Si tu achètes une CM avec PCI-E maintenant, pas de soucis, tu pourras garder ta config très longtemps...
De plus, le port PCI-E est en x16.
Cependant, avoir un port AGP x4 ou x8 ne causait qu'une différence minime des performances, et le PCI-E étant récent, tu ne risques pas de voir arriver un port x32 de sitôt.
Une 6600 GT fera tourner les jeux pendant un an, du moment que tu n'es pas trop exigeant... (elle va avoir un peu de mal pour les jeux en 2006, mais bon, même une 6800 Ultra aura du mal, alors...)
C'est quand même une excellent choix de carte graphique, et je te conseille vivement le PCI-E, car ta config sera 10 fois plus évolutive.