ese-aSH a écrit :
La lecture (peut etre fausse) que j'ai eu de tes arbres c'est que les variants qui se répandent émergent forcément de branches parentes lointaines ou cousines des variants dominant du moment.
Ce qui semble faire sens puisque la population s'immunise ou se vaccine contre les variants courants.
De fait dire qu'un vaccin, meme 100% efficace contre un variant -ou une famille de variant- empechera l'apparition de nouveaux variants dominants me semble la aussi un argument fallacieux.
Mais je me trompe surement quelquepart dans mon raisonnement ?
|
La dernière partie est vrai si le virus peut muter à l'infini en gardant ses caractéristiques. On voit avec Omicron qu'il a dû lâcher sur la sévérité pour gagner en contagiosité, principalement en contournant en partie l'immunité. Tuer le porteur n'apporte aucun bénéfice évolutif, au contraire. On commence à avoir une carte des mutations avantageuses pour le virus, il ne pourra pas indéfiniment en trouver d'autres :
Source : https://www.researchgate.net/public [...] ure_Review
Bref, on peut espérer qu'Omicron soit un tournant dans l'épidémie, avec le premier variant se diffusant à grande échelle qui soit moins sévère que les précédents. Et, vu le nombre de mutations qu'il partage avec ses copains, on peut aussi espérer une immunité croisée avec les autres variants, présents et futurs. Ou alors, que le prochain variant ait besoin d'abandonner ces mutations pour déjouer l'immunité, ce qui lui ferait perdre l'avantage qu'elles confèrent.
Mais méfiance, cette saloperie nous a toujours réservé des surprises
Beyond Omicron: what’s next for COVID’s viral evolution
Delta et ses descendants représentent désormais la grande majorité des cas de COVID-19 dans le monde. La plupart des chercheurs s'attendaient à ce que ces lignées Delta finissent par supplanter les dernières souches. Mais Omicron a ébranlé ces prédictions. "Beaucoup d'entre nous s'attendaient à ce que le futur variant bizarre soit un enfant de Delta, et là c'est un peu un joker", déclare Aris Katzourakis, spécialiste de l'évolution virale à l'université d'Oxford, au Royaume-Uni.
[...]
La façon dont le SRAS-CoV-2 évolue en réponse à l'immunité a des implications pour sa transition vers un virus endémique. Il n'y aurait pas de niveau de base constant d'infections, explique M. Kucharski. "Beaucoup de gens ont une ligne horizontale plate dans leur tête, ce qui n'est pas le cas des infections endémiques." Au contraire, le virus est susceptible de provoquer des flambées et des épidémies de taille variable, comme le font la grippe et la plupart des autres infections respiratoires courantes.
Pour prédire à quoi ressembleront ces épidémies, les scientifiques étudient à quelle vitesse une population devient nouvellement sensible à l'infection, explique M. Kucharski, et si cela se produit principalement par l'évolution du virus, l'affaiblissement des réponses immunitaires ou la naissance de nouveaux enfants non immunisés contre le virus. "J'ai l'impression que de petits changements qui ouvrent à la réinfection une certaine fraction de la population précédemment exposée pourraient être la trajectoire évolutive la plus probable", déclare Rambaut.
L'avenir le plus prometteur - mais probablement le moins probable - pour le SRAS-CoV-2 serait de suivre la voie de la rougeole. L'infection ou la vaccination confère une protection à vie, et le virus circule largement sur la base des nouvelles naissances. "Même un virus comme celui de la rougeole, qui n'a pratiquement pas la capacité d'évoluer pour échapper à l'immunité, est toujours là", déclare M. Bloom.
Un parallèle plus probable, mais encore relativement prometteur, pour le SRAS-CoV-2, est la comparaison avec un agent pathogène appelé virus respiratoire syncytial (VRS). La plupart des personnes sont infectées au cours de leurs deux premières années de vie. Le VRS est l'une des principales causes d'hospitalisation des nourrissons, mais la plupart des cas infantiles sont bénins. La baisse de l'immunité et l'évolution virale permettent à de nouvelles souches de VRS de balayer la planète chaque année, infectant les adultes en grand nombre, mais avec des symptômes bénins grâce à l'exposition pendant l'enfance. Si le SRAS-CoV-2 suit cette voie - aidé par des vaccins qui offrent une forte protection contre la maladie grave - "il devient essentiellement un virus d'enfants", déclare M. Rambaut.
La grippe offre un autre scénario - en fait, deux. Le virus de la grippe A, qui est à l'origine des épidémies mondiales de grippe saisonnière chaque année, se caractérise par l'évolution et la propagation rapides de nouveaux variants capables d'échapper à l'immunité suscitée par les souches précédentes. Il en résulte des épidémies saisonnières, propulsées en grande partie par la propagation chez les adultes, qui peuvent encore développer des symptômes graves. Les vaccins contre la grippe réduisent la gravité de la maladie et ralentissent la transmission, mais l'évolution rapide de la grippe A signifie que les vaccins ne sont pas toujours bien adaptés aux souches en circulation.
Mais si le SRAS-CoV-2 évolue de manière à échapper plus lentement à l'immunité, il pourrait ressembler à la grippe B. Le rythme d'évolution plus lent de ce virus, comparé à celui de la grippe A, signifie que sa transmission est largement alimentée par les infections chez les enfants, qui sont moins immunisés que les adultes.
La rapidité avec laquelle le SRAS-CoV-2 évolue en réponse à l'immunité déterminera également si - et à quelle fréquence - les vaccins doivent être mis à jour. Selon M. Bedford, les offres actuelles devront probablement être mises à jour à un moment donné. Dans un préprint publiée en septembre, son équipe a trouvé des signes indiquant que le SRAS-CoV-2 évoluait beaucoup plus rapidement que les coronavirus saisonniers et même plus vite que la grippe A, dont la principale forme en circulation est appelée H3N2. M. Bedford s'attend à ce que le SRAS-CoV-2 finisse par ralentir pour retrouver un rythme d'évolution plus régulier. "Je ne sais pas s'il s'agira d'une évolution semblable à celle du H3N2, qui nécessitera une mise à jour du vaccin tous les ans ou tous les deux ans, ou d'une évolution plus grave", dit-il.
Bien que d'autres virus respiratoires, y compris les coronavirus saisonniers comme le 229E, offrent plusieurs possibilités d'avenir pour le SRAS-CoV-2, le virus pourrait prendre une toute autre direction, selon M. Rambaut et d'autres. La circulation élevée de Delta et la montée en puissance d'Omicron - favorisées par des déploiements inéquitables de vaccins dans les pays à faible revenu et des mesures de contrôle minimales dans certains pays riches comme les États-Unis et le Royaume-Uni - offrent un terrain fertile pour que le SRAS-CoV-2 fasse de nouveaux sauts évolutifs surprenants.
Traduit avec www.DeepL.com/Translator (version gratuite)
---------------
Ducouïte : maladie consistant à parsemer ses posts de "du coup" et "pour le coup" | TU des moteurs de recherche !