Ta partition de boot est elle en NTFS et formatée par Win2k ? Si tel est le cas cela va être assez problématique, en effet le NTFS 5.0 de Win2k n'est supporté par NT4 qu'a partir du SP4, si tu n'intègres pas le SP4 a ton média d'installation il est probable que NT4 ne voit pas correctement cette partition. Dans le cas contraire, tu peux faire une installation de NT4 puis booter sur le CD d'installation de Win2k pour réparer les fichiers de démarrage.