Le defrag de Windows vaut ce qu'il vaut : il ne fera jamais des miracles.
Si tu veux faire quelque chose de vraiment, propre, en particulier sur les serveurs, il faut des logiciels payants. Je te conseille notamment O&O Defrag Server Edition : tu peux déployer le logiciel à distance, et le contrôler à partir d'un console centralisée (avec planification, etc.)