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Auteur Sujet :

[topik unique] Génétique, biologie moléculaire et structurale.

n°9970765
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 17-11-2006 à 21:05:09  profilanswer
 

Reprise du message précédent :
J'espere que je vais pas etre oblige de passer au bacculo  :sweat:

mood
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Posté le 17-11-2006 à 21:05:09  profilanswer
 

n°9971181
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 17-11-2006 à 21:44:26  profilanswer
 

[:haha]

Message cité 1 fois
Message édité par NHam le 17-11-2006 à 21:45:46

---------------
La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
n°9971469
Profil sup​primé
Posté le 17-11-2006 à 22:08:37  answer
 

RykM a écrit :

J'espere que je vais pas etre oblige de passer au bacculo  :sweat:


Bas ou pas, faut toujours y aller au culot :o

n°9971953
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 17-11-2006 à 22:51:38  profilanswer
 


 
 
 
Merci de votre soutien, les gars  :o

n°9972237
ElfiK
Make U'r choice Oo'
Posté le 17-11-2006 à 23:12:55  profilanswer
 

NHam a écrit :

Mets un signale d'excrétion. [:ddr555]


La synthèse chimique voyons, y'a que ça de vrai.   :D

n°9973655
Hephaestos
Sanctis Recorda, Sanctis deus.
Posté le 18-11-2006 à 08:25:08  profilanswer
 

Tiens d'ailleurs, ça ressemble à quoi la synthèse de protéines en 2006 ?

n°9973663
pepette340
Posté le 18-11-2006 à 08:32:16  profilanswer
 

Hephaestos a écrit :

Tiens d'ailleurs, ça ressemble à quoi la synthèse de protéines en 2006 ?


 
 
OUi...C'est légitime comme question...
 
Ohhhh, tu sais c'est toujours pareil: transcription- traduction....Quoi qu'en 2006 c'est peut-etre censuré ca aussi???? :bounce:  :??:  :??:

n°9973671
Hephaestos
Sanctis Recorda, Sanctis deus.
Posté le 18-11-2006 à 08:38:12  profilanswer
 

Nan, mais je veux dire de la vraie synthèse, sans utiliser des polymérases préfabriquées par Dieu en personne...

n°9973683
pepette340
Posté le 18-11-2006 à 08:51:52  profilanswer
 

Hephaestos a écrit :

Nan, mais je veux dire de la vraie synthèse, sans utiliser des polymérases préfabriquées par Dieu en personne...


 
 
Je pourrais te parler de l'ajout d'une coiffe du 7-méthylguanosine triphosphate à l'extrémité 5' et d'une queue poly-A (50 à 250 nucléotides d'adénine) à l'extrémité 3', amis j'avoue, c'est rebarbatif... :bounce:  :bounce:  
 
Ceci dit, je pense que c'est comme jadis: ces fameux acides aminés présent dans cytoplasme, qui s'isolent toujours dans un coin (ah qu'ils sont timides ceux là) vont etre guidés par l'information génétique contenu dans l'ADN (oui ils ont fait leur preuves ce sont de bons guides!) pour ensuite faire une transcritpion (transformation) de l'ADN en ARNmessager (oui eux aussi ils ont plusieurs entreprises de messagerie).
 
Oui c'est vrai qu'il ne donne pas comme ca le diplome de ARN messager il faut d'abord qu'il ARNpremessager ensuite il devient pro!.
 
Bon il est diplomé!
 
Alors transcription dans le noyau et traduction dans reticulum endoplasmique: oui ils sont un peu sectaire, rien qu'entre eux!!!
enfin ca depend aussi si on est chez un eucaryote ou un procaryote!...ici on se melange po!
 
Et voilà, c'est la chaine d'ARNm qui va s'appeller Proteines...
 
 
 :love:  :love:  :love:  :love:  
 
 
 

n°9973692
pepette340
Posté le 18-11-2006 à 08:59:10  profilanswer
 

NB: je parle bien sur de recherches et manipulations fait par le CERn, en dehors de la sainte main de notre Dieu en personne....

mood
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Posté le 18-11-2006 à 08:59:10  profilanswer
 

n°9973694
Hephaestos
Sanctis Recorda, Sanctis deus.
Posté le 18-11-2006 à 08:59:39  profilanswer
 

Nan mais en fait, je parlais de protéines, pas d'ADN, je sais qu'on y arrive assez bien à synthétiser de gros bouts d'ADN (ou d'ARN).
 
Et justement, ma question c'est de savoir ce qu'on arrive à faire en synthèse de protéines sans passer par la retranscription d'ARN.

n°9973702
pepette340
Posté le 18-11-2006 à 09:08:12  profilanswer
 

ah, mais selon toi comment pourrais-tu subsituer les codages complémentaires issu de l'ARN pour arriver à une proteine aussi simple soit-elle????
 
Tu sais bien qu'il ne suffit que d'un seul brin d'ADN pour faire un ARN et apres on est capable de lui coller des bases azotées totalement synthetiques pour faire une proteine.
 
Il me semble que l'enzyme qui remplace l'ARNpolymerase existe en plusieurs facon????celui remplace un à un tous les nucleotides du brin d'ARN en formation???
 
NON???

n°9973764
greentea
Posté le 18-11-2006 à 09:53:18  profilanswer
 

Hephaestos a écrit :

Nan mais en fait, je parlais de protéines, pas d'ADN, je sais qu'on y arrive assez bien à synthétiser de gros bouts d'ADN (ou d'ARN).
 
Et justement, ma question c'est de savoir ce qu'on arrive à faire en synthèse de protéines sans passer par la retranscription d'ARN.

Suis pas spécialiste, mais on peut fabriquer par réaction chimique au moins des peptides sans utiliser la machinerie cellulaire. De là à fabriquer toute une protéine, ça doit être bien casse-tête mais ça doit être faisable (peut être pas aujourd'hui?). Là où ça coince(ra?) c'est pour obtenir le repliement correct de la protéine pour qu'elle puisse être fonctionnelle.
 
EDIT: Pour plus de clarté, quand je dis "par réaction chimique sans utiliser la machinerie cellulaire", c'est-à-dire sans utiliser ni ADN, ni ARN.

Message cité 1 fois
Message édité par greentea le 18-11-2006 à 09:57:00
n°9973768
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 18-11-2006 à 09:54:51  profilanswer
 

Hephaestos a écrit :

Nan, mais je veux dire de la vraie synthèse, sans utiliser des polymérases préfabriquées par Dieu en personne...


La synthèse peptidique c'est fun, mais c'est le bordel. :/
Enfin tu  dois savoir ça môssieur le chimiste :p


---------------
La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
n°9973775
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 18-11-2006 à 09:57:23  profilanswer
 

greentea a écrit :

Suis pas spécialiste, mais on peut fabriquer par réaction chimique au moins des peptides sans utiliser la machinerie cellulaire. De là à fabriquer toute une protéine, ça doit être bien casse-tête mais ça doit être faisable (peut être pas aujourd'hui?). Là où ça coince(ra?) c'est pour obtenir le repliement correct de la protéine pour qu'elle puisse être fonctionnelle.


C'est surtout se faire chier la bite pour rien, alors que tu as des outils boyologiques qui font le boulot pour toi à des températures modérés, et qu'ils te donnent la protéine spécifique avec le bon repliement en un minimum de temps. [:spamafote]

Message cité 2 fois
Message édité par NHam le 18-11-2006 à 09:57:45

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La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
n°9973781
Cardelitre
ಠ_ಠ ۞_۟۞ ┌( ಠ_ಠ)┘ סּ_סּ
Posté le 18-11-2006 à 10:00:01  profilanswer
 

RykM a écrit :

Clair  [:huit]  
 
A l'ISREC  [:nidnogar]


Sont doués c'est sûr, mais c'est vraiment des gros glands là bas, super mauvaise ambiance... :/


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Intra-Science  -  To thine own self be true
n°9973808
Cardelitre
ಠ_ಠ ۞_۟۞ ┌( ಠ_ಠ)┘ סּ_סּ
Posté le 18-11-2006 à 10:18:04  profilanswer
 

NHam a écrit :

La synthèse peptidique c'est fun, mais c'est le bordel. :/
Enfin tu  dois savoir ça môssieur le chimiste :p


C'est un physichien lui. :o
 
Et sinon pour la synthèse purement chimique de protéine, la méthode la plus communément utilisée à l'heure actuelle qui se passe de systèmes biologiques c'est la méthode de Solid-Phase Peptide Synthesis (SPPS), pour ce que j'en sais.
 
Sinon, pour un state of the art: http://www.sciencedirect.com/scien [...] 0bb870a6a1

Message cité 2 fois
Message édité par Cardelitre le 18-11-2006 à 10:22:59

---------------
Intra-Science  -  To thine own self be true
n°9973813
Cardelitre
ಠ_ಠ ۞_۟۞ ┌( ಠ_ಠ)┘ סּ_סּ
Posté le 18-11-2006 à 10:21:41  profilanswer
 

NHam a écrit :

C'est surtout se faire chier la bite pour rien, alors que tu as des outils boyologiques qui font le boulot pour toi à des températures modérés, et qu'ils te donnent la protéine spécifique avec le bon repliement en un minimum de temps. [:spamafote]


Ouais mais le problème c'est quand tu veux produire des peptides qui sont pas super fits pour les systèmes boyologiques, genre qui ont des acides aminés type D ou des aa atypiques...


---------------
Intra-Science  -  To thine own self be true
n°9973819
pepette340
Posté le 18-11-2006 à 10:26:01  profilanswer
 

Exactement!
 
CQFD

n°9974088
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 18-11-2006 à 11:36:38  profilanswer
 

Cardelitre a écrit :

C'est un physichien lui. :o


Sans déconner! [:ooooo]
Alors à ton avis pourquoi j'ai mis un " :p " après histoire de le faire bisquer? [:itm]


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La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
n°9974104
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 18-11-2006 à 11:39:22  profilanswer
 

Cardelitre a écrit :

Ouais mais le problème c'est quand tu veux produire des peptides qui sont pas super fits pour les systèmes boyologiques, genre qui ont des acides aminés type D ou des aa atypiques...


Il est manifestement plus simple de modifier un peptide après sa synthèse enzymatique que de le synthétiser directement comme on le veut. [:spamafote]
 
Il y a des pertes de rendement énorme lors de l'élongation de la chaîne, sans compter les diastéréoisomères qu'on obtient et qui sont inintéressants. :/


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La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
n°9974186
Cardelitre
ಠ_ಠ ۞_۟۞ ┌( ಠ_ಠ)┘ סּ_סּ
Posté le 18-11-2006 à 11:53:43  profilanswer
 

NHam a écrit :

Il est manifestement plus simple de modifier un peptide après sa synthèse enzymatique que de le synthétiser directement comme on le veut. [:spamafote]


Ben avec des peptides types D ou incorporation d'aa exotiques, tu peux juste simplement pas les synthétiser biologiquement, donc on parle même pas de post modifications... :D


---------------
Intra-Science  -  To thine own self be true
n°9974506
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 18-11-2006 à 12:47:57  profilanswer
 

Tu peux pas les synthétiser biologiquement, mais tu peux réaliser chimiquement les inversions après la synthèse boyologique. [:dawa]

Message cité 1 fois
Message édité par NHam le 18-11-2006 à 12:48:22

---------------
La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
n°9974545
Cardelitre
ಠ_ಠ ۞_۟۞ ┌( ಠ_ಠ)┘ סּ_סּ
Posté le 18-11-2006 à 12:52:55  profilanswer
 

NHam a écrit :

Tu peux pas les synthétiser biologiquement, mais tu peux réaliser chimiquement les inversions après la synthèse boyologique. [:dawa]


Permuter post-synthèse un aa particulier en centre de chaine peptidique? Mon cul ouais... :o


---------------
Intra-Science  -  To thine own self be true
n°9974772
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 18-11-2006 à 13:26:18  profilanswer
 

Cardelitre a écrit :

Sont doués c'est sûr, mais c'est vraiment des gros glands là bas, super mauvaise ambiance... :/


 
T'as des infos serieuses ?  [:dao]

n°9974774
Hephaestos
Sanctis Recorda, Sanctis deus.
Posté le 18-11-2006 à 13:26:39  profilanswer
 

NHam a écrit :

C'est surtout se faire chier la bite pour rien, alors que tu as des outils boyologiques qui font le boulot pour toi à des températures modérés, et qu'ils te donnent la protéine spécifique avec le bon repliement en un minimum de temps. [:spamafote]


 
Ouais enfin être capable de faire ça à la main ça ouvrirait la possibilités à des tas d'innovations potentiellement très intéressantes.

n°9974779
Hephaestos
Sanctis Recorda, Sanctis deus.
Posté le 18-11-2006 à 13:28:09  profilanswer
 

Voilà, comme il dit Cardélitre en fait, c'est les inversions aa exotiques de type D, par exemple, qu'on peut faire chimiquement alors que biologiquement, non.

n°9974933
Cardelitre
ಠ_ಠ ۞_۟۞ ┌( ಠ_ಠ)┘ סּ_סּ
Posté le 18-11-2006 à 13:55:37  profilanswer
 

RykM a écrit :

T'as des infos serieuses ?  [:dao]


Ben j'y ai bossé quelques mois donc ouais... [:dao]
 
Non y a rien a dire, c'est un coin qui regroupe des types ultra compétents, pour ça y a tout ce qu'il faut.
Par contre niveau ambiance de merde j'ai rarement eu l'occasion de voir pire. Tout le monde se tire dans les pattes, coopération intergroupe inexistante, élitisme merdique (tout ceux qui n'ont pas une liste de publis longue comme le bras sont considérés comme des cafards inexistants, bref).
 
Niveau boulot t'apprendras pleins de trucs avec les meilleurs, niveau humain tu finiras pendu à un lampadaire dans les 2 mois. :o


---------------
Intra-Science  -  To thine own self be true
n°9975025
sir_lune
B3LYP/6-31++G** powered
Posté le 18-11-2006 à 14:11:01  profilanswer
 

Cardelitre a écrit :

C'est un physichien lui. :o
 
Et sinon pour la synthèse purement chimique de protéine, la méthode la plus communément utilisée à l'heure actuelle qui se passe de systèmes biologiques c'est la méthode de Solid-Phase Peptide Synthesis (SPPS), pour ce que j'en sais.
 
Sinon, pour un state of the art: http://www.sciencedirect.com/scien [...] 0bb870a6a1


 
Pour ton premier lien, le contenu est proche de ce qui attendu d'un étudiant moyen de MasterI en chimie organique, y'a donc rien de vraiment compliqué : protection/deportection, N-alkylation c'est tu trés classique, les synthéses chirales ça le devient aussi ( séparation par colonne chirale en LC-préparative, ...)
Comme dit plus haut, le probléme c'est vraiment les rendements mais en labo un rendement final de 25 % sur du multi-étapes lourd en général c'est correcte, y,a toujours moyen de prendre des stagiaires esclaves pour optimiser les étapes une fois que la synthése totale est obtenue.
 
Pour augmenter les rendements et diminuer les étapes, y'a enormement de recherche là dessus : chimie enzymatique, réactions one-pot, utilisation d'organomettaliques en général trés selectif ( necessaires imho vu la taille des molécules et le nombres de sites d'attaque), et sans doute encore d'autres trucs que je ne connais pas :D


---------------
ahah ! sale parasite communiste, étudiant oisif, elle est belle la france qui s'exporte
n°9975051
Cardelitre
ಠ_ಠ ۞_۟۞ ┌( ಠ_ಠ)┘ סּ_סּ
Posté le 18-11-2006 à 14:14:38  profilanswer
 

sir_lune a écrit :

Pour ton premier lien, le contenu est proche de ce qui attendu d'un étudiant moyen de MasterI en chimie organique, y'a donc rien de vraiment compliqué :


Ben c'est du wikipedia hein, y a aucune prétention à un formalisme scientifique strict... :D


---------------
Intra-Science  -  To thine own self be true
n°9975167
sir_lune
B3LYP/6-31++G** powered
Posté le 18-11-2006 à 14:35:50  profilanswer
 

Cardelitre a écrit :

Ben c'est du wikipedia hein, y a aucune prétention à un formalisme scientifique strict... :D


 
je me suis mal exprimé :o
 
Je voulais juste dire que les réactions necessaires sont grosso-modo connues, le probléme ( à mon avis) c'est la façon de les mettre en oeuvre sur des molécules aussi grosses et spécifiques.
 
Par certains côtés, je trouve que c'est un type de synthése ( celle des protéines) qui a bcp de points communs avec la synthése de polyméres, et que les solutions pour éviter de passer par des solutions biologiques, viendront de là.
Mais la synthése de polymeres c'est pas vu comme trés noble  alors...:/


---------------
ahah ! sale parasite communiste, étudiant oisif, elle est belle la france qui s'exporte
n°9975311
Cardelitre
ಠ_ಠ ۞_۟۞ ┌( ಠ_ಠ)┘ סּ_סּ
Posté le 18-11-2006 à 15:05:19  profilanswer
 

sir_lune a écrit :

je me suis mal exprimé :o
 
Je voulais juste dire que les réactions necessaires sont grosso-modo connues, le probléme ( à mon avis) c'est la façon de les mettre en oeuvre sur des molécules aussi grosses et spécifiques.
 
Par certains côtés, je trouve que c'est un type de synthése ( celle des protéines) qui a bcp de points communs avec la synthése de polyméres, et que les solutions pour éviter de passer par des solutions biologiques, viendront de là.
Mais la synthése de polymeres c'est pas vu comme trés noble  alors...:/


En tout cas le type qui trouve un système pour augmenter correctement le rendement de la synthèse chimique de polypeptides va se faire des couilles en or, c'est un truc d'avenir... :o


---------------
Intra-Science  -  To thine own self be true
n°9975590
Rasthor
Posté le 18-11-2006 à 16:06:13  profilanswer
 

Cardelitre a écrit :

Ben j'y ai bossé quelques mois donc ouais... [:dao]
 
Non y a rien a dire, c'est un coin qui regroupe des types ultra compétents, pour ça y a tout ce qu'il faut.
Par contre niveau ambiance de merde j'ai rarement eu l'occasion de voir pire. Tout le monde se tire dans les pattes, coopération intergroupe inexistante, élitisme merdique (tout ceux qui n'ont pas une liste de publis longue comme le bras sont considérés comme des cafards inexistants, bref).
 
Niveau boulot t'apprendras pleins de trucs avec les meilleurs, niveau humain tu finiras pendu à un lampadaire dans les 2 mois. :o


Le pire, c'est que je confirme ses dires. :/
 
Par contre, ils t'aurisont ä bosser moins de 35 heures....par jour.  :whistle:

n°9975637
Svenn
Posté le 18-11-2006 à 16:19:06  profilanswer
 

RykM a écrit :

Et allez, je commence à me battre à vouloir exprimer ma prot' chez Coli, et évidemment elle est pas soluble  :sweat:  
 
Ca va se finir en inclusion body cette histoire  [:dao]


 
Si ta proteine fait plus de 50 kDa, tu peux tout de suite passer a la levure ou au baculo.  :o

n°9975657
Svenn
Posté le 18-11-2006 à 16:22:43  profilanswer
 

Hephaestos a écrit :

Nan, mais je veux dire de la vraie synthèse, sans utiliser des polymérases préfabriquées par Dieu en personne...


 
Ca, c'est du boulot de chimiste. Donc bien evidemment, ca marche super mal, le rendement est ridicule et surtout, il faut oser parler de proteine quand on voit la taille des peptides qu ils arrivent a fabriquer (En-dessous de 100 residus, je refuse de parler de proteine ). Pour finir, je prefere pas parler de repliement ou de proteines membranaires, je pourrais etre desagreable  :o

n°9975729
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 18-11-2006 à 16:39:28  profilanswer
 

Svenn a écrit :

Si ta proteine fait plus de 50 kDa, tu peux tout de suite passer a la levure ou au baculo.  :o


 
Elle fait 51 kDa  [:cosmoschtroumpf]  
 
On a reussi a s'en sortir avec une prot' de plus de 60  [:dao]

n°9975753
Svenn
Posté le 18-11-2006 à 16:46:07  profilanswer
 

RykM a écrit :

Elle fait 51 kDa  [:cosmoschtroumpf]  
 
On a reussi a s'en sortir avec une prot' de plus de 60  [:dao]


 
Il y a toujours des exceptions, mais ca se complique souvent aux alentours de 50 kDa avec Coli, ses proteines chaperonnes ont du mal a gerer les proteines plus grosses  :o  
 

Spoiler :

Sinon, je te suggererais bien de produire ta proteine en tournesol, ca pousse tout seul et il faut juste arroser regulierement, tu n es pas oblige d acheter des tampons hors de prix. Par contre, il fau pas le dire a Greenpeace  :whistle:  

n°9976159
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 18-11-2006 à 17:51:39  profilanswer
 

Bah on fait pousser a 15C et on joue sur les tampons...
Enfin au pire je passe sur le baculo  :sweat:

n°9976459
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 18-11-2006 à 18:31:15  profilanswer
 

Cardelitre a écrit :

Permuter post-synthèse un aa particulier en centre de chaine peptidique? Mon cul ouais... :o


Non, pas permuter modifier... [:aloy]
c'est un truc de biochimiste les permut'.


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La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
n°9976469
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 18-11-2006 à 18:32:41  profilanswer
 

Hephaestos a écrit :

Ouais enfin être capable de faire ça à la main ça ouvrirait la possibilités à des tas d'innovations potentiellement très intéressantes.


C'est sûr, mais pour contourner les problèmes de température pour la stabilité des structures IV et III des protéines c'est chaud bouillant. :/


---------------
La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
n°9976497
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 18-11-2006 à 18:35:22  profilanswer
 

sir_lune a écrit :

Pour ton premier lien, le contenu est proche de ce qui attendu d'un étudiant moyen de MasterI en chimie organique, y'a donc rien de vraiment compliqué : protection/deportection, N-alkylation c'est tu trés classique, les synthéses chirales ça le devient aussi ( séparation par colonne chirale en LC-préparative, ...)
Comme dit plus haut, le probléme c'est vraiment les rendements mais en labo un rendement final de 25 % sur du multi-étapes lourd en général c'est correcte, y,a toujours moyen de prendre des stagiaires esclaves pour optimiser les étapes une fois que la synthése totale est obtenue.


Clair, ils arrivent à publier quand ils passent, pour une étape, d'un rendement de 99,5% à 99,6% [:chapi-chapo]


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