Salut,
A défaut d'une solution idéale, si tu as réussi à obtenir un mp4 sans son, et que tu disposes du wav, tu peux facilement les combiner avec ffmpeg. C'est un outil gratuit, très connu et donc bien documenté si tu veux ajuster les paramètres. Il existe certainement des outils graphiques pour l'utiliser, mais je ne pourrai pas t'en conseiller, je l'utilise en ligne de commande.
Dans ton cas, la commande serait un truc du genre :
ffmpeg -i video.mp4 -i audio.wav -c:v copy -c:a aac output.mp4
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Si ça intéresse quelqu'un, il me reste quelques broutilles à donner