Reprise du message précédent :
Le vrai nom de RykM, je ne le connnais pas. Vraiment.

Efface-moi ces posts qui remettent en question mon anonymat  

Quels posts ?

Celui-la:
 

C'est édité.

 
Nan mais c'etait de l'humour    
 
Tu connais pas Jack Bauer ? 24H chrono toussa    
 
Ah  les physiciens....  

T'ain    
 
Je viens au labo le dimanche pour avoir mes resultats demain matin aytou, je me tape la PCR, l'extraction sur gel avec les comtroles etc.... et bien sur le service de sequencage marche pas    
 
Fais chier de  bosser dans le vent  

Vive le labo !

 
Sors les ddNTPs, fais-toi rapidos un primer ³²P et c'est parti pour faire du séquencage old-skool à la Sanger

Je crois que je vais plutot attendre demain matin que ca re-marche  

 
C'est pas grave, tu fabriques ta protéine à partir du plasmide, tu la purifies, tu fais du séquençage N-ter et tu as ton résultat  

 
Pas bete    
 
Mais un peu long  

 
Et voilà, on se décourage dès que la manipe est un peu trop longue  

 
Je t'envoye le plasmide demain matin  

 
On fait un envoi groupé? J'ai 2-3 plasmides aussi, je voudrais être sur qu'ils me font la bonne prot'
 
  Merci Svenn!

 
Pendant qu'on y est, il pourrait aussi faire les anti-corps qui vont bien    
 
L'est trop sympa Svenn  

 
J'ai bien reçu ton plasmide et j'ai pu faire les manips. Il s'agit d'une ADN-polymérase de treponema pallidum, la bactérie responsable de la syphilis. Je ne savais pas que tu travaillais la-dessus, mais tu dois mieux savoir que moi comment elle a pu arriver ici.  

 
Y'a pas de prostituee en Ecosse  

 
Dans ce cas, peut-être que tu as profité d'un congrès à l'étranger pour prélever des échantillons  

Le Monde:
 le gouvernement a autorisé exceptionnellement les centrales nucléaires EDF à relâcher des eaux plus chaudes dans les rivières, comme elles l'avaient déjà fait à l'été 2003. La décision a provoqué la colère des anti-nucléaires : le réseau Sortir du nucléaire, qui fédère quelque 700 associations, accuse ainsi EDF de "sacrifier l'environnement au profit de la production nucléaire". "
 
T'ain c'est affligeant de lire ca    
 
Les bobo-ecolo-a-3-neurones preferent preserver 100 metres de riviere pour 30 poissons plutot que d'assurer l'hygiene, la securite aux personnes sensibles a la canicule.
 
Ca c'est de l'obscurantisme a l'etat de cristaux, du pure et dur.

Ouais. Bien dit Riton. Vas-y Marcel, remets-nous la même chose.
 
(c'est quoi la prochaine éructation? "dire qu'on paie des écolos pour sauver des grenouilles alors qu'y a des gens sous les ponts" ? )

 
Ah non, on ne met jamais des cochonneries pareilles à cristalliser, donc aucun risque  
 
Edit : d'un autre côté, mettre l'obscurantisme en cristaux, ça permettrait de le ranger plus facilement, ça prendrait moins de place à la surface de la Terre

En parlant de cristalliser, je sais pas si j'en avais parlé ici :
 
Il y a un truc assez rigolo dans le film "La Marche de l'empereur", quand les pingouins (Hotshot déjà je te préviens, je t'emmerde, ce sont des pingouins), quand les pingouins, donc, s'amalgament pour se tenir chaud, ils se serrent trés fort les uns contre les autres à la surface de la banquise. Eh bien à ce moment, il arrive un stade où, ou coeur du tas de pingouin, la pression est suffisamment important pour faire apparaitre un ordre à longue portée dans la disposition et l'orientation de chaque pingouin : il se forme un cristal 2D de pingouins.
 
Quand on pense comment vous en chiez pour faire cristalliser des protéines de surfaces, ça me fait bien marrer...

 
Ya quand même une différence, c'est que les écolos qui sauvent des grenouilles ne mettent pas les SDFs à la rue. Tandis que ceux qui veulent fermer les centrales nucléaires, s'ils y arrivent, feront effectivement des dégats certains dans notre espèce.

On est d'accord. C'est plutôt le ton légèrement excessif de Ryton qui m'interpelle   (et sinon je t'emmerde avec tes pingouins monocristallins)

 
Ah, mais on fait exactement la même chose avec certaines protéines membranaires : on met le plus possible de protéines dans le moins de membrane possible et quand on arrive à saturation, beaucoup de protéines membranaires  forment des cristaux 2D qui peuvent être utilisés en microscopie électronique. Dans des très bon cas, il est même possible de résoudre une structure à haute résolution par cette méthode  
 
Edit : voilà un bon exemple, il s'agit d'un canal calcium qui forme des "cristaux tubulaires", c'est assez classique avec les protéines membranaires. Et très pratique pour avoir des cartes de densité à basse résolution de protéines membranaires  
 

 
L'image vient de http://www.iam.u-tokyo.ac.jp/StrBi [...] otein.html

 
 
Nan mais je sais bien que vous essayez de faire la même chose. C'est justement ça qui me fait marrer, de voir comment vous en chiez alors qu'un coup de blizzard ça cristallise n'importe qui...

 
Ah, mais on ne fait pas qu'essayer. Pour avoir vu quelqu'un le faire, c'était : on prend la protéine, on rajoute un volume d'un produit, on met cinq minutes dans la glace, on regarde au microscope électronique et on voit des cristaux partout. C'était vraiment spectaculaire.  
En pratique, ça se fait plutôt sur quelques heures voir une journée, mais ça reste relativement simple (et largement plus que pour faire des cristaux 3D de ces mêmes protéines)    
 

 
Edit : par contre ça m'intéresse tes photos de cristaux de pingouins. Ce genre d'images, c'est toujours bien en congrès pour expliquer comment tu fais pour cristalliser des trucs qui ressemblent à rien  

Faire diffracter le cristal de pingouins, c'est la première chose à laquelle j'ai pensé en le voyant.
 
Il suffirait d'en faire un élevage suffisant et de le regrouper dans une zone parfaitement plane d'une dizaine de kilomètre de diamètre (à vue de nez, on devrait en caser un bon milliard là dedans...). Ensuite, il suffit d'avoir un faisceau lumineux monochromatique trés intense de longueur d'onde quelques centimètres, parallèle sur toute la zone observée. Avec le détecteur qui va bien derrière (un gros écran), ça devrait être un jeu d'enfant.
 
Le problème, c'est que je vous connais, vous autres rabat-joies qui ne connaissez rien à la science, vous êtes capables de dire que ça ne vaut pas les dizaines de milliards d'euros dépensés, qu'il vaut mieux se soucier des vrais gens et que de toute façon les seules information qu'on obtiendrait seraient des information de structure que l'on voit à l'oeil nu, pourvu que l'on soit doté d'un bistouri.

Pour les photos, je viens de chercher pendant un moment, j'ai rien trouvé... Je crois qu'il faudrait des caps du film...

 
On a le droit d'etre aggressif envers les cretins, c'est un minimum syndical  

 
Tututu, le seul truc dont il faut se soucier c'est si ça peut faire un Nature ou un Science

 
+1  
 

Yop !  Une chtite question pour les cristalleux :
 
Je cherche a savoir si il y a une combine pour pymol ou Vmd pour avoir les symmétriques de crystallo.
Le but est que j'ai pas mal de solutions par remplacement moléculaire a trier et j'aimerais voir facilement les "Clashs" sans ouvrir l'usine a gaz O ou bien Coot...
 
... et au passage faire des jolies figures pour impressionner les filles barbus !

 
coot, c'est bieng et c'est pas une usine    
 
Sinon pour pymol, l'instruction magique est (en appelant pro ta proteine d'origine et sym les symetriques) :  
 
symexp sym, pro, (all), 20
 
Le 20 à la fin, ça veut dire que tu veux afficher tous les symétriques à moins de 20 Angstroms de ta proteine initiale. Si c'est pour chercher des clashs, 3 devrait être amplement suffisant.

 
Je sais pas s'il y a un contentieux entre vous deux, ou si c'est une private joke, mais la marche de l'empereur ce sont des manchots, non?
Le pingouin ça vole...
Désolé si je suis HS    

 
Ok j'en déduis que j'ai dis une connerie, désolé  

Nan mais cherche pas, c'est l'autre crét physicien hein...

Donc ce sont des pinguins, sujet clos  

 
C'est un contentieux entre moi et le reste du monde, incarné ici même en la personne de Hotshot, dont le métier est de donner un nom à chaque os qu'il trouve, et de faire chier tout le monde pour rapeller que, puisqu'on fait la distinction entre un chimpanzée et un orang-outang, il est nécessaire de faire la distinction entre un Gastroponda Tergomya Bellerophontida et un Gastroponda Tergomya Tropidodiscidae.
 
Tout le monde sait que ce sont des pingouins. Et pourtant, où qu'on aille, quoi qu'on fasse, il y a toujours un imbécile pour venir dire "Ah mais non, ce sont des manchots ".