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Auteur Sujet :

[topik unique] Génétique, biologie moléculaire et structurale.

n°16667780
Rasthor
Posté le 07-11-2008 à 12:28:05  profilanswer
 

Reprise du message précédent :

Svenn a écrit :


 
Non, la c´est juste un abus de langage de la part des auteurs. Si tu vas voir la suite du resume, c´est aussi positif pour les mutations destabilisantes. Pour moi, il faut comprendre :  4 mutations stabilisent la proteine avec des differences d´energie en valeur absolue de 0,46 a 4,23 kcal/mol (mais elles sont negatives et donc comprises entre -4,23 et -0,46) tandis que deux destabilisations correspondent a des differences d´energie de .... en valeur absolue (et elles sont positives)


Euh...non. Dans le tableau 1, elles sont clairement positives.
http://pubs.acs.org/cgi-bin/sample [...] 0507d.html

mood
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Posté le 07-11-2008 à 12:28:05  profilanswer
 

n°16667876
Svenn
Posté le 07-11-2008 à 12:39:07  profilanswer
 

Spafaux.  
 
Bon, tu as peut etre interet a leur demander alors  :o

n°16668379
Rasthor
Posté le 07-11-2008 à 13:47:09  profilanswer
 

Bon, j'attend leur réponse. :O

 


Plus globalement, c'est publiable ce genre d'analyse purement structuralo-computationnelle ?

Message cité 2 fois
Message édité par Rasthor le 07-11-2008 à 13:47:18
n°16668628
Svenn
Posté le 07-11-2008 à 14:15:17  profilanswer
 

Rasthor a écrit :

Bon, j'attend leur réponse. :O
 
 
Plus globalement, c'est publiable ce genre d'analyse purement structuralo-computationnelle ?


 
Il y a des journaux de bioinfo mais je ne les connais pas et je ne sais pas trop ce qui est publiable ou non.

n°16668648
Rasthor
Posté le 07-11-2008 à 14:17:29  profilanswer
 

Svenn a écrit :

Il y a des journaux de bioinfo mais je ne les connais pas et je ne sais pas trop ce qui est publiable ou non.


Plutot taper dans un journal d'evolution et de biologie. A voir...

n°16670164
yamazaki
Still just a rat in a cage?
Posté le 07-11-2008 à 16:47:19  profilanswer
 

Dans un Plos Bioinf, pkoi pas...
Evolution, ils vont vouloir des maths, des stats...
'fin vois, mais bon... Ca me semble ledge...

n°16670183
uriel
blood pt.2
Posté le 07-11-2008 à 16:49:14  profilanswer
 

Rasthor a écrit :


Plus globalement, c'est publiable ce genre d'analyse purement structuralo-computationnelle ?


oui, une collegue vient d'en publier un second sur le même genre de sujet. les 2 articles sont en collaboration avec un groupe d'experimentaux par contre.


---------------
IVG en france
n°16672269
Rasthor
Posté le 07-11-2008 à 20:47:54  profilanswer
 

uriel a écrit :


oui, une collegue vient d'en publier un second sur le même genre de sujet. les 2 articles sont en collaboration avec un groupe d'experimentaux par contre.


Fait péter les réfs. :O

n°16672760
uriel
blood pt.2
Posté le 07-11-2008 à 21:40:20  profilanswer
 

Rasthor a écrit :


Fait péter les réfs. :O


accepté pour le second, pas encore publié.
 le 1er c'est http://www3.interscience.wiley.com [...] 1&SRETRY=0


---------------
IVG en france
n°16682644
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 09-11-2008 à 15:51:46  profilanswer
 

Une derniere requete avant ma defense:
 
1: Cell. 1982 Jun;29(2):357-65.
    T4 endonuclease VII cleaves holliday structures.
    Mizuuchi K, Kemper B, Hays J, Weisberg RA.
 
Apres j'arrete  [:cosmoschtroumpf]  
 

mood
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Posté le 09-11-2008 à 15:51:46  profilanswer
 

n°16682670
uriel
blood pt.2
Posté le 09-11-2008 à 15:56:11  profilanswer
 

tada: http://www.zshare.net/download/51104521a6fd0a20/
 
 
 vous avez pas d'abo à Cell chez vous? [:dawao]


---------------
IVG en france
n°16682726
yamazaki
Still just a rat in a cage?
Posté le 09-11-2008 à 16:05:26  profilanswer
 

Chez nous, on a pas d'abo avant 97 (je crois). Pr le reste, faut aller à la BU, leur demander de déterrer les documents des silos, qui sont toujours fermés en ce moment, pour cause de rénovation de la BU...

n°16682733
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 09-11-2008 à 16:06:14  profilanswer
 

uriel a écrit :

tada: http://www.zshare.net/download/51104521a6fd0a20/
 
 
 vous avez pas d'abo à Cell chez vous? [:dawao]


 
 
Un grand merci  :hello:  
 
 
Pas au-dela de 1995.
 
Nature et Science, idem.
 
Une vraie merde c'te fac'  :o


Message édité par RykM le 09-11-2008 à 16:06:35
n°16682738
uriel
blood pt.2
Posté le 09-11-2008 à 16:07:12  profilanswer
 

:/ 'tain la galere, c'est vrai qu'ici jsuis peinard.
 
 même les livres, je me les fais livrer à mon bureau :D


---------------
IVG en france
n°16682769
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 09-11-2008 à 16:13:27  profilanswer
 

Vivement que je demenage a Geneve  [:nidnogar]

n°16684056
Cardelitre
ಠ_ಠ ۞_۟۞ ┌( ಠ_ಠ)┘ סּ_סּ
Posté le 09-11-2008 à 19:41:01  profilanswer
 

RykM a écrit :

Vivement que je demenage a Geneve  [:nidnogar]


Tu comptes venir chez nous pour un post-doc? :D


---------------
Intra-Science  -  To thine own self be true
n°16686087
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 09-11-2008 à 23:30:01  profilanswer
 

Cardelitre a écrit :


Tu comptes venir chez nous pour un post-doc? :D


 
Bah c'est presque fait  :)  
 
Je visite le labo debut Decembre  :love:

n°16686144
Cardelitre
ಠ_ಠ ۞_۟۞ ┌( ಠ_ಠ)┘ סּ_סּ
Posté le 09-11-2008 à 23:37:54  profilanswer
 

RykM a écrit :


 
Bah c'est presque fait  :)  
 
Je visite le labo debut Decembre  :love:


Uni de Genève?


---------------
Intra-Science  -  To thine own self be true
n°16686169
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 09-11-2008 à 23:41:06  profilanswer
 
n°16686179
Cardelitre
ಠ_ಠ ۞_۟۞ ┌( ಠ_ಠ)┘ סּ_סּ
Posté le 09-11-2008 à 23:42:10  profilanswer
 

RykM a écrit :


 
Yep'  :)


Dans ce cas bienvenue chez nous, et bonne chance pour trouver un appart... :D


---------------
Intra-Science  -  To thine own self be true
n°16686183
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 09-11-2008 à 23:42:41  profilanswer
 

Cardelitre a écrit :


Dans ce cas bienvenue chez nous, et bonne chance pour trouver un appart... :D


 
Je le trouverai en France  :p

n°16687296
uriel
blood pt.2
Posté le 10-11-2008 à 07:56:13  profilanswer
 

RykM a écrit :


Je le trouverai en France  :p


:/  
 
 Geneve c'est bien, c'est beau, trouves sur place :O


---------------
IVG en france
n°16687707
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 10-11-2008 à 10:27:52  profilanswer
 

uriel a écrit :


:/  
 
 Geneve c'est bien, c'est beau, trouves sur place :O


 
C'est mission impossible, apparamment. Certains futurs (potentiels) collegues ont mis plus de 6 mois pour trouver un studio qu'ils payent les yeux de la tete. :/
 
Je jeterai un oeil mais j'me fais pas d'illusion. [:dao]

n°16688062
yamazaki
Still just a rat in a cage?
Posté le 10-11-2008 à 11:34:48  profilanswer
 

Trouve une gonzesse et installe toi vite chez elle :o

n°16690186
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 10-11-2008 à 16:04:08  profilanswer
 

Allez un dernier papier  [:nidnogar]  
 
Cell, Volume 78, Issue 6, 1063-1072, 23 September 1994
 
doi:10.1016/0092-8674(94)90280-1
 
Article
 
Atomic structure of the RuvC resolvase: A holliday junction-specific endonuclease from E. coli
 
Mariko Ariyoshi,,Dmitry G. Vassylyev,,Hiroshi Iwasaki,Haruki Nakamura,Hideo ShinagawaandKosuke Morikawa
 
Please  :sweat:

n°16690232
uriel
blood pt.2
Posté le 10-11-2008 à 16:09:50  profilanswer
 
n°16690287
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 10-11-2008 à 16:16:26  profilanswer
 

Merci  :hello:  
 
Allez hop, 5eme cafe de la journee et on repart  :o

n°16690347
yamazaki
Still just a rat in a cage?
Posté le 10-11-2008 à 16:26:59  profilanswer
 

Moi j'fais l'pont :o

n°16690379
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 10-11-2008 à 16:31:53  profilanswer
 

yamazaki a écrit :

Moi j'fais l'pont :o


 
On reconnait bien ceux qui bossent en France   :p

n°16693869
yamazaki
Still just a rat in a cage?
Posté le 10-11-2008 à 23:28:22  profilanswer
 

Et qui ont pas eu de samedi ni de dimanche :o

n°16695019
Profil sup​primé
Posté le 11-11-2008 à 03:29:34  answer
 

Bonsoir!
 
J'aurais quelques questions pour les généticiens qui trainent ici. J'aimerais savoir qui effectuent les tests génétiques pour le dépistage de maladie génétique ? Des biologistes ou des médecins biologistes? Je suppose que ce sont des biologistes qui travaillent en labo mais y a-t-il une formation spécifique à ce genre de profession ?

n°16697265
thermoclin​e
Geek intelligent
Posté le 11-11-2008 à 14:01:02  profilanswer
 

tout terme "malade" = medecin, c'est pourtant facile de ne pas se tromper :o


---------------
Les bureaucrates: "S'ils tombaient d'un immeuble, il leur faudrait une semaine pour s'ecraser." "All I ever wanted All I ever needed Is here in my arms Words are very unnecessary They can only do harm               Enjoy the silence"
n°16697527
Profil sup​primé
Posté le 11-11-2008 à 14:46:22  answer
 

Vu qu'il n'y a pas de contact avec  le patient... Et je n'ai pas parlé de diagnostic. Enfin ça ne m'a pas l'air d'être si évident.


Message édité par Profil supprimé le 11-11-2008 à 14:54:38
n°16697560
Rasthor
Posté le 11-11-2008 à 14:51:02  profilanswer
 

Peut-être que c'est bêtement des laborantins médicaux qui font le test ?

n°16700846
true-wiwi
Posté le 11-11-2008 à 22:06:52  profilanswer
 

Je dirais qu'un biologiste moléculaire doit faire ce genre de boulot et qu'il bosse en collaboration avec un médecin, mais ça reste à confirmer.


---------------
It's a simple mistake to make, to create love and to fall.
n°16700925
Svenn
Posté le 11-11-2008 à 22:18:03  profilanswer
 


 
Il me semble que c'est du ressort des médecins et qu'il faut commencer par des études de médecine pour se lancer là-dedans  :o


Message édité par Svenn le 11-11-2008 à 22:18:10
n°16702664
Profil sup​primé
Posté le 12-11-2008 à 01:12:23  answer
 


http://www.ordre.pharmacien.fr/fr/bleu/index4_2.htm
 

Citation :


 
"Les analyses de biologie médicale sont les examens biologiques qui concourent au diagnostic, au traitement ou à la prévention des maladies humaines ou qui font apparaître toute autre modification de l'état physiologique, à l'exclusion des actes d'anatomie et de cytologie pathologiques exécutés par les médecins spécialistes de cette discipline�"


 

Citation :


Les analyses de biologie médicale sont donc des "actes de biologie" réservés à des praticiens de santé (médecins, pharmaciens, vétérinaires ou scientifiques),


 
Mouais c'est pas clair...

n°16703769
yamazaki
Still just a rat in a cage?
Posté le 12-11-2008 à 08:47:41  profilanswer
 

Ca dépend des dosages, des actes. Si y'a risque de contamination => médecin. Ca dépend aussi du niveau de traitement. Si c'est sous-traité, pour des grosses quantités, ça peut revenir à des biologistes.

n°16709712
Aragorn Le​ Rouge
Posté le 12-11-2008 à 19:42:16  profilanswer
 

Un dépistage de maladie génétique connue c'est un laborantin qui fait parti d'un labo de cytogénètique et/ou médecine prédictive.
 
J'ai un pote qui a fait un stage là dedans, et ça se limité à faire soit des test ELISA-like soit des test entièrement automatisé (en gros tu fais du conditionnement d'échantillons quoi)

n°16714158
Rasthor
Posté le 13-11-2008 à 09:42:37  profilanswer
 

Svenn a écrit :


 
Pour moi, une definition logique serait :
 
DeltaG=G(proteine repliee)-G(proteine depliee) qui est negatif etant donne que la comnformation repliee correspond a un etat plus stable.
DeltaDeltaG=DeltaG(mutant)-DeltaG(wt) qui sera negatif si le mutant est plus stable et positif si il est moins stable (ce qui sera le cas la plupart du temps)
 
Reste a savoir si les auteurs du papier en  question ont la meme logique ou pas.


C'est bien ça. Je viens d'avoir la confirmation. :jap:
"DDG is DDGmutant-DDGWT. So positive is less stable and negative is more stable. "
 
Maintenant, ça veut dire que ma Serine serait moins stable que mon Alanine.... ça ne m'arrange pas cette histoire.... [:klemton]

Message cité 1 fois
Message édité par Rasthor le 13-11-2008 à 09:45:14
n°16714283
yamazaki
Still just a rat in a cage?
Posté le 13-11-2008 à 09:59:31  profilanswer
 

Pkoi ça? Si ton Alanine est ds une boucle, elle peut stabiliser la structure par des interactions hydrophobes, donc rigidifier. Alors qu'avec une Sérine, ta fonction alcool ne remplit pas la fonction, donc y'a un micro brin de liberté en plus pour ta structure, donc "instabilité"... non? :??:

mood
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Posté le   profilanswer
 

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