Les Modeline dans le xorg.conf c'est fini, non? maintenant il faut faire du xrandr --newmode, xrandr --addmode... et je ne sais pas clairement où l'on est sensé scripter ça, donc j'ai fait une bidouille.
Pour le problème de la debian sur VM, ça doit être que tu dois installer les additions client Virtualbox (si ce n'est pas Virtualbox, il y a peut-être un truc équivalent à faire)