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Auteur Sujet :

[topik unique] Génétique, biologie moléculaire et structurale.

n°4322912
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 02-12-2004 à 23:26:42  profilanswer
 

Reprise du message précédent :

NHam a écrit :

[:opus dei]
Explications needed...)


 
arandria: Dans Alice aux pays des Merveilles, la Reine Rouge et tous ses sujets courent sans arrêt.  Pourquoi? «Ici, tu vois, il faut courir de toutes tes forces pour rester à la même place »
 
 
Leigh Van Valen, 1973  
 
qq explications ici


Message édité par RykM le 02-12-2004 à 23:26:51
mood
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Posté le 02-12-2004 à 23:26:42  profilanswer
 

n°4322919
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 02-12-2004 à 23:27:46  profilanswer
 

NHam a écrit :

Intégration dans le génome?
Je me demandais, on a pas d'intégrase spécifique de site chez l'homme?
(y'en a chez les bactéries il me semble...)


 
Y en a chez les levures aussi  :o  
 
Sinon les recombinases de transposons  :)
 
 
Et Cre of course


Message édité par RykM le 02-12-2004 à 23:31:18
n°4322933
Svenn
Posté le 02-12-2004 à 23:30:38  profilanswer
 

NHam a écrit :

Effectivement le virus mute énormément, mais il y a une limite quand même, quand ça touche des protéines vitales.
Et le virus n'invente rien, il est juste selectionné. [:ula]


 
Mais si, je suis sur qu'on va trouver un cerveau dans ces virus, faut juste qu'on le trouve :o .  
 

Citation :

Et puis on estime que 10% des virions produits  sont infectieux.
Parcequ'il y a toujours des mutaions.


10%, c'est déjà pas mal comme rendement pour un virus avec une phase ARN. Mais le taux de multiplication à chaque cycle est tellement énorme que ces 10% ne sont pas vraiment un problème.
 

Citation :

De toute façon ça ne s'applique qu'à la première génération.
Dés l'infection suivante c'est rentabilisé. [:dawa]


 
Non, ça s'applique à toutes les générations (mais moins qu'à la première). Schématiquement, étant donné les vitesses d'évolution relative d'un virus et de son hôte, tu peux considérer que le virus est "optimisé" vis-à-vis de son hôte. Rajouter un médicament revient à changer le problème pour le virus en une "optimisation sous contrainte".
 
Ce genre de virus a un génome très petit (de 10000 à 20000 bases) et la moindre adaptation touche une proportion non négligeable du génome. Les virus ne peuvent donc pas supporter un nombre démentiel de contraintes, même s'ils peuvent s'accommoder de chacune de ces contraintes individuellement.


---------------
Winning an Ig Nobel is like winning a Darwin Award, and you don’t have to die
n°4322941
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 02-12-2004 à 23:32:16  profilanswer
 

RykM a écrit :

arandria: Dans Alice aux pays des Merveilles, la Reine Rouge et tous ses sujets courent sans arrêt.  Pourquoi? «Ici, tu vois, il faut courir de toutes tes forces pour rester à la même place »
 
 
Leigh Van Valen, 1973  
 
qq explications ici


Intéressant...je connaissais pas.
 

RykM a écrit :

Y en a chez les levures aussi  :o  
 
Sinon les recombinases de transposons  :)


Oui mais j'ai précisé chez l'homme. [:aloy]
Et puis les recombinases et les transposons ça courtpas les rues non plus chez nous non?  [:ienchangel]


---------------
La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
n°4322955
Svenn
Posté le 02-12-2004 à 23:34:02  profilanswer
 

NHam a écrit :

Intégration dans le génome?
Je me demandais, on a pas d'intégrase spécifique de site chez l'homme?
(y'en a chez les bactéries il me semble...)


 
Je crois qu'on a des recombinases spéciales qui servent au niveau des lymphocytes B pour les recombinaisons des gènes codant pour les anticorps (les recombinaisons VDJ)  :??:


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Winning an Ig Nobel is like winning a Darwin Award, and you don’t have to die
n°4322958
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 02-12-2004 à 23:34:38  profilanswer
 

NHam a écrit :


 
Oui mais j'ai précisé chez l'homme. [:aloy]
Et puis les recombinases et les transposons ça courtpas les rues non plus chez nous non?  [:ienchangel]


 
Et Cre elle vient de la souris, non ? [:jean-guitou]

n°4322966
Svenn
Posté le 02-12-2004 à 23:35:21  profilanswer
 

NHam a écrit :

Intéressant...je connaissais pas.
 
 
Oui mais j'ai précisé chez l'homme. [:aloy]
Et puis les recombinases et les transposons ça courtpas les rues non plus chez nous non?  [:ienchangel]


 
Euh, si.  
 
J'ai plus le chiffre exact, mais les transposons occupent plus de place dans notre génome que nos gènes "normaux".


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Winning an Ig Nobel is like winning a Darwin Award, and you don’t have to die
n°4322977
Svenn
Posté le 02-12-2004 à 23:36:17  profilanswer
 

RykM a écrit :

Y en a chez les levures aussi  :o  
 
Sinon les recombinases de transposons  :)
 
 
Et Cre of course


 
D'un autre côté, c'est probablement pas un drame si on inhibe les recombinases des transposons  :)


---------------
Winning an Ig Nobel is like winning a Darwin Award, and you don’t have to die
n°4322978
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 02-12-2004 à 23:36:17  profilanswer
 

Svenn a écrit :

Je crois qu'on a des recombinases spéciales qui servent au niveau des lymphocytes B pour les recombinaisons des gènes codant pour les anticorps (les recombinaisons VDJ)  :??:


 
C'est pas de recombinases, c'est du Non Homologous End Joining
 
medie pas Ku70/Ku80 et DNA-PK
 
C'est pas site-specifique.
 
Par contre en amont de ce processus y a RAG  :jap: qui reconnait une sequence (je sais plus laquelle) [:airforceone]

n°4322989
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 02-12-2004 à 23:38:02  profilanswer
 

Svenn a écrit :

Mais si, je suis sur qu'on va trouver un cerveau dans ces virus, faut juste qu'on le trouve :o .


Oui tu sais que les zèbres sont peints!
Oui c'est blanc et noir, mais si tu gratte avec un cutter par exemple tu te rendras compte qu'ils sont rouges en fait.
(désolé, il est plsu que temps que j'aille me coucher.)  
 

Citation :

10%, c'est déjà pas mal comme rendement pour un virus avec une phase ARN. Mais le taux de multiplication à chaque cycle est tellement énorme que ces 10% ne sont pas vraiment un problème.


Oui 10% de 100 000 c'est déjà pas mal! (ce chiffre est complètementy arbitraire, mais ça doit être énorme quand même)
 

Citation :


Non, ça s'applique à toutes les générations (mais moins qu'à la première). Schématiquement, étant donné les vitesses d'évolution relative d'un virus et de son hôte, tu peux considérer que le virus est "optimisé" vis-à-vis de son hôte. Rajouter un médicament revient à changer le problème pour le virus en une "optimisation sous contrainte".


Je parlais juste de la contrainte supplémentaire en effet. [:romf]
 

Citation :

Ce genre de virus a un génome très petit (de 10000 à 20000 bases) et la moindre adaptation touche une proportion non négligeable du génome. Les virus ne peuvent donc pas supporter un nombre démentiel de contraintes, même s'ils peuvent s'accommoder de chacune de ces contraintes individuellement.


Oui c'est pour ça quon cumule plusieurs inhibiteurs.
Mais quand on voit les effets secondaires, c'est vraiment pour sauver les meubles! Le long terme c'est encore loin.


---------------
La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
mood
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Posté le 02-12-2004 à 23:38:02  profilanswer
 

n°4322996
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 02-12-2004 à 23:38:41  profilanswer
 

Svenn a écrit :

D'un autre côté, c'est probablement pas un drame si on inhibe les recombinases des transposons  :)


 
 :jap: clair
 
Mais connaissant (un peu) la recombinaison homologue (Rad52 Rad51 et autres joyeuseries  :whistle: ) je dirais que ce sont des processus autrement plus compliques et dynamique qu'une "simple" reaction enzyme-substrat.
 
Les complexes proteiques sont enormes et les surfaces d'interaction gigantesques [:w3c compliant]
 
edit: voir mon avatar representant une jonction de Holliday  :sol:


Message édité par RykM le 02-12-2004 à 23:39:38
n°4323006
Svenn
Posté le 02-12-2004 à 23:40:20  profilanswer
 

RykM a écrit :

C'est pas de recombinases, c'est du Non Homologous End Joining
 
medie pas Ku70/Ku80 et DNA-PK
 
C'est pas site-specifique.
 
Par contre en amont de ce processus y a RAG  :jap: qui reconnait une sequence (je sais plus laquelle) [:airforceone]


 
oki  :)  
 
Je vois pas trop où on pourrait avoir des recombinases spécifiques dans ce cas.
 
 
PS : 10ème page du topic, on a déjà dépassé la quasi-totalité des topics pipologiques de la catégorie "science", il nous reste plus que "la vie dans la mort" et les ovnis à dépasser   :sol:


---------------
Winning an Ig Nobel is like winning a Darwin Award, and you don’t have to die
n°4323008
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 02-12-2004 à 23:40:24  profilanswer
 

RykM a écrit :

C'est pas de recombinases, c'est du Non Homologous End Joining
 
medie pas Ku70/Ku80 et DNA-PK
 
C'est pas site-specifique.
 
Par contre en amont de ce processus y a RAG  :jap: qui reconnait une sequence (je sais plus laquelle) [:airforceone]


 [:mehjret]  c'est une peu comme de l'épissage mais sur l'ADN.
En même temps s'il se loupe le LB, il a le droit à un autre essai, mais après c'est apoptose direct.  


---------------
La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
n°4323030
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 02-12-2004 à 23:42:25  profilanswer
 

NHam a écrit :

[:mehjret]  c'est une peu comme de l'épissage mais sur l'ADN.
En même temps s'il se loupe le LB, il a le droit à un autre essai, mais après c'est apoptose direct.


 
Ca c'est pour moi  [:huit]

n°4323035
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 02-12-2004 à 23:43:06  profilanswer
 

Svenn a écrit :

oki  :)  
 
Je vois pas trop où on pourrait avoir des recombinases spécifiques dans ce cas.
 
 
PS : 10ème page du topic, on a déjà dépassé la quasi-totalité des topics pipologiques de la catégorie "science", il nous reste plus que "la vie dans la mort" et les ovnis à dépasser   :sol:


En même temps on a rien à voir avec les géologues...[:spamafote]
Enfin je sais paspour vous mais moi je pleurerais si j'étais obligé de faire de la géol. [:zytrasnif]


---------------
La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
n°4323046
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 02-12-2004 à 23:43:57  profilanswer
 

RykM a écrit :

Ca c'est pour moi  [:huit]


Môssieur apoptose, mitochondrie cytochrome caspase tout ça.
Chez C.Elegans?  :??:


---------------
La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
n°4323053
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 02-12-2004 à 23:44:43  profilanswer
 

Svenn a écrit :

oki  :)  
 
Je vois pas trop où on pourrait avoir des recombinases spécifiques dans ce cas.
 
 
PS : 10ème page du topic, on a déjà dépassé la quasi-totalité des topics pipologiques de la catégorie "science", il nous reste plus que "la vie dans la mort" et les ovnis à dépasser   :sol:


 
Aller, un petit effort et on passe a la 11eme ce soir  [:huit]  
 
Svenn, tu veux pas nous poster une grosse photo de cristaux ?  :)

n°4323057
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 02-12-2004 à 23:45:03  profilanswer
 

Si je ne m'abuse, vous êtes 4 réguliers ici.
Plus les visiteurs de passages comme moi. [:noxauror]


Message édité par NHam le 02-12-2004 à 23:45:09

---------------
La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
n°4323060
Rasthor
Posté le 02-12-2004 à 23:45:23  profilanswer
 

NHam a écrit :

Si je ne m'abuse, vous êtes 4 réguliers ici.
Plus les visiteurs de passages comme moi. [:noxauror]

Et moi !  [:bugman]

n°4323065
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 02-12-2004 à 23:45:38  profilanswer
 

RykM a écrit :

Aller, un petit effort et on passe a la 11eme ce soir  [:huit]  
 
Svenn, tu veux pas nous poster une grosse photo de cristaux ?  :)


Oui une devrait faire facile deux pages... :whistle:


---------------
La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
n°4323073
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 02-12-2004 à 23:46:38  profilanswer
 

Rasthor a écrit :

Et moi !  [:bugman]


Oui RykM, Svenn, Bank et toi...
Mi-france mi suisse?


---------------
La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
n°4323081
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 02-12-2004 à 23:47:07  profilanswer
 

NHam a écrit :

Môssieur apoptose, mitochondrie cytochrome caspase tout ça.
Chez C.Elegans?  :??:


 
ouep'  :sol:     :o  :o  
 
 
Ben c'est plutot que l'apoptose a ete decouverte chez C.elegans par l'ancien chef a mon chef  :o  
 
Sinon, y a juste caspase chez les petits vers, relargage du cytochrome C , c'est deja beaucoup moins clair  [:airforceone] mais bon, on peut pas vraiment faire de biochimie, c'est un peu la mer***

n°4323093
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 02-12-2004 à 23:48:19  profilanswer
 

NHam a écrit :

Oui RykM, Svenn, Bank et toi...
Mi-france mi suisse?


 
Tu oublies Cardelitre  :o  
 
Qui est alle pionce, comme une grosse feignasse  :o  
 
Y a aussi Paul Benjamin (Suisse aussi  [:airforceone] )

n°4323100
Rasthor
Posté le 02-12-2004 à 23:48:45  profilanswer
 

NHam a écrit :

Oui RykM, Svenn, Bank et toi...
Mi-france mi suisse?

AH, tu me comptais dans les quatre ?  
Pourtant je ne participe pas beaucoup au topic...  :sweat:

n°4323103
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 02-12-2004 à 23:49:04  profilanswer
 

RykM a écrit :

ouep'  :sol:     :o  :o  
 
 
Ben c'est plutot que l'apoptose a ete decouverte chez C.elegans par l'ancien chef a mon chef  :o  
 
Sinon, y a juste caspase chez les petits vers, relargage du cytochrome C , c'est deja beaucoup moins clair  [:airforceone] mais bon, on peut pas vraiment faire de biochimie, c'est un peu la mer***


Oui c'est vrai au court du développement il perd je sais plus combien de cellules...tout le monde vois ça à la Fac.
Pour le rôle de la mitochondrie c'est carrément pas cleir le pore transitoire, il savent toujour pas s'il existe ou pas. [:skeye]


---------------
La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
n°4323109
Svenn
Posté le 02-12-2004 à 23:49:52  profilanswer
 

NHam a écrit :

Oui RykM, Svenn, Bank et toi...
Mi-france mi suisse?


 
D'un autre côté, si on fait un topic bio 100% français, on risque de pas être nombreux. Dans ce domaine, la France c'est un petit pays à côté de la Suisse  :D


---------------
Winning an Ig Nobel is like winning a Darwin Award, and you don’t have to die
n°4323113
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 02-12-2004 à 23:50:12  profilanswer
 

Rasthor a écrit :

AH, tu me comptais dans les quatre ?  
Pourtant je ne participe pas beaucoup au topic...  :sweat:


Ouai tu fais un mi-temps avec Paul Benjamin? [:opus dei]


---------------
La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
n°4323120
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 02-12-2004 à 23:50:46  profilanswer
 

Rasthor a écrit :

AH, tu me comptais dans les quatre ?  
Pourtant je ne participe pas beaucoup au topic... :sweat:


 
C'est vrai ca  [:rykm]

n°4323123
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 02-12-2004 à 23:50:55  profilanswer
 

Svenn a écrit :

D'un autre côté, si on fait un topic bio 100% français, on risque de pas être nombreux. Dans ce domaine, la France c'est un petit pays à côté de la Suisse  :D


Ben ils sont où les Strasbourgeois?
Biomol tout ça?!


---------------
La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
n°4323126
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 02-12-2004 à 23:51:10  profilanswer
 

RykM a écrit :

C'est vrai ca  [:rykm]


Aller [:lorilll]
[:_edit] un e-chocolat?


Message édité par NHam le 02-12-2004 à 23:52:07

---------------
La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
n°4323131
Svenn
Posté le 02-12-2004 à 23:52:05  profilanswer
 

Au fait,
 
[chevilles enflées]
Je suis docteur depuis avant-hier  :o (d'où ma très faible participation ces jours-ci)
[/chevilles enflées]


---------------
Winning an Ig Nobel is like winning a Darwin Award, and you don’t have to die
n°4323133
bank
grin and bear
Posté le 02-12-2004 à 23:52:06  profilanswer
 

Svenn a écrit :

D'un autre côté, si on fait un topic bio 100% français, on risque de pas être nombreux. Dans ce domaine, la France c'est un petit pays à côté de la Suisse  :D


 
Et c'est vraiment dommage :/
 
Ca serait appréciable d'augmenter le ratio europe/usa dans les publis :o

n°4323141
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 02-12-2004 à 23:52:51  profilanswer
 

NHam a écrit :

Oui c'est vrai au court du développement il perd je sais plus combien de cellules...tout le monde vois ça à la Fac.
Pour le rôle de la mitochondrie c'est carrément pas cleir le pore transitoire, il savent toujour pas s'il existe ou pas. [:skeye]


 
C'est paske c'est un artefact  :o  
 
Ca me rappelle un gars qui est venu faire un talk a l'institut hier. Il bosse sur elegans et droso et il commence en disant (a une assistance qui bosse principalement sur cellules humaines, donc HeLa )  
 
" cellules HeLa c'est du pipot, toute la biochimie n'est qu'un artefact  :o "
 
L'assistance  :heink:  :heink:  
 
 
Et moi  :whistle:  :whistle:  :whistle:

n°4323142
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 02-12-2004 à 23:52:52  profilanswer
 

Svenn a écrit :

Au fait,
 
[chevilles enflées]
Je suis docteur depuis avant-hier  :o (d'où ma très faible participation ces jours-ci)
[/chevilles enflées]


Ficelles de caleçon! PhD, MD/PhD?


---------------
La différence entre la sensualité et la perversion: La sensualité c'est avec la plume, la perversion avec le poulet entier.
n°4323144
Svenn
Posté le 02-12-2004 à 23:53:27  profilanswer
 

NHam a écrit :

Ben ils sont où les Strasbourgeois?
Biomol tout ça?!


 
L'Alsace, c'est un peu comme la Bretagne, je sais pas si ça compte vraiment  :whistle: (Pas taper, j'ai passé plein de temps à Strasbourg)


---------------
Winning an Ig Nobel is like winning a Darwin Award, and you don’t have to die
n°4323151
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 02-12-2004 à 23:53:48  profilanswer
 

Svenn a écrit :

Au fait,
 
[chevilles enflées]
Je suis docteur depuis avant-hier  :o (d'où ma très faible participation ces jours-ci)
[/chevilles enflées]


 
 
Felicitations [:buvons]

n°4323156
bank
grin and bear
Posté le 02-12-2004 à 23:54:28  profilanswer
 

RykM a écrit :

C'est paske c'est un artefact  :o  
 
Ca me rappelle un gars qui est venu faire un talk a l'institut hier. Il bosse sur elegans et droso et il commence en disant (a une assistance qui bosse principalement sur cellules humaines, donc HeLa )  
 
" cellules HeLa c'est du pipot, toute la biochimie n'est qu'un artefact  :o "
 
L'assistance  :heink:  :heink:  
 
 
Et moi  :whistle:  :whistle:  :whistle:


 
Bon c'est vrai que les Hela :whistle:  
 
Aucun labo n'a la même souche en gros [:chacal_one333]

n°4323159
RykM
t'as de beaux gènes, tu sais..
Posté le 02-12-2004 à 23:54:33  profilanswer
 

Svenn a écrit :

L'Alsace, c'est un peu comme la Bretagne, je sais pas si ça compte vraiment  :whistle: (Pas taper, j'ai passé plein de temps à Strasbourg)


 
Ben sans deconner, Strasbourg ca cartonne bien quand meme  :jap:

n°4323167
Rasthor
Posté le 02-12-2004 à 23:55:00  profilanswer
 

RykM a écrit :

C'est vrai ca  [:rykm]

Je suis presque largué certaines fois.  :cry:

n°4323169
bank
grin and bear
Posté le 02-12-2004 à 23:55:16  profilanswer
 

Svenn a écrit :

Au fait,
 
[chevilles enflées]
Je suis docteur depuis avant-hier  :o (d'où ma très faible participation ces jours-ci)
[/chevilles enflées]


 
 :bounce:  :bounce:

n°4323172
NHam
Stop, look and listen.
Posté le 02-12-2004 à 23:55:26  profilanswer
 

RykM a écrit :

C'est paske c'est un artefact  :o  
 
Ca me rappelle un gars qui est venu faire un talk a l'institut hier. Il bosse sur elegans et droso et il commence en disant (a une assistance qui bosse principalement sur cellules humaines, donc HeLa )  
 
" cellules HeLa c'est du pipot, toute la biochimie n'est qu'un artefact  :o "
 
L'assistance  :heink:  :heink:  
 
 
Et moi  :whistle:  :whistle:  :whistle:


En même temps bosser sur des cellules cancereuses...[:gilbert gosseyn]
Mais quand je vois comment ça gruge les résultats dans les labos de recherche, ou que ça voit des trucs que tu te demande où ils le voient!?!
Enfin on discutera de la mentalité de certains chercheurs une autre fois.


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