Pour répondre à la question de la RAM : il faut la quantité demandée et par Linux (+ tout ce que tu fais tourner avec comme daemons et programmes), et ce que demande ton logiciel de calcul à l'utilisation (voire après quelques heures de calculs, bref en "vitesse de croisière" ).
Après, comme je ne connais pas du tout ce logiciel, je ne saurais pas te répondre, mais a priori (et donc à prendre avec des pincettes), 1Go ou 1.5Go devraient être suffisants.
Un logiciel de calcul n'a pas forcément besoin de beaucoup de mémoire, une fois les buffers remplis il lui faut que de la puissance brute.