Bon alors déja pour moi, ton père devrait être en "accident de travail" et non en "arrêt maladie". En effet, son état provient d'un fait qui s'est produit sur son lieu de travail et pendant ses horaires de travail.
Le médecin aurait dû faire une feuille d'accident de travail et non une feuille de maladie (sur ce point, j'en suis sûr, c'est plus ou moins mon job)
Les lettres recommandées que ton père reçoit lors de son arrêt sont illégales puisque lors d'un arrêt, le contrat de travail est suspendu, on ne peut pas licencier quelqu'un en arrêt (faut attendre son retour).
Sauf jurisprudence contraire (que je ne connais pas, mais qui existe peut etre), ton père a tout intéret à retourner travailler pour ne pas être licencié pour abandon de poste.
Concernant les indemnités, des règles existent selon les conventions collectives. Il y a peut etre moyen de grapiller un peu sur le préjudice des coups et blessures.
Dans tous les cas, trouver un bon avocat en droit social.
Bon courage