En supposant que la structure est mutualisée, il ne devrait pas y avoir trop de changement à faire. Savoir si c'est "chaud" ou pas dépend de tes connaissances ...Ce qui va se passer, c'est que plusieurs documents (un par frame) vont se retrouver dans le même document avec plusieurs "div". Le gros du boulot consistera à mon avis à bien disposer les "div", et cela grâce au CSS.
La difficulté dépendra aussi des exigences (résultat imposé strictement ? Compatible IE / Gecko ? )
Dans tous les cas, commence par faire des sauvegardes du site puis développe en local ("EasyPhp" ). J'espère enfoncer une porte ouverte en disant ça ... Bon courage