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[PHP] Communication Html/PHP

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Auteur	Sujet : [PHP] Communication Html/PHP

Cachouguinteur

Yippie ki yay

Bonjour, j'ai un problème tout con mais que je n'arrive pas à résoudre :

En fait j'ai une page html où l'utilisateur rentre une séquence d'ADN, enfin peu importe, et je voudrais qu'à partir de cette page, 2 pages php lui soient associées et qu'on puisse choisir entre les 2 en cliquant sur 2 boutons "submit" différents...

Je sais pas si c'est possible

Merci

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Cachouguinteur

Yippie ki yay

personne n'a de petite idée?? dites moi si vous n'avez pas compris ce que je voulais dire

flo850

moi je

pas trop compris

tu peux faire deux formulaire ,non?

Message cité 1 fois

---------------

CyberDenix

flo850 a écrit :

tu peux faire deux formulaire, non?

Pas mieux !

Au pire tu peux faire deux <input name='...' type='image' .../> (chacun correspondant à un bouton).
Lorsque tu testes la valeur, tu dois faire :

Code :

if (isset($_POST['monnomdebouton_x']) || isset($_POST['monnomdebouton_y']) {
  // monnomdebouton (bouton graphique) a été pressé par l'utilisateur ; x et y sont des coordonnées
}

Message édité par CyberDenix le 27-04-2008 à 21:03:08

---------------
Directeur Technique (CTO)

Cachouguinteur

Yippie ki yay

c'est à dire faire 2 formulaires?

Martius

il/lui

Non, mais utilises une page intermédiaire :

Code :

<form id="form" method='post" action="page_intermediaire.php">
(...)
<input type="submit" name="mode1" value="Mode 1" />
<input type="submit" name="mode2" value="Mode 2" />

page_intermediaire.php :

Code :

if(isset($_POST['mode1']))
include('mode1.php');
elseif(isset($_POST['mode2']))
include('mode2.php');

ou mode1.php et mode2.php sont "les pages associées".

Message cité 1 fois

masterpsx

Aigloun foutougrafe

Même si j'en vois pas trop l'interet, tu peut aussi utiliser une petite fonction javascript sur le 2éme bouton (qui ne devra pas être un submit) pour modifier "action" du formulaire et envoyer le formulaire.

Cachouguinteur

Yippie ki yay

ok, merci, j'ai réussi à faire ce que je voulais gràce à Martius

Mais j'ai d'autres soucis : je dois créer des histogrammes avec jpgraph en fonction d'une séquence de lettres rentrées par l'utilisateur. La séquence qu'il rentre est constitué uniquement de A,T,C et G

Donc mon souci n°1 est de "corriger" sa séquence tout ce qui n'est pas A,T,C ou G, c'est à dire le chiffres, les autres lettres, les espaces, ... pour que je puisse ensuite le traiter.

Mon souci n°2 est plus compliqué à mon avis : je crée des histo avec jpgraph comme je l'ai dit. L'histo est basé sur 2 tableaux. Je vais faire un exemple pour que ce soit plus clair :

Imaginons que l'utilisateur rentre un phrase et que je veuille compter le nombre de fois qu'il y a le même mot. Je crée donc 2 tableaux avec dans le 1er les mots que je voudrais compter et dans le second leur fréquence.

1er tableau 'banane' 'cerise' 'pomme' 'poire'
2eme tableau 'freq[banane]' 'freq[cerise]' 'freq[pomme]' 'freq[poire]'

Mais le probleme c'est que si dans la phrase il n'y pas banane par exemple, eh bien l'histogramme plante au lieu de m'afficher "0".
Peut etre un truc "if/else" ??

Message cité 1 fois

sielfried

Cachouguinteur a écrit :

array_count_values(preg_split('/\s+/', $phrase))

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Cachouguinteur

Yippie ki yay

merci de ta réponse mais ça veut dire quoi?? excuse je suis pas très expérimenté en php...

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sielfried

Ben ça te sort la fréquence des mots dans une phrase (même si c'est une version assez naïve là dans sa conception du "mot" ).

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StarCraft Professional Gaming Database | [Ze Topic] Starcraft/BroodWar

Cachouguinteur

Yippie ki yay

mais dans mon prog j'ai déjà les freq, mon souci c'est juste que si dans la phrase il n'y a pas un mot alors que c'est une entrée du tableau, l'histo plante au lieu de me dire qu'il y est 0 fois

Message cité 1 fois

_Rit0n_

Chaque bouton submit va avoir l'url differente, sa doit suffire non?

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Site web : http://nobock.fr

sielfried

Cachouguinteur a écrit :

mais dans mon prog j'ai déjà les freq, mon souci c'est juste que si dans la phrase il n'y a pas un mot alors que c'est une entrée du tableau, l'histo plante au lieu de me dire qu'il y est 0 fois

Ah ok j'avais pas exactement compris ce que tu voulais (ma manie de lire les posts en vertical ). Donc c'est pas la fréquence des mots (quels qu'ils soient) d'une phrase que tu veux, mais la fréquence d'un ensemble de mots donnés...

Bon, ben commence par montrer ce que tu fais pour construire ton truc. [:petrus75]

Message édité par sielfried le 28-04-2008 à 21:19:11

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CyberDenix

Code :

if (isset($freq['banane'])) {
  // $freq['banane'] existe !
}
else {
  // $freq['banane'] n'existe pas !
}

Message cité 1 fois
Message édité par CyberDenix le 28-04-2008 à 21:44:07

---------------
Directeur Technique (CTO)

sielfried

Et donc ?

edit: wups, je croyais que c'était un post de Cachou.

Message édité par sielfried le 29-04-2008 à 10:05:23

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Cachouguinteur

Yippie ki yay

je vais mettre un morceau de mon code brut, dites moi ce que vous comprenez pas

skeye

CyberDenix a écrit :

Code :

if (isset($freq['banane'])) {
  // $freq['banane'] existe !
}
else {
  // $freq['banane'] n'existe pas !
}

La fonction array_key_exists est là pour ça dans les tableaux.

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Cachouguinteur

Yippie ki yay

Code :

<?
$sequ=$_POST['sequence'];
$long=strlen($sequ);
$traduction='';
$code_choisi=$_POST['code_choisi'];
$aa_choisi=$_POST['aa_choisi'];
// Il faut au préalable traiter la séquence pour vérifier plusieurs choses : qu'il n'y a que des A, T, C, G ou U
$sequ=strtoupper($sequ); // Met toute le séquence en majuscule
$sequ=str_replace ("U", "T", $sequ); // Remplace les U par des T
$code=array("GCT"=>"A","GCC"=>"A","GCA"=>"A","GCG"=>"A","CGT"=>"R","CGC"=>"R","CGA"=>"R","CGG"=>"R",
"AGA"=>"R","AGG"=>"R","AAT"=>"N","AAC"=>"N","GAT"=>"D","GAC"=>"D","TGT"=>"C","TGC"=>"C","CAA"=>"E",
"CAG"=>"E","GAA"=>"Q","GAG"=>"Q","GGT"=>"G","GGC"=>"G","GGA"=>"G","GGG"=>"G","CAT"=>"H","CAA"=>"H",
"ATT"=>"I","ATC"=>"I","ATA"=>"I","TTA"=>"L","TTG"=>"L","CTT"=>"L","CTC"=>"L","CTA"=>"L","CTG"=>"L","AAA"=>"K",
"AAG"=>"K","ATG"=>"M","TTT"=>"F","TTC"=>"F","CCT"=>"P","CCC"=>"P","CCA"=>"P","CCG"=>"P","TCT"=>"S",
"TCC"=>"S","TCA"=>"S","TCG"=>"S","AGT"=>"S","AGC"=>"S","ACT"=>"T","ACC"=>"T","ACA"=>"T","ACG"=>"T",
"TGG"=>"W","TAT"=>"Y","TAC"=>"Y","GTT"=>"V","GTC"=>"V","GTA"=>"V","GTG"=>"V","TAA"=>"Z","TAG"=>"Z",
"TGA"=>"Z" ); //tableau du code génétique
(...)
for ($i=0; $i<$long; $i+=3)
{
$codon=substr($sequ,$i,3);
$AA=$code[$codon];
if(empty($AA_tab[$AA]['total']))
{
$AA_tab[$AA]['total']= 1;
}
else
{
$AA_tab[$AA]['total']++;
}
if(empty($AA_tab[$AA][$codon]))
{
$AA_tab[$AA][$codon] = 1;
}
else
{
$AA_tab[$AA][$codon]++;
}
}
for ($lettre=ord('A');$lettre<=ord('Z');$lettre++) //boucle qui parcoure l'alphabet
{
if (isset($AA_tab[chr($lettre)]))
{
foreach ($AA_tab[chr($lettre)] as $codon => $nombre)
{
if ($codon!="total" )
{
$pourcentage[chr($lettre)][$codon] = $nombre*100 / $AA_tab[chr($lettre)]['total'];
}
else
{
$pourcentage[chr($lettre)][$codon] = 0;
}
}
}
}
//Et après je crée mes histo avec JpGraphp pour chaque AA (acide aminé), là je met en exemple un histo
include ("jpgraph-2.3/src/jpgraph.php" );
include ("jpgraph-2.3/src/jpgraph_bar.php" );
$tableau_codons = array('CGT', 'CGC', 'CGA', 'CGG', 'AGA', 'AGG');
$tableau_pourcentages = array($pourcentage['R']['CGT'], $pourcentage['R']['CGC'], $pourcentage['R']['CGA'], $pourcentage['R']['CGG'], $pourcentage['R']['AGA'], $pourcentage['R']['AGG']);
$graph = new Graph(400,250);
$graph->SetScale("textlin" );
$graph->SetShadow();
$graph->img->SetMargin(40,30,25,40);
$bplot = new BarPlot($tableau_pourcentages);
$bplot->SetFillColor(array('red', 'green', 'blue', 'orange', 'black', 'purple'));
$bplot->SetShadow();
$bplot->value->Show();
$bplot->value->SetFont(FF_FONT1,FS_BOLD);
$bplot->value->SetFormat('%d');
$graph->Add($bplot);
$graph->title->Set("Graphique : Arginine" );
$graph->title->SetFont(FF_FONT1,FS_BOLD);
$graph->xaxis->title->Set("Codons" );
$graph->yaxis->title->Set("Pourcentages" );
$graph->yaxis->title->SetFont(FF_FONT1,FS_BOLD);
$graph->xaxis->title->SetFont(FF_FONT1,FS_BOLD);
$graph->xaxis->SetTickLabels($tableau_codons);
$graph->Stroke();
break;
?>

Cachouguinteur

Yippie ki yay

et donc mon souci c'est que ce si dans $sequ, l'utilisateur n'a pas mis CGT par exemple, eh bien l'histogramme en question plante au lieu de m'afficher 0 et me dit "undefined index : CGT"...

Message cité 1 fois

skeye

Cachouguinteur a écrit :

et donc mon souci c'est que ce si dans $sequ, l'utilisateur n'a pas mis CGT par exemple, eh bien l'histogramme en question plante au lieu de m'afficher 0 et me dit "undefined index : CGT"...

donne la ligne sur laquelle ça plante...je vois pas l'accès à $sequ qui peut planter dans ton paté de code là... [:petrus75]

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sielfried

Ça a l'air vachement compliqué ton truc. [:petrus75]

Je pense que tu ferais mieux d'utiliser des fonctions du genre :
http://fr.php.net/manual/fr/function.str-split.php (pour couper ta chaîne en codes de 3 caractères)
http://fr.php.net/array_count_values (calcule une fréquence)
etc.

Message édité par sielfried le 29-04-2008 à 10:21:58

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Paulp

~, sweet ~

Le souci est là :

Code :

if(empty($AA_tab[$AA][$codon]))
{
$AA_tab[$AA][$codon] = 1;
}

Tu initialises à 1 si c'est vide. Il faudrait tout initialiser à 0 avant :

Code :

$code=array("GCT"=>"A",... ); //tableau du code génétique
(...)
foreach($code as $val)
$AA_tab[$val]['total']=0;
for ($i=0; $i<$long; $i+=3)
{
$codon=substr($sequ,$i,3);
$AA=$code[$codon];
$AA_tab[$AA]['total']++;
...

Cachouguinteur

Yippie ki yay

ben ça plante à la ligne 69 dans mon exemple càd qd il accède au tableau des pourcentages

Message cité 1 fois

skeye

Cachouguinteur a écrit :

ben ça plante à la ligne 69 dans mon exemple càd qd il accède au tableau des pourcentages

Si ton tableau pourcentage['R'] a des indices fixes et prédéfinis, initialise-le par défaut à zéro pour tous ces indices avant de le remplir.

Message édité par skeye le 29-04-2008 à 10:34:20

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Cachouguinteur

Yippie ki yay

ok donc je vais essayer la suggestion de Paulp

Cachouguinteur

Yippie ki yay

je doit donc remplacer :

Code :

for ($i=0; $i<$long; $i+=3)
{
$codon=substr($sequ,$i,3);
$AA=$code[$codon];
if(empty($AA_tab[$AA]['total']))
{
$AA_tab[$AA]['total']= 1;
}
else
{
$AA_tab[$AA]['total']++;
}
if(empty($AA_tab[$AA][$codon]))
{
$AA_tab[$AA][$codon] = 1;
}
else
{
$AA_tab[$AA][$codon]++;
}
}

par :

Code :

foreach($code as $val)
$AA_tab[$val]['total']=0;
for ($i=0; $i<$long; $i+=3)
{
$codon=substr($sequ,$i,3);
$AA=$code[$codon];
$AA_tab[$AA]['total']++;
}

Message cité 1 fois

Paulp

~, sweet ~

Cachouguinteur a écrit :

je doit donc remplacer :
...

Ah je n'avais pas vu la distinction $AA_tab[$AA]['total'] / $AA_tab[$AA][$codon]
je vais regarder ton code en détail ...

EDIT :

J'espere avoir compris ce que tu veux faire, ...
Essaie ce code là, j'ai essayé de rester le plus proche de ce que tu faisais, en simplifiant

Code :

$code=array("GCT"=>"A","GCC"=>"A","GCA"=>"A","GCG"=>"A","CGT"=>"R","CGC"=>"R","CGA"=>"R","CGG"=>"R",
"AGA"=>"R","AGG"=>"R","AAT"=>"N","AAC"=>"N","GAT"=>"D","GAC"=>"D","TGT"=>"C","TGC"=>"C","CAA"=>"E",
"CAG"=>"E","GAA"=>"Q","GAG"=>"Q","GGT"=>"G","GGC"=>"G","GGA"=>"G","GGG"=>"G","CAT"=>"H","CAA"=>"H",
"ATT"=>"I","ATC"=>"I","ATA"=>"I","TTA"=>"L","TTG"=>"L","CTT"=>"L","CTC"=>"L","CTA"=>"L","CTG"=>"L","AAA"=>"K",
"AAG"=>"K","ATG"=>"M","TTT"=>"F","TTC"=>"F","CCT"=>"P","CCC"=>"P","CCA"=>"P","CCG"=>"P","TCT"=>"S",
"TCC"=>"S","TCA"=>"S","TCG"=>"S","AGT"=>"S","AGC"=>"S","ACT"=>"T","ACC"=>"T","ACA"=>"T","ACG"=>"T",
"TGG"=>"W","TAT"=>"Y","TAC"=>"Y","GTT"=>"V","GTC"=>"V","GTA"=>"V","GTG"=>"V","TAA"=>"Z","TAG"=>"Z",
"TGA"=>"Z" ); //tableau du code génétique
(...)
foreach($code as $codon=>$aa){ // Initialisation des compteurs à 0
$AA_tab[$aa][$codon]= 0;
}
for ($i=0; $i<$long; $i+=3){ // Pour chaque codon de la sequence
$codon=substr($sequ,$i,3);
$AA=$code[$codon];
$AA_tab[$AA][$codon]++; // On met à jour le compteur
}
// Calcul des pourcentages
foreach($AA_tab as $aa=>$codons){ // Pour chaque acide aminé
$tot = array_count($codons); // On calcule le total d'occurences
foreach($codons as $codon=>$nombre){ // Et pour chaque codon correspondant à cet AA
$pourcentage[$aa][$codon]=$nombre*100/$tot; // On calcule le pourcentage
}
}
// affichage
...

Sinon, avec str_split :

Code :

$code=array("GCT"=>"A","GCC"=>"A","GCA"=>"A","GCG"=>"A","CGT"=>"R","CGC"=>"R","CGA"=>"R","CGG"=>"R",
"AGA"=>"R","AGG"=>"R","AAT"=>"N","AAC"=>"N","GAT"=>"D","GAC"=>"D","TGT"=>"C","TGC"=>"C","CAA"=>"E",
"CAG"=>"E","GAA"=>"Q","GAG"=>"Q","GGT"=>"G","GGC"=>"G","GGA"=>"G","GGG"=>"G","CAT"=>"H","CAA"=>"H",
"ATT"=>"I","ATC"=>"I","ATA"=>"I","TTA"=>"L","TTG"=>"L","CTT"=>"L","CTC"=>"L","CTA"=>"L","CTG"=>"L","AAA"=>"K",
"AAG"=>"K","ATG"=>"M","TTT"=>"F","TTC"=>"F","CCT"=>"P","CCC"=>"P","CCA"=>"P","CCG"=>"P","TCT"=>"S",
"TCC"=>"S","TCA"=>"S","TCG"=>"S","AGT"=>"S","AGC"=>"S","ACT"=>"T","ACC"=>"T","ACA"=>"T","ACG"=>"T",
"TGG"=>"W","TAT"=>"Y","TAC"=>"Y","GTT"=>"V","GTC"=>"V","GTA"=>"V","GTG"=>"V","TAA"=>"Z","TAG"=>"Z",
"TGA"=>"Z" ); //tableau du code génétique
(...)
$codons=str_split($sequ, 3) // Decoupage de la sequence en tableaux de codons
$n_occurences=array_count_values($codons) // Calcul du nombre d'occurences de chaque codon
foreach($code as $codon=>$aa) // Tri par acide aminé
$n_occurences_trie[$aa][$codon]=(empty($n_occurences[$codon])?0:$n_occurences[$codon]);
foreach($code as $codon=>$aa) // Calcul des pourcentages
$pourcentage[$aa][$codon]=100*$n_occurences_trie[$aa][$codon]/array_sum($n_occurences_trie[$aa])
// affichage
...

Message édité par Paulp le 29-04-2008 à 15:23:19

Cachouguinteur

Yippie ki yay

Merci Paulp et puis les autres, c'est sympa de se pencher sur mon problème

Cachouguinteur

Yippie ki yay

merci Paulp, il me dit "Call to undefined function array_count()" ce qui correspond à la ligne 25 de ton ex 1

EDIT : j'ai mis array_count_values à la place, et maintenant j'ai un un souci à la ligne 27 "Unsupported operand types"

Message édité par Cachouguinteur le 29-04-2008 à 19:14:00

Cachouguinteur

Yippie ki yay

qqun a une idée??

Paulp

~, sweet ~

essaye ca :
$tot=array_sum($codons);

Cachouguinteur

Yippie ki yay

maintenant il est pas content parce il ne veut pas trop diviser par zéro. Je fait une boucle if??

Message cité 1 fois

skeye

Dis, tu comptes vraiment venir demander sur le forum à CHAQUE problème que tu peux croiser? [:pingouino]

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Paulp

~, sweet ~

Cachouguinteur a écrit :

maintenant il est pas content parce il ne veut pas trop diviser par zéro. Je fait une ~~boucle~~ if??

un test if, ou plus simplement, avec l'operateur conditionnel ternaire

Code :

$pourcentage[$aa][$codon]=($tot ? ($nombre*100/$tot) : 0);

Cachouguinteur

Yippie ki yay

youpiiiiiii merci paulp, ça marche du tonnerre. Merci merci merci. Et désolé de vous avoir saoulé

Cachouguinteur

Yippie ki yay

un petit up, car j'aurais à nouveau besoin d'aide :

Code :

foreach($code as $codon=>$AA){ // Initialisation des compteurs à 0
$AA_tab[$AA][$codon]= 0;
}
for ($i=0; $i<$long; $i+=3){ // Pour chaque codon de la sequence
$codon=substr($sequ,$i,3);
@$AA=$code[$codon];
@$AA_tab[$AA][$codon]++; // On met à jour le compteur
}
// Calcul des pourcentages
foreach($AA_tab as $AA=>$codons) // Pour chaque acide aminé
{
echo "L'acide aminé ", $AA, " est codé par : ";
$tot = array_sum($codons); // On calcule le total d'occurences
foreach($codons as $codon=>$nombre) // Et pour chaque codon correspondant à cet AA
{
$pourcentage[$AA][$codon]=($tot ? ($nombre*100/$tot) : 0); // On calcule le pourcentage
echo "$codon à ", round($pourcentage[$AA][$codon]),"% ";
}
echo "<br>";
}

ça m'affiche un truc du genre :

L'acide aminé A est codé par : GCT à 0% GCC à 0% GCA à 0% GCG à 0%
L'acide aminé R est codé par : CGT à 0% CGC à 0% CGA à 0% CGG à 0% AGA à 0% AGG à 0%
L'acide aminé N est codé par : AAT à 0% AAC à 0%
L'acide aminé D est codé par : GAT à 0% GAC à 0%
L'acide aminé C est codé par : TGT à 0% TGC à 0%
L'acide aminé E est codé par : GAA à 0% GAG à 0%
L'acide aminé Q est codé par : CAA à 0% CAG à 0%
L'acide aminé G est codé par : GGT à 0% GGC à 0% GGA à 0% GGG à 0%
L'acide aminé H est codé par : CAT à 0% CAC à 0%
L'acide aminé I est codé par : ATT à 0% ATC à 0% ATA à 0%
L'acide aminé L est codé par : TTA à 0% TTG à 0% CTT à 0% CTC à 0% CTA à 0% CTG à 0%
L'acide aminé K est codé par : AAA à 100% AAG à 0%
L'acide aminé M est codé par : ATG à 0%
L'acide aminé F est codé par : TTT à 0% TTC à 0%
L'acide aminé P est codé par : CCT à 0% CCC à 0% CCA à 0% CCG à 0%
L'acide aminé S est codé par : TCT à 0% TCC à 0% TCA à 0% TCG à 0% AGT à 0% AGC à 0%
L'acide aminé T est codé par : ACT à 0% ACC à 0% ACA à 0% ACG à 0%
L'acide aminé W est codé par : TGG à 0%
L'acide aminé Y est codé par : TAT à 0% TAC à 0%
L'acide aminé V est codé par : GTT à 0% GTC à 0% GTA à 0% GTG à 0%
L'acide aminé * est codé par : TAA à 0% TAG à 0% TGA à 0%

Et en fait j'aurai aimé savoir comment faire pour que si jamais le % est nul, eh bien ne pas l'afficher

sielfried

http://fr.php.net/manual/en/control-structures.if.php ? [:petrus75]

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tgmg

Martius a écrit :

Non, mais utilises une page intermédiaire :

Code :

<form id="form" method='post" action="page_intermediaire.php">
(...)
<input type="submit" name="mode1" value="Mode 1" />
<input type="submit" name="mode2" value="Mode 2" />

page_intermediaire.php :

Code :

if(isset($_POST['mode1']))
include('mode1.php');
elseif(isset($_POST['mode2']))
include('mode2.php');

ou mode1.php et mode2.php sont "les pages associées".

salut,
j'ai probleme moins complexe:

je travail sur un scpt de traduction d'ADN en acide aminé en php . sans tenir compte des introns etc.
j'ai un formulaire que je souhaite relier a une base de donné contenant les codon et les AA aminé correspondants. dans le formulaire je colle ma séquence et je clique sur un bouton traduction pour avoir la correspondance en AA

Alisteroid

Suffit d'utiliser la fonction adn_decode de php [:torsadealanapo:2]

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