Quel est le but ?
Générer des documents Latex ou générer des documents Pdf ?
Lyx génère des documents Latex. Lyx peut inclure des documents Pdf, mais ne génère pas de documents Pdf.
Pour générer des document Pdf, il existe beaucoup d'outils, dont Ghostscript. Bien que Ghostscript soit une usine à gaz, peu facile à installer et à utiliser, il est souvent cité, par exemple sur la page http://wiki.lyx.org/FAQ/PDF, probablement parce qu'il est Open Source.
Pour convertir un document Latex en un document PDF, il faut l'exporter en DVI, puis convertir le DVI en postscript (PS), et enfin convertir le PS en PDF. Voir http://www.karakas-online.de/mySGM [...] o-pdf.html