Il me semble que si tu choisis le procédé Neural:X sur ton ampli, il va créer une sorte de 5.1 (voire 7.1) à partir d'une source stéréo.
Sauf que si je comprends bien ton problème, ton ampli reçoit le E-AC3 en stéréo alors qu'il devrait le recevoir en 5.1.
Il faudrait plutôt parvenir à envoyer le E-AC3 5.1 tel quel (si tu parles bien de fichiers E-AC3 5.1 et pas 2.0), parce que là ta source fait un downmix (donc tu perds la spatialisation) puis ton ampli recrée une spatialisation sur base de ce flux downmixé, ce qui n'est pas l'idéal.