J'avais eu un problème (quasiment) similaire avec mon CF. Les cartes une par une fonctionnaient très bien, mais ensemble, je n'avais pas d'affichage.
Oui, il est bien possible de de configurer les ports PCI-e, et sur ta carte mère, ça doit aussi être faisable.
Par défaut, j'étais en "Auto", et je n'avais pas d'affichage. En passant en Gen1 -> Affichage et tout roule.
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« Odi panem quid meliora. Ça ne veut rien dire, mais je trouve que ça boucle bien »