En cas de réinstallation de windows, tu démarres sous DOS. les éventuelles restrictions opérées dans la BDR (obligation d'ouverture de session, blocages, ...) sont donc inopérentes.
Ce serait plutôt du coté du BIOS qu'il faudrait regarder pour le reconnaissance de l'USB dès le boot.
Il est fort possible que tu doives passer par un démarrage sur disquette au préalable si ton BIOS est incapable de booter sur un périphérique USB.