Juste pour vous donner des idées...
 
Actuellement j'utilise XML/XSL pour gérer la doc. d'une application écrite en C.  
 
Pour l'instant on prend une copie du source qu'on garnit ensuite de balises (à la main :-( ), ensuite on valide par rapport à une DTD et on génère la doc en HTML.  
 
Notez qu'il n'est pas inpensable de développer directement sur base du XML. Il suffit après de le transformer deux fois : une première fois en language C, et ensuite en HTML.  
 
Une solution élégante serait de confier les transformations annexe compilations à un utilitaire de style 'make' pour éviter d'oublier une étappe dans la procédure...
 
Ca vous inspire?
 
Avander

c'est une bonne idée... on a un éditeur maison qui nous permet de coder le comportement d'une classe générique bien particulière fait avec jEdit et on stocke le code java tapotté dans du XML.
 
quand on veut compiler la classe, on exécute du XSL qui extrait le code java que l'on insère dans un template de la classe et les commentaires filent dans le format javadoc.
 
on javac, on javadoc et hop! on a tout.