Reprise du message précédent :

 
Les épitopes d'anticorps c'est un des angles morts d'alphafold et des autres

Le retour des spécialistes en art de parler de ce qu'ils ne connaissent pas.

Merci beaucoup, j'appelle l'OMS et les labos

 
Il n'y a pas que pisseurs de code sur ce forum, il y a aussi quelques chercheurs en biologie

Le CAP ès COVID décerné par la HFR School of Virology va à nouveau nous être utile !

 
Voici la publication qui a servi de base à cet article : “Super-Spreaders” and Person-to-Person Transmission of Andes Virus in Argentina
 
Traduction (ChatGPT) d'un extrait sur la partie épidémiologique :

Avec l’apparition du syndrome pulmonaire à hantavirus ANDV à Epuyén (province de Chubut, Argentine) en 2018 et 2019, l’ANDV a suscité un regain d’attention concernant une possible transmission interhumaine. Un patient a été suspecté d’être à l’origine de l’infection chez plusieurs autres patients, suggérant qu’un événement initial de superpropagation avait déclenché les chaînes de transmission ultérieures.
 
[...]
 
Trois patients ont été les principaux moteurs de l’épidémie de syndrome pulmonaire à hantavirus ANDV à Epuyén et ont été à l’origine de 64 % des cas secondaires (21 des 33 cas). Les événements de transmission et d’exposition pour l’ensemble des 33 cas secondaires, ainsi que les quatre vagues d’infection humaine, ont été reconstitués à partir des relations épidémiologiques connues et probables entre les cas.
 

 
Nos résultats ont permis de retracer le premier événement de transmission interhumaine à une fête d’anniversaire réunissant environ 100 invités. Le patient index (Patient 1) a participé à l’événement pendant 90 minutes et présentait apparemment déjà des symptômes à ce moment-là, notamment de la fièvre et un malaise général. Cinq personnes (Patients 2 à 6), assises à proximité du Patient 1, ont signalé l’apparition de symptômes compatibles avec le syndrome pulmonaire à hantavirus ANDV entre 17 et 24 jours après la fête. Le Patient 2 a probablement été la source de six infections supplémentaires durant la phase prodromique précoce, en raison de sa vie sociale active. Le Patient 2 est décédé 16 jours après l’apparition des symptômes, et son épouse (Patient 9) était fébrile lorsqu’elle a assisté à sa veillée funèbre. Dix autres personnes ayant assisté à cette veillée et ayant été en contact étroit avec le Patient 9 sont tombées malades entre 14 et 40 jours après les funérailles du Patient 2.
 
Les 12 patients restants avaient chacun été en contact avec au moins un patient précédemment symptomatique. Quatre patients (Patients 10, 29, 33 et 34) pourraient avoir été infectés par plus d’une personne. L’intervalle sériel moyen (± écart-type) — c’est-à-dire le temps écoulé entre l’apparition des symptômes chez un cas primaire et celle des symptômes chez un cas secondaire épidémiologiquement lié — était d’environ 23 ± 7 jours. Les périodes d’incubation variaient de 9 à 40 jours.
 
Sur la base des données issues de cinq événements reconstitués de transmission interhumaine, la voie d’infection des cas secondaires était possiblement liée à l’inhalation de gouttelettes ou de virions aérosolisés. Le moment d’apparition des symptômes est également un élément critique. Dans 17 des 33 événements de transmission secondaire (52 %), la transmission d’une personne infectée à un contact devenu secondairement infecté a pu être établie avec précision au jour d’apparition de la fièvre chez le cas primaire, ce premier jour de fièvre constituant le seul moment d’interaction entre ces patients.
 
Bien que plusieurs procédures médicales à haut risque aient été réalisées chez des patients atteints du syndrome pulmonaire à hantavirus ANDV — notamment l’intubation orotrachéale et le nettoyage de liquides biologiques tels que les vomissements, les diarrhées et d’autres sécrétions — aucune infection nosocomiale n’a été signalée parmi les professionnels de santé ayant été en contact direct ou rapproché avec les patients dans les établissements de soins (Hospital Esquel Zonal et hôpital rural d’Epuyén). Environ 82 professionnels de santé ont été exposés à des patients symptomatiques présentant une infection confirmée par l’ANDV à l’Hospital Esquel Zonal entre le 2 et le 13 décembre 2018. Parmi les 45 personnes travaillant dans l’unité de soins intensifs et le service des urgences, seule une minorité utilisait une forme quelconque d’équipement de protection individuelle (notamment des masques N95, des masques N100 pour les intubations et les opérations de nettoyage, des lunettes de protection et des blouses jetables) lors des contacts directs avec des patients infectés. Néanmoins, nous avons identifié un événement secondaire de transmission nosocomiale survenu à l’Hospital Esquel Zonal, établissement de soins avancés. Deux autres événements de transmission nosocomiale se sont produits dans le plus petit hôpital rural d’Epuyén, pour lequel aucune information n’était disponible concernant l’utilisation des équipements de protection individuelle standard.
 
La valeur médiane postérieure du taux de reproduction R sur l’ensemble de l’épidémie était de 1,19 (intervalle de crédibilité à 95 % : 0,82 à 1,56), ce qui suggère que la souche ANDV Epuyén/18–19 possédait un potentiel de transmission suffisant pour assurer une transmission auto-entretenue (R > 1). La valeur médiane hebdomadaire de R (6,56 ; intervalle de crédibilité à 95 % : 2,55 à 13,51) a atteint un pic entre la semaine 47 et la semaine 48 (du 25 novembre au 1er décembre 2018), avant de diminuer en dessous de 1,00 à la fin janvier 2019. À titre de comparaison, la propagation de la souche Epilink/96 de l’ANDV avait été estimée avec une valeur moyenne de R de 0,7 (intervalle de confiance à 90 % : 0,2 à 1,1).
 
Autour du 31 décembre 2018, après la confirmation du 18e cas de syndrome pulmonaire à hantavirus ANDV, les autorités de santé publique ont ordonné des mesures d’isolement pour les patients symptomatiques ainsi qu’une auto-quarantaine pour les contacts à haut risque. La valeur médiane de R pour la transmission secondaire interhumaine avant la mise en place des mesures de contrôle était de 2,12 (intervalle de crédibilité à 95 % : 1,24 à 3,35). Après l’instauration de ces mesures, cette valeur médiane a diminué à 0,96 (intervalle de crédibilité à 95 % : 0,62 à 1,40).
 
J'aimerais bien accéder à un autre article sur le sujet, qui se penche plus sur le coté social de la réaction de la population locale : The Epuyén Outbreak of Hantavirus Pulmonary Syndrome, Argentina, 2018–2019
 
Je ne trouve que l'abstract, il n'est pas référencé sur sci-hub    
 
Following a transdisciplinary approach, an actor-oriented analysis and their interaction provide a better understanding of the process that led to this successful containment. It also gives important clues for the control of zoonotic outbreaks, with human-to-human transmission.
 

https://youtu.be/zMALuEYxK6U?si=ZZXmfRrhgraJaUV7

Je n'ai presque rien suivi et trop de pages à lire, yorarien ou RIP l'humanité dès cette année    ?

30% de létalité ca rigole pas.

Si on ne fait pas trop de conneries, y'a rien. Sauf qu'il y a quelques bourdes dans les gestion

 
Oui et non.
En argentine, les cas suivis montrent que généralement cela s’éteint à la 4ieme transmission à cause de la période d’incubation importante. Dans le pire des cas, 6 semaines x 4, on est plutôt sur du 6 mois.
Et c’est sans compter sur la densité de population bien différente dans nos pays développés et celle d’ Ushuaïa

T'étais pas visé.  

 
C'est bizarre qu'il ait été contaminé alors qu'il avait le menton parfaitement protégé

 
En fait Ushuaia pourrait être une fausse piste ?
 
Cf. supra  
 

 
   
 
Continuons la positivité: on va encore bien rigolé sur ce topic.

c'est ce qu'il faut pour sauver la planète  

Avec quel type de nœud ?

Y a rien...  et on fait confiance à des "quarantaines volontaires"…    

Hantavirus : les États-Unis «ne semblent pas prendre si au sérieux cette infection», regrettent plusieurs scientifiques français

 
http://lefigaro.fr/sciences/en-dir [...] e-20260512
 

L'étude de l'anniversaire en Argentine est rassurante mais j'en veux quand même aux premières com sur le fait qu'il n'y ait pas de transmission entre hommes pour cet hantavirus, c'est évidemment faux.
 
Le nombre de cas est faible pour conclure de manière solide mais il ne semble pas y avoir de transmission asymptomatique, c'est ce point qui a rendu le covid ingérable.
 
Je lis souvent "avec 35% de léthalité il ne peut pas être contagieux comme le covid", attention c'est faux, s'il se transmet avant l'apparition des symptômes et que le début de l'épidémie est mal géré, on est dans la même merde que le covid.
 
Et petit rappel, les 30 à 40% de léthalité c'est sans hospitalisation: en gros tu survis dans ton lit chez toi (ou pas), donc rien à voir avec un service de réa dans un pays occidental (et on retombe sur les mêmes problématiques de saturation de ces services).
 
Et point hyper important, selon la souche séquencée par la Suisse, le taux de mutation est tout à fait normal.
 
Bref, YaPAsRien mais à ce stade c'est gérable.
 
Pour moi, le point de bascule serait de voir du personnel médical tomber malade (personne équipée mais qui choppe le virus malgré tout, comme le covid en Chine au départ), là c'est game over.

 
Il aurait fallu les envoyer sur un bateau militaire médicalisé. J'imagine qu'il y a ce qu'il faut dans ces trucs en terme de réanimation...
 
Là ils prennent des places à l'hôpital, il y a un risque non négligeable de contamination (à voir ce qui s'est passé aux pays-bas avec le personnel soignant...), c'est nul

  C'est mal barré.
 

 
peut-être que c'est pas si facile que ça une sorte d'hôpital de campagne permettant d'isoler 150 personnes. Il faut des milliers de soignants + toute la logistique autour.
Mais en effet ce serait le plus safe, isoler tout le monde en un seul lieu pendant tout le temps nécessaire, plutôt que de les éparpiller aux quatre coins du monde

Sur LCI juste à l'instant. Un médecin dit qu'on ne sait pas comment se transmet CE virus particulier. Il a dit qu'il se transmet airborne mais on ne comment pas la taille des gouttelettes requises, ni s'il peut se transmettre en aérosol...  
J'ai vraiment l'impression de revivre les débuts du COVIDs.  
Même chronologie.
- Ça ne se transmet pas entre humains.-> ah en fait si
- Ça se transmet uniquement par contact -> ah en fait non, c'est airborne
- Ça se transmet par airborne, mais il faut des contacts très rapproché -> on ne sait plus
Etc...
 
Mais surtout pas de panique, ya rien.  

 
   
 
Ca a été souvent dit sur le topic US: avec de tels baltringues à la santé et tout le reste, faudrait pas un nouveau covid.

Drap

  ça réglerait peut-être beaucoup de choses chez eux.

Le problème c'est que si c'est la merde chez eux, ce sera la merde partout dans le monde.
Il aurait fallu laisser les adultes gérer et confiner tout les passagers dans un hopital de campagne aux Canaries. Les Européens auraient eu les moyens de le faire.

 
N'empêche, on a maintenant des outils de biologie/chimie computationnelle bien plus performants qu'en 2020. Ou qui n'existait tout simplement pas.
Toutes ces intelligence artificielles génératives comme ChatGPT/Claude ont aussi leur équivalent dans le langage moléculaire / génomique / protéique / structure.
Donc on peut plus facilement créer de nouvelles protéines / anticorps et les tester ensuite en labo.
 
D'où le prix Nobel de 2024: https://www.sorbonne-universite.fr/ [...] tures-deux
 
 

"épitopes d'anticorps", ça ne veut rien dire en soi.
 
Epitope = partie d'une protéine étrangère (antigène = l'autre) qui peut être reconnue par un anticorps.
Anticorps = le soi = complexe protéique en forme de Y, capable de reconnaître des corps étrangers dans l’organisme. L'organisme génère énormément d'anticorps mutants, et ceux qui détectent des épitopes vont être ensuite sélectionnés et amplifiés en masse => immunité.  
 
 
Mais si tu possèdes des structures homologues d'autres complexes Anticorps-Epitope, ça doit pouvoir se faire. Et on connait la séquence du génome d'Hantavirus, et les glycoprotéines à cibler. Donc les épitopes possibles sont relativement restreints.
 

Oh, ils sont déjà au courant tu penses bien.

Donc en gros, c'est soit une hecatombe 3x pire que le Covid ou alors un gros flop?  
 
Bref, le truc que je ne capte pas, c'est pourquoi des analyses n'ont pas été faites anterieurement, vu que ce virus date

 
C'est aussi ce que je comprends. Soit c'est un virus qui se propage difficilement, et il n'y aura pas d'épidémie, soit c'est un virus qui se propage facilement et ce sera une hécatombe pire que celle du COVID.
 
Pour les analyses dont tu parles... Il est à parier que ce virus est une évolution d'un virus préexistant qui se transmettait très peu entre humain à la base (c'est peut-être toujours le cas, mais c'est la véritable inconnue... )  

Qui a mis son masque FFP2 ce matin ?

 
Si ça flop, on le saura fin de semaine.    
 
Il est suivi en Argentine depuis un moment, mais il a fait du tourisme là.    
 

 
ben elles ont été faites suite aux épidémies notamment 2018 cf. supra.

Pourquoi fin de semaine ?
Le virus peut tout à fait se répandre à bas bruit pendant 1 à 2 mois sans que l'on puisse en mesurer les effets avant qu'il ne soit trop tard.

Après Trump il y a encore du monde au secrétariat ?

 
Non.    

Cette fois tu feras ASH (pas sûr que tu puisses faires infirmier ou médecin) auprès des malades, on verra si c'est aussi cool le confinement.

Désolé d'être aussi dur mais perso j'ai pas du tout apprécié cette période. Ma femme bossait en unité Covid, sa chef se débrouillait comme elle pouvait pour qu'ils aient des blouses, masques (ma femme avait eu RDV un soir @22h en rentrant du boulot dans un cimetière pour aller chercher un peu de matos).
Pendant 5 semaines, on (mes enfants et moi) a fait en sorte de ne pas croiser ma femme à la maison, elle avait peur de nous le refiler malgré les précautions.
Elle ne comptait plus les sacs mortuaires qu'elle refermait et la douleur des familles qui ne pouvaient pas dire un dernier "au revoir" à leur défunt.

Non c'était pas une belle période.

Y'a surtout des experts en ppt sur ce forum.

 
Merci du retour.
 
Reste que les mutations se produisent au fil des réplications, donc plus il y aura de gens contaminés, plus des mutations nouvelles peuvent apparaître.  
 
 
 
Bref, on va être bien.