies deja. D´ailleurs je ne comprends meme pas qu´il y ait encore des habitants la-bas, c´est un peu comme le Limousin en fait. Il faut vraiment que tu aies un super sujet de these a proposer parce que ca sera sa seule occupation pour les trois quatre six annees a venir :/


de toute façon, la thèse, c'est comme le post-doc, t'y va pas pour le tourisme, mais pour publier  [:adrien monk]  
Le sujet est forcément hyper intéressant, et surtout à bon potentiel de publication. Ensuite, chez moi, c'est 3 ans max, la thèse; avec potentielle embauche dans le privé rapidement, vu le sujet.
Ensuite... tu connais la Lorraine ou le limousin ? Je pourrais faire le même genre de réflexion sur Munich, rempli de facho buveurs de bières et mangeur de bradwurst  [:spamafote] . Après,  si tu y as vécu 10 ans, je comprendrais

Spoiler :

:lol:

Message cité 1 fois
Message édité par merlin_67 le 28-05-2010 à 11:06:02

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Les vers de terre s'enfoncent dans le sol pour ne pas tomber amoureux des étoiles.
n°22746925
yamazaki
Still just a rat in a cage?
Posté le 28-05-2010 à 11:30:53  profilanswer
 

Rasthor a écrit :


Tu cherches quel sujet ?


En gros, j'ai une formation bien batarde et je sors de master pro. J'ai fait bioch puis "Phytoressources", dc en gros, purif, identification et valorisation de molécules naturelles végétales.
Une thèse CNRS à laquelle j'ai postulée et qui me botte vraiment, ca donne ca:

Citation :

Identification of cone protecting molecules from natural compounds libraries
Out of 184 plant extracts tested at this stage of the project, we have identified seven novel species that act by preventing the death of cones in our model. We reported, on June 2009, the positive effect of an extract of a plant originated from Burkina Faso whose leaves are used in the traditional  medicine against fever. While we have experienced that many plant extracts are not active or are often even toxic in our models, we have now identified six novel species also originated from Burkina Faso.
At the completion of the screening of the 800 plant extracts, the extracts of the positive plants will be fractionated, and the fractions and subfractions tested in the same assay should lead to the identification of the active molecules that could be developed as therapeutic agents for RP. The CNRS has granted the project of a fellowship for a PhD thesis at the University Pierre and Marie Curie, Paris06 (project n° 35 at https://www2.cnrs.fr/DRH/doctorants-10/).


Un mélange de bioch valorisant des extraits naturels, et de neuro, tout ce que j'aime [:mamy_furax]  
Vu mon parcours, de toute facon, je dois me lancer sur un sujet totalement nouveau pour moi. Donc j'aimerais rester dans de la valorisation de molécules naturelles, soit dans le domaine de la neuro (j'adore ca), donc dans une approche pharmacognosie, soit dans de l'environnement-écologie-sauver le monde-allez les verts! [:albanulle:2]  
 
 
J'ai failli envoyer un mail à Merlin avt hier d'ailleurs pour lui demander s'il avait des pistes...

n°22747072
Svenn
Posté le 28-05-2010 à 11:40:35  profilanswer
 

merlin_67 a écrit :


de toute façon, la thèse, c'est comme le post-doc, t'y va pas pour le tourisme, mais pour publier  [:adrien monk]  
Le sujet est forcément hyper intéressant, et surtout à bon potentiel de publication. Ensuite, chez moi, c'est 3 ans max, la thèse; avec potentielle embauche dans le privé rapidement, vu le sujet.
Ensuite... tu connais la Lorraine ou le limousin ? Je pourrais faire le même genre de réflexion sur Munich, rempli de facho buveurs de bières et mangeur de bradwurst  [:spamafote] . Après,  si tu y as vécu 10 ans, je comprendrais

Spoiler :

:lol:



 
Buveurs de biere et bouffeurs de bratwurst, oui mais facho pas tellement, ils votent meme a gauche a Munich. Par contre, tout autour ce sont clairement des cathos integristes bouffeurs de biere et buveurs de bratwurst [:ocube]
 
Pour les theses, c´est vrai qu´ils ont limite ca a trois ans en France desormais. Ca permet d´eviter pas mal de derives par contre ca augmente fortement le risque de theses sans publis pour peu que ton sujet soit foireux. Pour ceux qui travaillent en animal notamment et pour lesquels les manipes sont tres lentes, ca risque d´etre assez tendu. Meme dans mon domaine en cristallo, trois ans ca peut etre court si a proteine a cristalliser s´avere plus retorse que prevue (c´est a dire au moins 50% du temps)
 

Spoiler :

De la Lorraine, je ne connais que la gare de Metz et je connais encore moins le Limousin :o

n°22747228
the veggie​ boy
Who's taking my Lorazepam?
Posté le 28-05-2010 à 11:52:25  profilanswer
 

tiens ils sont rémunérés combien les thésards en France ?


---------------
blacklist
n°22747297
merlin_67
Arrangeur d'angles farfelus
Posté le 28-05-2010 à 11:57:30  profilanswer
 

the veggie boy a écrit :

tiens ils sont rémunérés combien les thésards en France ?


[mode doctorant] pas assez   :o (dans les 1300?)
[mode directeur] 34k€  [:tinostar]  


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Les vers de terre s'enfoncent dans le sol pour ne pas tomber amoureux des étoiles.
n°22747662
Rasthor
Posté le 28-05-2010 à 12:30:36  profilanswer
 

merlin_67 a écrit :


[mode doctorant] pas assez   :o (dans les 1300?)
[mode directeur] 34k€  [:tinostar]  


34000 ? Ah ouais, comme en Suisse. :O
(mais c'est du brut. :O )


Message édité par Rasthor le 28-05-2010 à 12:31:15
n°22747678
yamazaki
Still just a rat in a cage?
Posté le 28-05-2010 à 12:32:17  profilanswer
 

Le montant mensuel brut de ces contrats est fixé à 1 757 €.
Si le doctorant se voit confier, en plus de son activité de recherche doctorale, une activité complémentaire telle que définit dans le décret n° 2009-464 du 23 avril 2009 relatif aux doctorants contractuels des établissements publics d’enseignement supérieur ou de recherche, le montant de la rémunération sera porté à 2 095,08 € brut mensuel.

n°22748962
Profil sup​primé
Posté le 28-05-2010 à 14:06:21  answer
 

merlin_67 a écrit :


[mode doctorant] pas assez   :o (dans les 1300?)
[mode directeur] 34k€  [:tinostar]  


Putain ici c'est 1000 net [:tinostar]

n°22749027
yamazaki
Still just a rat in a cage?
Posté le 28-05-2010 à 14:10:06  profilanswer
 

T'as quoi comme bourse à la fois? DFG?

n°22749111
Profil sup​primé
Posté le 28-05-2010 à 14:15:43  answer
 

Ouais projet DFG.

n°22749565
merlin_67
Arrangeur d'angles farfelus
Posté le 28-05-2010 à 14:40:23  profilanswer
 


heu c'est quoi DFG ?
pour les 34k€, c'est le brut "patronal" ; tu retires 40% pour avoir le net salarial.


---------------
Les vers de terre s'enfoncent dans le sol pour ne pas tomber amoureux des étoiles.
n°22749617
cloud1109
Posté le 28-05-2010 à 14:43:26  profilanswer
 

Faut venir faire une thèse en Belgique alors...
 
c'est aux environs de 1700euros net par mois  [:scroutch].  Et la vie n'est pas plus chère qu'en France :o

n°22749666
merlin_67
Arrangeur d'angles farfelus
Posté le 28-05-2010 à 14:46:36  profilanswer
 

cloud1109 a écrit :

Faut venir faire une thèse en Belgique alors...
 
c'est aux environs de 1700euros net par mois  [:scroutch].  Et la vie n'est pas plus chère qu'en France :o


tu m'étonnes c'est difficile de faire pire... quoique en Italie... j'ai fini ma thèse en 2005, je devais être 10% au dessous du SMIC... mais tout de même imposable  :pfff:


---------------
Les vers de terre s'enfoncent dans le sol pour ne pas tomber amoureux des étoiles.
n°22749980
Profil sup​primé
Posté le 28-05-2010 à 15:07:18  answer
 

merlin_67 a écrit :


heu c'est quoi DFG ?
pour les 34k€, c'est le brut "patronal" ; tu retires 40% pour avoir le net salarial.


 
Deutsche Forschungsgemeinschaft, un peu l'équivalent du CNRS.
Et moi en brut patronal, je suis à 24k€, tu retires 50% pour avoir le net salarial. [:tinostar]
 
KONFISKATVAHR §§§ [:hado papi:1]

Message cité 1 fois
Message édité par Profil supprimé le 28-05-2010 à 15:08:15
n°22750574
merlin_67
Arrangeur d'angles farfelus
Posté le 28-05-2010 à 15:43:59  profilanswer
 


gott verdammt ! Et tu arrives à vivre avec ça  :??:


---------------
Les vers de terre s'enfoncent dans le sol pour ne pas tomber amoureux des étoiles.
n°22750602
Profil sup​primé
Posté le 28-05-2010 à 15:45:37  answer
 

merlin_67 a écrit :


gott verdammt ! Et tu arrives à vivre avec ça  :??:


Yep, et même à mettre de côté (disons, de quoi payer mes déplacements pros qui me sont remboursés 3 mois + tard [:tinostar]). La vie à la capitale est vraiment pas chère...

n°22750743
Rasthor
Posté le 28-05-2010 à 15:54:46  profilanswer
 

cloud1109 a écrit :

Faut venir faire une thèse en Belgique alors...

 

c'est aux environs de 1700euros net par mois  [:scroutch].  Et la vie n'est pas plus chère qu'en France :o


2'250 euros net par mois en Suisse. [:bugman]
(en première année évidement, ça monte ensuite. :O)

Message cité 2 fois
Message édité par Rasthor le 28-05-2010 à 15:55:07
n°22750764
merlin_67
Arrangeur d'angles farfelus
Posté le 28-05-2010 à 15:55:54  profilanswer
 

Rasthor a écrit :


2'250 euros net par mois en Suisse. [:bugman]
(en première année évidement, ça monte ensuite. :O)


aux pays bas aussi c'est indexé... 2250, je touche pas ça en étant statutaire  :sweat:


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Les vers de terre s'enfoncent dans le sol pour ne pas tomber amoureux des étoiles.
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