Reprise du message précédent :

 
Non non c'est très drôle, je propose qu'on se fasse passer pour des employés d'un grand semencier.

"Bonjour, je bosse pour une firme agro-semencière américaine et je ne peux vous laisser dire cela :"

et avec qq remarques simili-subtiles du type "nham tu sais qu'on est pas censé parler de ça ici "

Clair, mais je serais plutôt contre les OGM en fait.
Tout dépend des gènes modifiés, de la portée que ça peut avoir sur l'environement et/ou sur la santé.
Imagine un OGM qui a des facilités de prolifération, ça pousse comme rien, comment tu désherbe?
bon je t'avouerais que je connais pas d'OGM de ce type.

Il y a un joli travail dans Nature sur le proteasome, ils ont fait de la RMN en dynamique sur le complexe entier (670 kDa, les connaisseurs apprecieront !). Rien que pour l'exploit technique, ca meritait d'etre souligne    
 

Svenn ==> on peut esperer faire des cristaux a partir de quel quantite ?    
 
Qq mg, des dizaines, des centaines, plusieurs grammes ( ) ???

 
Si tu es capable de produire de l'ordre de 1 mg de proteine purifiee par semaine, ca devient tres raisonnable en travaillant "a l'ancienne". Mais ce n'est pas une science exacte, ca depend beaucoup de la proteine (et de la chance, il faut etre honnete !). J'ai vu des personnes s'en sortir avec 200 ug/semaine pendant 2 mois et d'autres ramer pendant deux ans a 1mg/semaine.
 
Sur les deux-trois dernieres annnees, des robots de cristallisation sont apparus et ils sont en train de changer la donne. Avec la meme quantite de proteine, tu peux quasiment tester dix fois plus de conditions. C'est tres pratique notamment pour realiser les "screens" initiaux. 1 mg de proteine (voire 500 ug) permet de tester 500 conditions differentes, ce qui est suffisant pour savoir si ta proteine est "cristallisable" ou pas. Si la reponse est positive, quelques mg de plus devraient suffire. Si la reponse est negative, rien n'est perdu, il y a des milliers de chose a tenter pour avoir quelque chose de cristallisable (ameliorer la purification, complexer la proteine avec un ligand/cofacteur, utiliser des proteines homologues, eventuellement digerer par proteolyse menagee les parties non structurees de la proteine, etc...)
 
Si tu as la sequence de ta proteine et que ce n'est pas trop secret, on peut passer en MP, je te dirai ce que j'en pense  

Je dois avouer mon incompétence notoire depuis que je ne me tiens plus au courant...
c'est quoi le principe de la RMN dynamique par rapport à la RMN classique?

 
tu suis l'evolution de tes molécules au cours du temps (dégradation physique, transposition de proton, equilibre inter/intra molecules avec des liaisons H ou autres  ayant un impact sur le moment dipôlaire de tes fragments)
 
En chimie par exemple il peut s'agir de determiner des cinétiques de réaction (orga, bioch,...) ou d'orientation de chaines ( polymères cristallins/cristaux liquides/...)
 
 
sitekilestbien http://www.spectroscopynow.com/coi [...] 1#2D%20NMR

 
C'etait juste par curiosite car apres m'etre bien battu pour l'avoir soluble et pure, je m'rend compte que j'en ai plusieurs mg...  
 

 
Dans ce cas, n'hesite surtout pas    
 
Juste un truc par contre : dans beaucoup de cas, la cristallisation marche mieux avec de la proteine fraiche (jamais congelee, et purifiee il y a moins de 48 heures)    
 
Pour la proteine avec laquelle j'ai travaille, voila mes stats pour mes deux meilleures formes cristallines (sachant que j'utilise des inhibiteurs de protease et de l'azide) :
 
- Gouttes preparees immediatement apres la purif : cristaux diffractant a 2.4 A / Cristaux a 3.2 A
- A 1 jour : 2.5 A / 3.7 A
- A 2 jours : 2.7A / 4.3 A
- A 4 jours : 3.5 A / pas de cristaux
- A 1 semaine : pas de cristaux  / pas de cristaux

"Metaphors Be with You !"
 
Si meme Science se met a troller le vendredy, on n'est pas sorti  

Cela dit, y a un article que j'ai bien aime sur le recepteur de la vitamine A. Je sais pas pourquoi, mais j'ai toujours ete passionne par tout ce qui tourne autour du retinol. Si on me propose un truc la-desssus pour mon huitieme post-doc, j'aurai sans doute beaucoup de mal a resister

 
Je plussoie, ma mienne, elle ne supporte pas d'être reconglée, elle diffracte plus après (mais continue de faire de zolis cristaux).
 
 

Tiens, je viens de tomber sur une news assez intéressante dans Nature, où la dame explique pourquoi les physiciens bornés c'est caca.
 
http://www.nature.com/nature/journ [...] 45603a.pdf
 
Elle a fait un bouquin, ça me dirait bien de le lire, ya kkun qui connait ? qui a ? qui sait où le trouver ?
 
http://www.amazon.com/Making-Sense [...] 0674007468

 
Je ne connais pas le bouquin, par contre j'avais lu son point de vue. Globalement, je suis asssez d'accord avec elle et je ne pense pas que la biologie s'embarasse de regles qui impliqueraient l'ensemble du vivant (en dehors des lois de la physique et de la chimie bien sur). Mon avis, c'est qu'il est souvent interessant de briser les "regles biologiques" pour gagner un avantage evolutif decisif. Par exemple, les premieres formes de "vie" ont probablement utilise de l'ARN. Apparait au milieu de tout ca une bacterie (ou plutot un virus, ceux-ci etant probablement plus aptes a "survivre" a des mutations majeures) a ADN. Celle-ci devient resistante a toutes les RNAses au contraire de toutes les autres formes de vie. Avantage tres certainement decisif.
 
A mon avis, ce n'est pas un hasard si toutes les lois biologiques sont truffees d'exception.  

Sauf la loi de l'évolution, comme fait remarqué la dame, la seule qui soit vraiment solide, ce qui est compréhensible compte tenu de son rôle dans la vie même.

 
La "loi de l'evolution" est effectivement a part. Mais en ce qui concerne l'organisation des etres vivants, que ce soit au niveau de l'organisme, de la cellule ou meme des macromolecules, j'ai du mal a distinguer des principes unificateurs. En cherchant bien, on peut en trouver quelques uns : par exemple, malgre leur diversite toutes les polymerases -a ma connaissance sans exception- vont du 5' vers le 3', mais on ne voit pas pourquoi l'inverse ne serait pas possible et accessoirement, ca fait un peu leger comme principe unificateur quand on compare a la poignee de lois dont decoule toute la physique.

C'est même pas une "loi" au sens physique... sans doute pour ça que c'est aussi robuste, en fait...

 
Ben, c'est quand même la transcription pour ce qu'on considère être de la matière vivante, d'un certain nombre de 'lois' physiques fondamentales considérées comme vraies : seul ce qui dure existe, ce qui dure le plus longtemps existe plus, mais quand même le temps passe. Enfin, je me comprends. Ou pas.

Monsieur, vous êtes fou.

Pour les barbaro-biologistes  que ça pourrait intéresser
 

NODPERCEPTION:  
Description of Post-doc position
 
Type of position: Post-doc fellowship
Funding: Two years from 1st March 2007 on the European Community’s Marie Curie Research Training Network Programme.
 
Institute address: CERMAV-CNRS
BP53
38041 Grenoble cedex 9 France
Telephone number :+ 33 476 037 664
Fax number :+ 33 476 547 203
Web site: http://www.cermav.cnrs.fr/
Head of Department: Dr. R. Borsali
Project supervisor: H. Driguez  
E-mail of supervisor:hugues.driguez@cermav.cnrs.fr
Title of project: Chemo-enzymatic synthesis of lipochitooligosaccharides.
 
Project description:  
Legumes play an important role in agricultural and ecological systems due to their ability to form a symbiotic association with rhizobia (the legume-rhizobia symbiosis). These soil bacteria produce lipochitooligosaccharides (Nod factors) that induce root nodules in which they fix atmospheric nitrogen thus allowing legumes to grow independently of an added nitrogen source. The aim of the NODPERCEPTION project is to use an integrated interdisciplinary approach to identify the molecular mechanisms by which rhizobial symbionts are perceived by their legume hosts to initiate nodulation and infection.  
 
The post-doc position is as follows: To determine the mechanisms(s) of legume-rhizobia partner specificity several lipochitooligosaccharides have to be designed and prepared by chemo-enzymatic approaches. “Decorated” chito-tetramers and pentamers will be produced using recombinant E. coli harboring rhizobial genes. These molecules will be chemically N-acylated using classical methods used in peptide chemistry. The syntheses of chito-hexamers and heptamers as well as new lipo-chitooligosaccharidic probes (with fluorescent groups or other tags) will be the major task of this project. The candidate should develop efficient methods for the synthesis and the purification of these molecules and liaise with other groups in the network.
 
Project methods:
Enzymatic synthesis, chemical synthesis, purification of organic molecules, NMR characterisation.  
 
Relevant publications of the laboratory on this topic:
P. GROVES, S. OFFERMANN, M.O.RASMUSSEN, B. HOGG, F.J. CAÑADA, J.J. BONO, H. DRIGUEZ, A. IMBERTY & J. JIMENEZ-BARBERO  
The relative orientation of the lipid and carbohydrate moieties of lipochitooligosaccharides related to nodulation factors depends on lipid chain saturation  Org. Biomol. Chem., 3(8), 2005, 1381-1386  
 
M. OHSTEN RASMUSSEN, B. HOGG, J.J. BONO, E. SAMAIN & H. DRIGUEZ  
New access to lipo-chitooligosaccharide nodulation factors  Org. Biomol. Chem., 2, 2004, 1908-1910  
 
Go to the website of the GBO team   http://www.cermav.cnrs.fr/equipes/glycochimie_gb.htm
Marie Curie Research Training Network Programme
“An integrated, interdisciplinary approach to Nod factor perception - NODPERCEPTION”
 
Recruits for 2 years
In Grenoble in the heart of the French Alps
 
A Post-doc in chemo-enzymatic synthesis of oligosaccharides
 
Contact hugues.driguez@cermav.cnrs.fr
 
 
 
Terms and Conditions
 
1. Mobility and Nationality
 
Candidates must not be French nor have worked in France for more than 12 months in the last 3 years. They must have a PhD and less than 10 years research experience.
 
2. Renumeration
 
Successful candidates will be recruited on employment contracts, on a salary of about 49000 Euros per year (rates determined by the EC). The successful candidate will also receive a mobility allowance of 500 Euros per month, plus travel allowances and a career exploratory award.  
 
3. Selection criteria
 
The candidate will be selected primarily on the basis of research potential, taking into account qualifications and experience. Recruitment will be made on an equal opportunity policy with the aim of recruiting a representative gender balance and a balance of nationalities in the network. Female candidates are encouraged to apply.
 
For further information see:
 
http://medicago.toulouse.inra.fr/NODPERCEPTION/

 

Ouais, viendez à Grenoble, on pourra se faire des sôteries, et je pourrai peut-être faire comme si j'avais un ami

50 000 roros par an    
 
C'est plus que mon boss  

Chez nous c'est peanuts...

 
pkoi tu crois que j'ai posté l'offre à ton avis

Tiens y'a un candidat pour un post-doc qui vient de l'ISREC auj.... je vais avoir qq questions a lui poser  

edit: un article qui va plaire a Svenn dans Nature auj:
http://www.nature.com/nature/journ [...] 05580.html

 
J'ai vu l'article. Sur le plan fondamental l'article n'apporte pas grand chose, mais d'un point de vue therapeutique il pourrait ouvrir la voie a une nouvelle classe de molecules anti-hiv, dirigees contre gp120. L'avantage de ce type de cibles therapeutiques, c'est que la molecule active n'a pas de membrane biologique a traverser et qu'elle est donc directement fonctionnnelle apres injection. Il faut voir a present si cette cible est reellement utilisable dans un cadre therapeutique ou pas  

Quelqu'un pourrait me choper cet article ?
 
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez [...] t=Citation

ça a l'air marrant...
Fait tourner.

Petite question pour les suisses du bas: Y a t'il des labos cristallo ou modélisation moléculaire / drug design à conseiller sur Geneve/Lausanne ?

Le seul qui me vienne en tête c'est le labo de Manfred Mutter à l'ISIC. Je pense qu'il y en a d'autres mais c'est pas du tout dans mon domaine donc je connais pas trop sorry...

 
Personne ?

 
J'ai acces a un paquet de revues, mais pas la tienne

Pareil, désolé (et c'est pas parceque c'est en allemand hein ;-) ).

Desole Haephi  

« Les pays industrialisés souffrent d'un illettrisme scientifique préoccupant »
 
source: AFP | 19.02.2007 | 11:36
 
Extraits:
 
..."La réalité est qu'aucun des grands pays industrialisés aujourd'hui ne compte un nombre suffisant d'adultes scientifiquement lettrés", a déploré Jon Miller, un expert de l'éducation, professeur à l'Université du Michigan (Nord) Aux Etats-Unis, le public a davantage de connaissances scientifiques de base qu'il y a vingt ans grâce à l'obligation depuis plusieurs années pour tous les étudiants dans les universités de suivre un cours de science générale, selon cet expert...
 
...En 2001, 53% des Européens estimaient que l'astrologie était "plutôt scientifique" contre 31% la jugeant "absolument pas scientifique", a-t-il dit notant cependant qu'il pourrait aussi y avoir une confusion dans les termes, chez de nombreuses des personnes interrogées qui ont paru confondre astronomie et astrologie.
 
Pour Carol Susan Losh, sociologue de l'université de Floride (sud est), l'attrait pour la pseudoscience peut s'expliquer par le fait que cela parle du sens de la vie et des émotions, des sujets sur lesquels la science n'a pas de réponse. Elle a noté que la lecture de l'horoscope est plus populaire chez les femmes.
 
Le fait que la pseudoscience ne soit pas discutée dans le cadre scolaire aggrave ce phénomène, selon elle.
 
Selon Jon Miller, la science au 21 siècle "sera moins neutre émotionnellement alors que les avancées génétiques et en biologie commencent à lever les mystères sur les origines de l'homme" et ce en conflit direct avec nombre de croyances religieuses.[...]"Même en tant que citoyen, une culture scientifique minimum est indispensable pour pouvoir comprendre les grandes questions actuelles, comme celle des cellules souches embryonnaires dans la recherche", a-t-il ajouté.

Oh ptin le pavé...
 
Quel est ton but?
what is your favorite color?

je veux bien vous filer votre article, mais dites moi comment ! (surement pas en le recopiant ni en décrivant les figures une par une !!)

je parlais du curr biol C elegans, pas le truc allemand ça c'est introuvable !
à bon entendeur...