Salut, en fait si la carte fonctionne sur un autre ordi, tu auras du mal à la faire reprendre en SAV, car elle n'est probablement pas défectueuse.
Par contre, je suis tombé sur cet article :
http://www.hardware.fr/art/imprimer/65/
ou il est précisé que l'AGP y est en... x2. Ton problème vient très certainement de là, je crains... A moins que la révision de ta carte soit en x4, mais là j'y connais pas assez en MSI pour t'en dire plus.
Pour moi, la solution serait de trouver d'occaz (ou genre Asrock neuve) une carte mère socket A plus récente et compatible pour continuer d'exploiter ta config.