à mon avis, la MBR des 2 disks est utilisées... c'est super galère d'installer XP sur 2 disks quand ceux-ci sont branchés en meme temps (ou alors, on peut pas booter sur le 2nd disk).
je suppose aussi que le systeme à garder est celui qui est sur le disk qui contient la MBR utilisée.
dans ce cas, ta méthode est pas loin de la mienne, sauf qu'avec la mienne, t'es sûr de pas laisser de crasse derrière ^_^
au fait, je suppose aussi que tu as fais une partition pour le system sans rien mettre d'autre... sinon c sûr que le format est un peu trop radical...