RAID 5, il faut calculer la parité... du RAID 5 charge le CPU si il est réalisé en soft, du RAID 1 est beacoup plus économique de ce côté. Quand tu disposes d'un contrôlleur RAID, c'est ce dernier qui effectue le calcul de la parité.
Pour un simple serveur de fichier pas de différences flagrantes entre Windows 2000 serveur et Windows 2003.
Vu l'utilisation pour un réseau particulier, du RAID 5 en Soft devrait être suffisant. D'un autre point de vue il n'est pas rare sur les cartes mères actuelles de disposer d'un contrôlleur RAID 1, ce qui te permetterait d'assurer avec deux disques IDE ton système. Puis éventuellement d'acheter un contrôlleur RAID 5 d'entrée de gamme pour mettre tes disques de données.
L'avantage d'un contrôlleur matériel, c'est que c'est ce dernier qui stocke les informations sur la constitution de ton array, et donc en cas de faille de l'OS il n'y a pas de soucis. Où ca devient plus ennuyeux c'est si le contrôlleur RAID lâche (ce qui est plutot rare)