Pour information, j'ai quand même tenté le coup et fait la manip.
Alors que le RAID0 avait été créé avec le chipset NVIDIA, je me suis dit que seule la MBR devait changer.
J'ai donc connecté les disques dans le même ordre que sur l'autre carte-mère, j'ai créé mon raid avec la même taille de clusters et effectivement les partitions étaient invisibles.
Après, j'ai utilisé Test Drive qui a détecté mes partitions sans aucun problème, j'ai écrit la MBR pour les sauvegarder et j'ai pu accéder à mes données sans aucun soucis.