J'ai trouvé, si ça intéresse quelqu'un. C'est un vieux post mais je le remonte.
Avec photoshop, il existe un filtre pour exporter au format vtf, qui est le format texture de hl².
Le filtre est ici : http://nemesis.thewavelength.net/index.php?c=154 il y a un readme qui explique comment l'installer.
Il faut ensuite créer son image en lui rajoutant une couche alpha (c'est expliqué dans l'aide de photoshop), et enregistrer en format vtf en sélectionnant compressed texture with alpha dans les options. Il reste plus qu'à l'importer dans cs:source comme un tag normale.
Mais attention, il faut que la résolution du tag soit un multible de 32² (64, 128, 256).