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Auteur Sujet :

[topik unique] Génétique, biologie moléculaire et structurale.

n°15640694
greentea
Posté le 25-07-2008 à 22:29:00  profilanswer
 

Reprise du message précédent :
Oui, merci  :jap: , Yvounet me les a envoyés.
Merci encore Yvounet. :jap:


Message édité par greentea le 25-07-2008 à 22:42:33
mood
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Posté le 25-07-2008 à 22:29:00  profilanswer
 

n°15673080
Rasthor
Posté le 29-07-2008 à 16:02:57  profilanswer
 


Si tu veux faire de la bioinfo, apprendre un langage de script tu devras.
Le Python est très bien (y'a le livre de Swinnen en libre téléchargement). Mais tu devras aussi avoir des bases de Perl, c'est incontournable.

n°15690286
Rasthor
Posté le 31-07-2008 à 05:17:27  profilanswer
 

Je connais, mais je ne maitrise pas. Pourquoi la question ?

n°15692416
the veggie​ boy
Who's taking my Lorazepam?
Posté le 31-07-2008 à 12:07:37  profilanswer
 

lechewal a écrit :

mh, en fait je cherche des Mitogen-activated protein kinase (MAPK) pathway. (donc un chemin dans un réseau d'interaction de protéines).
 
 
j'ai trouvé ca : http://www.genome.jp/dbget-bin/www [...] y+hsa04010
mais c'est trop compliqué pour moi. Il me faut un truc du genre :
 
proteine1 proteine2
proteine1 proteine3
proteine3 proteine4
 
ou chaque ligne correspond a une interaction :o


http://www.brc.riken.jp/lab/dna/en [...] pk_ras.png
 
ça, ça te va ? :??:
c'est comme ça que je l'avais vu au cours je crois [:dawa]


---------------
blacklist
n°15692550
the veggie​ boy
Who's taking my Lorazepam?
Posté le 31-07-2008 à 12:18:43  profilanswer
 

j'ai juste tapé map kinase dans google images [:cupra]


---------------
blacklist
n°15713684
Profil sup​primé
Posté le 02-08-2008 à 16:29:36  answer
 

ca?!
 
http://bioweb.wku.edu/courses/biol566/Images/tk025.jpg
 
 
apres ca depend de l utilisation de la cascade des map chinase, recepteurs, transcription, gestion du metabolisme, du cycle cellulaire...

Message cité 1 fois
Message édité par Profil supprimé le 02-08-2008 à 16:38:06
n°15713964
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 02-08-2008 à 17:26:01  profilanswer
 


 

lechewal a écrit :


mh, ca pourrait. thanks.
 
ce sont des protéines ? Leur séquence d'AA est trouvable ? (je fais un blastp dessus..)
 
comme j'ai dit, mon but c'est de retrouver une chaine de signal typique a l'homme dans le réseau d'interaction de protéines de la mouche.. Après, je suis pas biologiste du tout, donc je galère ;)


 
On avait remarque  :o  

n°15714089
Profil sup​primé
Posté le 02-08-2008 à 17:50:31  answer
 

lechewal a écrit :


mh, ca pourrait. thanks.
 
ce sont des protéines ? Leur séquence d'AA est trouvable ? (je fais un blastp dessus..)
 
comme j'ai dit, mon but c'est de retrouver une chaine de signal typique a l'homme dans le réseau d'interaction de protéines de la mouche.. Après, je suis pas biologiste du tout, donc je galère ;)


 
ben je connais pas bien le metabolisme cellulaire d une mouche...
 
pourquoi entre ces deux types de metabolisme...
 

RykM a écrit :


 
 
 
On avait remarque  :o  


 
 [:ddr555]  
 

n°15718677
Rasthor
Posté le 03-08-2008 à 06:44:00  profilanswer
 

Sinon y'a String DB à essayer: http://string.embl.de/

n°15730183
Profil sup​primé
Posté le 04-08-2008 à 17:00:38  answer
 

lechewal a écrit :

Bon, ce chemin de l'homme :  
http://pix.nofrag.com/3/8/a/22e12d [...] dd874b.png
 
j'ai retrouvé son équivalent homologue chez la mouche  
http://pix.nofrag.com/e/3/6/bf6c4d [...] 7dd740.png
[:shay] a moi le vaccin du cancer du sida !


 
 
le sida est une maladie auto-immune et non un cancer... :whistle:  :lol:

mood
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Posté le 04-08-2008 à 17:00:38  profilanswer
 

n°15730633
syr01
Hystérie connective
Posté le 04-08-2008 à 17:41:55  profilanswer
 


double [:prozac]

 
Spoiler :

edit : à moins que j'ai raté quelque chose... [:klemton]


Message édité par syr01 le 04-08-2008 à 17:42:40

---------------
\o/ Haut-fait "Première Page" achevé le 28-05-2011 \o/
n°15730819
syr01
Hystérie connective
Posté le 04-08-2008 à 17:59:19  profilanswer
 

lechewal a écrit :

je précise quand même que c'était une blague hein :o


moui, j'ai donc raté quelque chose :o


---------------
\o/ Haut-fait "Première Page" achevé le 28-05-2011 \o/
n°15730971
Profil sup​primé
Posté le 04-08-2008 à 18:14:05  answer
 

lechewal a écrit :

je précise quand même que c'était une blague hein :o


 
 
elle porte sur quoi ta recherche?
 
 
tu veus etudier les mecanismes des proteines chinases pour quoi, cancer?

n°15731447
bank
grin and bear
Posté le 04-08-2008 à 19:05:12  profilanswer
 
n°15731539
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 04-08-2008 à 19:16:30  profilanswer
 

Le topik a pris un sacre niveau depuis qq jours  :sweat:

n°15731888
the veggie​ boy
Who's taking my Lorazepam?
Posté le 04-08-2008 à 19:58:59  profilanswer
 

lechewal a écrit :

je pourrais te sortir des tas d'interêts bio sexy de mon état de l'art. Mais ca serait vraiment de l'esbroufe ;)
 
je m'interesse plus au côté algorithmique du problème, dans les réseaux d'interactions de protéines en général.


Moi ça m'intéresse  :hello:  
 
Tu peux détailler stp ? Merci :)


---------------
blacklist
n°15732011
Rasthor
Posté le 04-08-2008 à 20:13:42  profilanswer
 

lechewal a écrit :

je pourrais te sortir des tas d'interêts bio sexy de mon état de l'art. Mais ca serait vraiment de l'esbroufe ;)
 
je m'interesse plus au côté algorithmique du problème, dans les réseaux d'interactions de protéines en général.


Ah, tu veux faire de la "systems biology" ? :D

n°15733446
the veggie​ boy
Who's taking my Lorazepam?
Posté le 04-08-2008 à 22:09:38  profilanswer
 

Rasthor a écrit :


Ah, tu veux faire de la "systems biology" ? :D


j'en ai fait  [:shay]  
'fin j'ai eu cours là-dessus et j'ai péniblement fait 11 :whistle:

lechewal a écrit :


dequoidonc ? les interets pipo ou les problemes algo ? :o
 


les problèmes algo.
Si je me bouge le cul ces jours-ci et que je ne foire pas mes exams, je devrai choisir un sujet de tfe dans quelques mois, et mon cursus c'est plutôt info/bioinfo/trucs du style... ;)
Y'a notamment des sujets proposés qui traitent de réseaux d'interactions et autres joyeusetés du style.


---------------
blacklist
n°15735312
Profil sup​primé
Posté le 05-08-2008 à 01:22:42  answer
 

bank a écrit :


 
kinases :o


 
 
 
 [:cosmoschtroumpf]
 
 
 

Citation :

je m'interesse plus au côté algorithmique du problème, dans les réseaux d'interactions de protéines en général.


 
 
ok


Message édité par Profil supprimé le 05-08-2008 à 01:23:19
n°15736009
Rasthor
Posté le 05-08-2008 à 05:50:08  profilanswer
 

Pour ceux qui regardent les réseaux d'interaction, aller faire un tour sur "String" (http://string.embl.de). C'est pas mal du tout et très visuel (notamment les structures 3D dans les boules.). Regardez MyD88 chez l'human, ça donne un bon exemple. :)


Message édité par Rasthor le 05-08-2008 à 06:09:20
n°15841447
yamazaki
Still just a rat in a cage?
Posté le 14-08-2008 à 13:05:39  profilanswer
 

Pour les master BioInfo, y'en a un très bon à Montpellier.
 
:ouch: Pour l'article sur la momosexualité dans PLoS!!!!
Ca me fait toujours bizare ce genre d'études!!
 
Sinon, petite question sur les traitements statistiques de vos données biologiques: vous passez tous par R? C'est vraiment devenu indispensable? Y'aurait pas des textes réellement simples d'accès, ou juste des tableaux simplifiés du genre : test de shapiro=> p value > 5%, allez page 2; p value < 5%, allez page 3.... Parce qu'en gros, j'en chie comme un voleur...  :sweat:

n°15841578
Yvounet2
Posté le 14-08-2008 à 13:14:11  profilanswer
 

yamazaki a écrit :


Sinon, petite question sur les traitements statistiques de vos données biologiques: vous passez tous par R? C'est vraiment devenu indispensable?


 
R c'est très bien, sinon en payant il y a SAS qui a bonne réputation, même si je ne m'y suis jamais mis.

n°15844024
Profil sup​primé
Posté le 14-08-2008 à 16:08:14  answer
 

En moins "barbu" comme software, y a StatSoft Statistica qui est plutôt agréable à utiliser :miam: et gros avantage, l'aide du logiciel est un vrai didacticiel avec exemples commentés etc.  [:leif erikson]


Message édité par Profil supprimé le 14-08-2008 à 16:09:14
n°15847937
Rasthor
Posté le 15-08-2008 à 00:04:42  profilanswer
 

:lol:
 
La seule activité que je verrais, c'est la bioinformatique pour 5000€ (le prix d'un bon ordi et d'une machine à café). Et encore, il faudra disposer d'un super-calculateur à un moment ou un autre.
 
Pour le travail, c'est pas dur si tu sais te vendre, si tu es compétent et si tu peux bouger. Y'a plein de compagnie qui recrute ton profil, entre les compagnies d'agro-alimentaire (Monsanto, Nestlé, Danone, etc...), les pharma (Sanofis, Novartis, Roche, Serono, etc...), les laboratoires médicaux, les cosmétiques (Ushuaia, etc...).
Ton niveau bac+4/5 correspondrait à un Bachelor+Master. Un truc à faire serait de demander à faire un stage dans une boite que tu aimerais intégrer par la suite. C'est plus facile d'avoir un stage, car moins bien payé et de courte durée, mais si tu fais tes preuves, tu peux ensuite espérer un job.
Sinon y'a la possiblité de faire un Master en Technologie, qui correspond vaguement à un MBA. Et là aussi, y'a pas mal de place à prendre.
 
Mais je pense que l'idée de te mettre à ton compte pour 5000€, tu peux oublier. Normalement, pour se mettre à son compte, cela se passe comme ça: un biologiste bosse dans une université sur un projet, d'intérêt si possible économique (médical, agronomie). Il voit que son travail apporte une avancée intéressante. Il dépose un brevet avec son collègue, ou son chef. Ensuite ils préparent un business plan solide et complet. Et pour finir, ils vont à la banque demander des sous, beaucoup de sous sinon c'est pas crédible, pour monter une start-up ou une spin-off et exploiter ce projet.
 
Selon le même principe, tu pourrais aussi monter ton labo, en empruntant à la banque. Le problème est que tu n'apporteras rien de nouveau par rapport aux autres.
 
Regarde du coté des annonces en Suisse. J'ai un lien, je pourrais le mettre ici si je le trouve.

n°15850474
yamazaki
Still just a rat in a cage?
Posté le 15-08-2008 à 12:22:51  profilanswer
 

Pas grand chose à rajouter. Si tu n'es qu'en licence: prends déjà le temps de terminer, de voir comment tu te classes en M1, de valider ton M2. Ensuite, oui, la plupart du temps le semestre de printemps de M2Pro est un stage de 6mois, dont tu peux espérer qu'il débouche sur un CDD ou même un CDI. D'où l'importance de se lancer très tôt à la recherche d'un stage, de prendre des contacts... A compétences égales, si tu es déjà présent dans la boite, c'est du tout bénèf.
Ensuite, il s'agit d'un milieu en pleine expension, et à la fois, très fermé. Les quelques noms qui comptent sont très connus, et débarquer comme ça, directement en sortie d'études, ça demande de la foi, de la chance, un travail colossal.... et une bonne dose d'inconscience.
Du coup, 5000€, de toute façon, rien n'est envisageable. Même 50.000€, c'est peu pour lancer une activité.
C'est très bien d'être motivé, et il y a beaucoup d'aides à la création d'entreprise, et tu peux toujours aller te renseigner du coté de la chambre du commerce ou d'associations qui aident et guident dans ce cas là, mais AMHA, tu vises très loin, sans avoir d'idée précise (pourquoi ton entreprise? qu'est-ce qu'elle apporte face à la concurrence? comment elle s'insère dans la communauté? quelles sont ses cibles? autant de questions auxquelles tu ne peux répondre qu'en connaissant la réalité du monde du travail dans ce milieu, pas par les cours), juste par anxiété par rapport aux débouchées... Si tu restes attentif à ton panneau d'affichage, tu constateras qu'il y a très régulièrement des forum, des réunions, des conférences de divers intervenants, sur des thèmes variés, et souvent autour des débouchées justement.
Bon courage! Mais ne place pas la charrue avant les boeufs! :jap:


Message édité par yamazaki le 15-08-2008 à 12:24:59
n°15854263
yamazaki
Still just a rat in a cage?
Posté le 15-08-2008 à 19:30:49  profilanswer
 

Oui, L3 et M1 sont plus propices pour obtenir des stages. Après, les stages, c'est comme partout ailleurs: être là le premier, être insistant, essayer d'avoir un contact direct avec les gens plutôt que des lettres de candidature spontannée...  
Ce que j'ai vu, pour obtenir des stages: les étudiants qui viennent à la fin de cours parler à un de leur prof, qui peuvent les prendre ou les orienter/conseiller/présenter; les gens qui ont des parents dans une boite. Mon cas a été un peu spécial. J'ai rencontré mon maitre de stage par MP sur un forum de motard sur Lyon, et j'ai eu l'occasion ensuite d'aller le rencontrer et d'obtenir un stage. (l'ai eu comme prof par la suite, et ça fait bizare)
Donc à privilégier: le contact direct. Tu laisses une empreinte plus forte, le responsable se rappel de ton visage, tu as l'occasion de laisser une impression plus marquante (en bien comme en mal :whistle:)... Être sympa, sans fanfaronner. Ne pas hésiter à poser des questions... Et c'est pas ce qui manque le boulot, même pour des stagiaires avec peu de capacités. Ce qui manque, c'est plus les thésards ou titulaires ou ATER pour encadrer (je parle en milieu fac, je connais pas encore le privé), et les fonds pour éventuellement rémunérer (et parfois pour que tous aient du matos valable).
 
Après, les métiers de la communication dans le domaine scientifique, ça peut paraitre la panacée avec toutes les séries qui reposent sur des bases scientifiques, la façon en général dont on parle plus de science au grand public, mais il y a très peu de postes en général dans ce domaine, et on demande plus une ouverture d'esprit sur l'ensemble des domaines qu'une connaissance ultra-pointue sur un thème donné.
Perso, je vais passer le concours de l'école de journalisme de Lille, qui propose une voie "scientifique", qui est un M2Pro, un ancien DESS.

n°15873596
Profil sup​primé
Posté le 17-08-2008 à 21:54:59  answer
 

Rasthor a écrit :

Normalement, pour se mettre à son compte, cela se passe comme ça: un biologiste bosse dans une université sur un projet, d'intérêt si possible économique (médical, agronomie). Il voit que son travail apporte une avancée intéressante. Il dépose un brevet avec son collègue, ou son chef. Ensuite ils préparent un business plan solide et complet. Et pour finir, ils vont à la banque demander des sous, beaucoup de sous sinon c'est pas crédible, pour monter une start-up ou une spin-off et exploiter ce projet.


 
Ça arrive vraiment ça ? T'aurais des exemples ? Ça m'intéresse.

n°15881537
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 18-08-2008 à 16:37:50  profilanswer
 

Et au fait les loustiques, je serai a Lausanne pour une conf' Jeudi prochain et jusqu'au Dimanche  [:nidnogar]  
 
Partant pour une binouze ? :o

n°15883680
Cardelitre
ಠ_ಠ ۞_۟۞ ┌( ಠ_ಠ)┘ סּ_סּ
Posté le 18-08-2008 à 19:55:45  profilanswer
 

RykM a écrit :

Et au fait les loustiques, je serai a Lausanne pour une conf' Jeudi prochain et jusqu'au Dimanche  [:nidnogar]  
 
Partant pour une binouze ? :o


Normalement je serai sûr Genève ces jours ci, mais si je reviens dans les parages pourquoi pas... :D


---------------
Intra-Science  -  To thine own self be true
n°15887791
WestCoast8​5
Posté le 19-08-2008 à 08:18:45  profilanswer
 

[:drap]

n°15892253
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 19-08-2008 à 15:41:38  profilanswer
 

Cardelitre a écrit :


Normalement je serai sûr Genève ces jours ci, mais si je reviens dans les parages pourquoi pas... :D


 
J'ai toute ma journee du Dimanche de libre, on se tient au courant  [:dao]

n°15898711
Rasthor
Posté le 19-08-2008 à 23:28:12  profilanswer
 

Je prend une option éventuelle. :O

n°15938438
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 23-08-2008 à 00:26:29  profilanswer
 

Putain Lausanne  :love:  :love:  :love:  
 
Je crois que je vais faire post-doc par ici  :whistle:

n°15950343
Rasthor
Posté le 24-08-2008 à 13:48:39  profilanswer
 

RykM a écrit :

Putain Lausanne  :love:  :love:  :love:  
 
Je crois que je vais faire post-doc par ici  :whistle:


Ca déchire hein ? :D

n°15952196
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 24-08-2008 à 17:05:14  profilanswer
 

Bon j'ai du repartir, bcp de manip' apres cette conf'... et 3 propositions de post-doc, dont une a Geneve  :love:

n°15976901
Aquineas2
Damoiseau
Posté le 26-08-2008 à 19:38:25  profilanswer
 

Bon, suite a une discussion lors du dejeuner, plusieurs avis ont ete partages sur l'animal qui possederait l'adn le plus proche de celui de l'homme : certains pensent qu'il s'agit du porc, d'autre du chimpanze. Les sources d'information semblent limiter, nous sommes "seulement" tombes sur un article de Nature qui penchait pour le chimpanze. vous auriez d'autres informations/sources a ce sujet?


---------------
Le marketing aussi peut être solidaire. | La passion des p'tites images
n°15977734
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 26-08-2008 à 21:08:52  profilanswer
 

C'est une question serieuse ?  :D

n°15977752
Rasthor
Posté le 26-08-2008 à 21:10:38  profilanswer
 

Aquineas2 a écrit :

Bon, suite a une discussion lors du dejeuner, plusieurs avis ont ete partages sur l'animal qui possederait l'adn le plus proche de celui de l'homme : certains pensent qu'il s'agit du porc, d'autre du chimpanze. Les sources d'information semblent limiter, nous sommes "seulement" tombes sur un article de Nature qui penchait pour le chimpanze. vous auriez d'autres informations/sources a ce sujet?


C'est clairement, et de loin, le Chimpanze le plus proche de l'homme. :jap:

n°15977778
masklinn
í dag viðrar vel til loftárása
Posté le 26-08-2008 à 21:14:25  profilanswer
 

Aquineas2 a écrit :

Bon, suite a une discussion lors du dejeuner, plusieurs avis ont ete partages sur l'animal qui possederait l'adn le plus proche de celui de l'homme : certains pensent qu'il s'agit du porc, d'autre du chimpanze. Les sources d'information semblent limiter, nous sommes "seulement" tombes sur un article de Nature qui penchait pour le chimpanze. vous auriez d'autres informations/sources a ce sujet?


Il n'y a strictement aucune question à ce sujet, c'est de très très loin le chimpanzé (rappel: les humans sont des primates, les cochons pas du tout [:petrus75])

 

encore une connerie issue de gens qui prennent Werber pour un scientifique [:sisicaivrai]

 

Le Père de nos pères c'est un roman (assez moyen d'ailleurs) pas un article scientifique [:petrus75]


Message édité par masklinn le 26-08-2008 à 21:16:17

---------------
I mean, true, a cancer will probably destroy its host organism. But what about the cells whose mutations allow them to think outside the box by throwing away the limits imposed by overbearing genetic regulations? Isn't that a good thing?
n°15977958
Aquineas2
Damoiseau
Posté le 26-08-2008 à 21:31:23  profilanswer
 

Bah enfait y'a cette histoire que pour certaines greffes, les organes de porcs sont compatibles, donc du coup les gens pensent que c'est lie au genome...


---------------
Le marketing aussi peut être solidaire. | La passion des p'tites images
n°15978645
Svenn
Posté le 26-08-2008 à 22:17:19  profilanswer
 

Aquineas2 a écrit :

Bah enfait y'a cette histoire que pour certaines greffes, les organes de porcs sont compatibles, donc du coup les gens pensent que c'est lie au genome...


 
Les chimpanzés sont bien sur aussi compatibles mais il y a des milliers de raisons non biologiques mais tout à fait valables qui font qu'on préfère utiliser le porc plutôt que le chimpanzé.

mood
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