Reprise du message précédent :

Malade aux dernieres nouvelles, mais ca date d'avril 2016:
https://forbetterscience.wordpress. [...] ic-elites/
 

 
 
 
 Soupçons de manipulations à l'EPFZ et au CNRS
SciencesDes doutes sont apparus concernant des figures et graphiques dans plusieurs publications dans la biologie moléculaire.
http://www.tdg.ch/savoirs/sciences [...] y/25205242
 

 
Comment vous interprétez ces deux phrases ?
 
Et golden facepalm:

 
Il vient d'y avoir 3 articles dans Cell avec Voinnet rétractés, ça a peut-être un rapport ?
 

 
J'avais ramené mes figures pour les terminer à la maison ce week-end mais je n'ai pas fait gaffe que mes gamins avaient joué avec sur Photoshop pendant que je tondais la pelouse

LINE-1 Activity in Facultative Heterochromatin Formation during X Chromosome Inactivation
A Viral Movement Protein Prevents Spread of the Gene Silencing Signal in Nicotiana benthamiana
Systemic Spread of Sequence-Specific Transgene RNA Degradation in Plants Is Initiated by Localized Introduction of Ectopic Promoterless DNA
=> ils ne sont pas retractes.
=> Voinnet est 1er auteur dans 2 articles. Dans les articles sur l'enquete, ils disent qu'il n'est que co-auteur.

 
Autant pour moi, j'ai vu trois notes éditoriales faisant référence à d'anciens articles et commençant par des trucs du genre We, the editors of Cell, were contacted by the corresponding author, Dr. Edith Heard, who informed us that this paper contains unacknowledged lane splices in Figures 2C and 4C." et j'ai sauté un peu trop vite à la conclusion. Cell a effectivement considéré que ça ne justifiait pas de rétractation ni de correction.  

Faudrait deja commencer par l'exclure de l’académie des Sciences:
http://www.academie-sciences.fr/fr [...] innet.html
 

 
Parce que c'est toujours pas fait ?

Tu veux exclure quelqu'un parce qu'ils ne surveillait pas ses gosses pendant qu'il tondait le gazon ???      

J'ai un pote qui est post-doc chez lui  
 
Quand il a commence (avant toutes ces histoires) c'etait
 
Maintenant c'est
 
Je crois savoir que les etudiants ont ete dispatches chez d'autres prof de l'ETZ.
 
A mon avis il est virtuellement exclu du systeme (officiellement en arret maladie.)

 
   
 
 
 
 
Et il est toujours en post-doc chez lui ?

Il est toujours a l'ETZ, j'en sais pas plus  

C'est quoi la portée de sa fraude ?
 
Je veux dire, tout est faux où il a juste pêché par connerie ? (pas envie de perdre du temps à refaire des manips, tricher pour être le premier, fainéantise, etc ...)

Juste un exemple, qui parle de lui-même:

 
 
Même si ses résultats sont justes, comment après ça tu peux avoir confiance dans l'ensemble de ses travaux ?  

 
Tu peux commencer par là par exemple :
 
https://pubpeer.com/search?q=voinne [...] blications
 
Les premières critiques remontent à septembre 2014, avant le début de l'affaire et c'est intéressant à relire les réactions a posteriori

 
Mais c'est le probleme souleve recemment, pour certains les resultats ne sont pas reproductibles.
 
DOnc :
 
 

Ouais, comme 99% des expériences en biologie....  

Quelqu'un aurait acces a ce PDF ?
 
http://www.nature.com/nchem/journa [...] .1244.html
 
Et aurait-il la gentillesse me l'envoyer ? (rasthor [@] hotmail.com)
 
D'avance merci.  

Mail envoyé

Oh ! Mille mercis, je ne l'avais pas encore reçu!  

J'ai enfin reçu "Fundamentals of Molecular Evolution"
 
J'ai lu que quelques pages pour le moment mais vu que ça semble passer assez vite sur des concepts qui me sont totalement inconnus je dois m'arrêter toutes les 1 ou 2 pages pour chercher des compléments d'information. Ça va donc m'occuper quelques mois sans doute (mais bon c'est aussi ce que je cherchais, faut juste pas que j'abandonne ).

Oups, désolé.
 
 
Mais hésite pas a demander s'il y a des trucs pas clair.
 

Pour l'instant je m'en sors avec Wikipedia, ce sont des trucs comme polyandénylation, introns, exons, ARNm, ARN polymerase, euco/procaryote, ... qui font que ça fait des phrases pas trop compréhensibles si j'ai pas été voir un peu plus en détails à quoi ça correspond    
 

Ok, c’était peut-être un peu trop avance comme niveau. Désolé.  
Peut-etre lire un bouquin de biologie de type lycée ?
 
Mais plus loin dans le livre (chapitres 2 a 5), ça devient plus matheux, algorithmique.

Yep peut-être prendre un truc plus simple mais pour l'instant ça reste des concepts qui me sont certes inconnus mais assez "faciles" à comprendre, parfois suffit juste d'un ptit schéma manquant pour piger la phrase.

Plop ici !
 
J'ai un peu hésité à ma question dans le topic chimie, mais je pense que c'est plus approprié ici. En tant que géologue, la biologie végétale n'est pas ma spécialité.
 
Vu que l'extrait de chlorophylle, ça coûte bonbon, je cherche à extraire une assez grande quantité (100-200 g voire 300 si possible) de chlorophylle "brute" (i.e. tous constituants "colorants" : chlorophylle a, b, les carotènes et les xanthophylles) pour l'utiliser comme teinture textile (donc pas besoin de purification, ni de séparation des différentes constituants).
L'extraction "traditionnelle" qu'on utilise dans les TP d'enseignements consiste à broyer des feuilles (d'épinard, souvent) dans un mortier avec un fond d'éthanol.
Vu la quantité dont j'ai besoin, je pensais plutôt utiliser un procédé moins artisanal en passant ma matière végétale dans un broyeur-centrifugeur (un bête extracteur de jus, quoi).
La question étant : dans ce cas, faut-il utiliser de l'éthanol ? Dans le cas du mortier, il me semble que l'éthanol a un double rôle d'extracteur (par dessication des cellules) et de solvant de la chlorophylle.
 
Je comptais donc tremper la matière végétale dans de l'alcool avant de la passer à la centrifugeuse, puis de rincer avec un peu d'éthanol pour récupérer ce qui est resté piégé. Vous pensez que ça tient la route ?

 
Pour les concepts de base en bio je conseille le Campbell. Très utilisé par les étudiants.
Dispo dans le biblis universitaires etc ...
 

Si vous deviez choisir un Master dans le domaine de la bio qui débouche sur un Job "assuré", vous prendriez quoi ?
J'ai une licence suite à une reprise d'étude mais vu mon age la recherche je peux oublier    
Idéalement j'aimerais lancer mon truc à moi suite au master, je suis du genre créatif, mais je pense que je vais la jouer safe (à moins de rencontrer des gens motivés et partants).

Les trucs trendy ces temps:
- Next-generation sequencing (on doit etre a  la 4eme ou 5eme de generation. ).
- Single-cell sequencing.
- CRISPR, pour generer des mutations.
- Cancer (Immunotherapy).
- Big Data.
- Cryo-electron microscopy.

 
Intéressant tout cela    
Dans ces domaines quels genre de postes seraient accessibles ? (c'est ptet un peu trop vaste comme question    mes excuses )
 
Related question : monter une start-up dans ce domaine en France j'oublie  ?

Dans l'academique:
- Esclave niveau 1 (doctorant)
- Esclave niveau 2 (premier postdoc)
- Esclave niveau 3 (deuxieme postdoc)
- Chef de groupe (avec pas mal de chance et beaucoup de reseautage).
- Professeur  (avec beaucoup de chance et beaucoup de reseautage).

Dans l'industrie:
- Scientist
- Senior scientist
- Group leader

 
J'aime ta vision brute des choses    
Je pense que le privé fera l'affaire, faut juste trouver le diplôme kivabien.

Commence a regarder les annonces sur des sites specialistes, tu verras vite les diplomes et competences requises.

 
J'étais justement sur indeed , merci beaucoup !  
Je vais veiller aussi sur le topic.

Bioinfo

T'as quel age ? Si y a un truc que j'ai vu dans mon labo, c'est que dans la recherche il y a un peu tout les parcours possibles.
(Ex : un gars qui a entamé une reconversion à 29 ans après avoir été dans le cinéma, il est maintenant post-doc à 39 ans, ou un autre qui a fait médecine puis à repris de 0 en computer sciences, il fait son PhD à 32 ans).

En France ou ailleurs, si tu es fraichement sorti de l'école et que tu veux monter une boite dans la biologie, ça semble compliqué...
 
C'est beau sur le papier, mais il te faut l'idée, le brevet qui va avec (avec figures à la clefs, donc expériences etc... et pouvoir le payer), le financement (donc convaincre des investisseurs sur la base de ton produit). Et s'il y a bien un truc sur la recherche en bio, c'est que c'est vite très très couteux.
 
Donc en gros oui c'est faisable de monter une start up en France, mais en sortie d'étude ça me semble complètement irréaliste tant il te faut du bagage en terme de connaissance et de réseau (investisseurs dans ce cas). Et gérer une start-up c'est loin, mais très loin d'être de tout repos

j'ai laissé tombé la lecture de Fondamentals of Molecular Evolution pour le moment vu qu'il me manque quand même trop de notions pour ne pas en être dégouté.
 
Du coup je me suis trouvé une version électronique de Campbell Biology (9th Ed), et c'est pas mal jusqu'à présent, ça fait limite livre pour enfant comparé au précédent ( ) mais c'est ce qu'il me fallait  

 
L'autre problème c'est qu'autant en info tu peux te lancer dès la fin de ton école d'ingé si tu as une bonne idée, autant en bio tu ne sais rien faire au niveau bac+5 et la thèse voire un peu plus d'XP ça me semble totalement incontournable. C'est plutôt des 30 ou 40 ans qui montent des boites dans ce domaine de ce que j'ai vu.

je te confirme qu'hormis génie, la maturité en bio c'est autour de 40 ans. Pour ma part ce que n'est que maintenant que des idées murissent et que j'essaie de me lancer (enfin je ne suis pas un exemple de précocité non plus   ).

Après le doctorat, la précarité guette huit chercheurs sur dix
http://www.rts.ch/info/suisse/8026 [...] r-dix.html

 
J'aurai pas cru tiens. Effectivement c'est encourageant, seulement attendre X années pour un "vrai " job (et salaire ) en démarrant un master à 30 ans spa évident    
Ca me tente vachement hein, je dis pas le contraire.Je me suis pris de passion pour la bio sur le tard, c'est pour ça que j'ai fais ma licence; cependant ça me semble ardu.
 

 
Ca donne envie  

http://www.nature.com/naturejobs/s [...] j7621-573a
 

 
Pour une fois la France en première place d'un classement dans un article scientifique, avec 86%.... mais pas sur que ce soit positif....    
 

 
Et sinon: