L'histoire de cet épisode se situe dix ans avant le premier épisode, God of War (2005). Il racontera ainsi l'une des missions que Kratos a réalisé au nom des dieux de l'Olympe, avant de se rebeller contre son maître.

Chains of Olympus (Les Chaînes de l'Olympe) commence avec la défense de la ville d'Attique face à l'invasion de l'armée Perse. Kratos notre héro, doit faire face au Basilic, le monstre Perse le plus redoutable, qui dévaste la ville. Après la destruction de ce monstre, des puissances divines cachent le soleil, plongeant le monde dans la plus grande obscurité. Kratos, fait route vers la ville de Marathon afin de comprendre ce qui se passe....

Le premier arrêt de Kratos est le char d'Hélios. Celui-ci ne fonctionne plus, et Kratos devra le réactiver en réveillant les 3 chevaux de feu. Par là même occasion, Kratos s'équipera avec sa violence qui fait son charme du bouclier du soleil et de la lumière divine, armement d'Hélios, dieu du soleil. Après un bref tour par les sous sols de l'Olympe, et la prière de la sœur d'Hélios envers Kratos pour que celui ci sauve son frère, il accepte à contre cœur, déçu des dieux par de maintes fois. Une fois le char réactivé, Kratos laisse les destriers de feu le conduire à leur maitre. Mais les destriers passent par les carpates, et ils n'y survivent pas. Le char s'effondre, et Kratos n'a d'autre choix que de continuer à pied.

En suivant un cours chemin, Kratos se voit contrait d'appeler le passeur pour traverser la mer de sang et atteindre l'autre rive ou se situe son objectif, et la lumière d'Hélios qui jaillit. Le passeur n'est autre que Charon, et celui ci n'est pas prêt de laisser passer Kratos. Le combat tombe en la faveur de Charon, qui jette sans vergogne Kratos par dessus bord, dans le dédale.

Comme à l'accoutumée, Kratos va remonter par ses propres moyens, et découvre dans les abysses que les Titans, craint par les dieux, déchus, et condamné à l'oubli par les dieux, dont Zeus lui même, que Atlas n'est pas là ou il devrait être, et que quelqu'un l'a libéré. Il tombe aussi par hasard sur le Gant de Zeus, l'arme ultime par excellence, arme que Zeus aurait fait forgé et utilisé dans le seul but de déchoir les Titans et s'autoproclamer dieu de l'Olympe.

Une fois hors du gouffre, Kratos rappelle Caron, le passeur, et son bateau. Le combat recommence, en la faveur de Kratos et de son arme ultime : le gant de Zeus. Charon subit la colère sans pitié de Kratos qui en profite pour lui dérober une magie, la Colère de Charon.

Une fois sur l'autre rive, Kratos entame de début de la fin de sa quête. Il arrive sur le bord, et crois voir sa fille, qui chante une mélodie douce, avec un instrument rappelant un ocarina. Tel un illuminé, il se laisse conduire par cette mélodie, et grimpe en haut de la tour, où il fait connaissance de Persephone. Elle lui propose de retrouver sa fille, de ne plus être le fantôme de sparte, le condamné qu'il était et qu'il va rester des années durant, esclave des dieux, au service de sa vengeance, désincarné. Kratos cède, et accepte le deal : il rends tous ces pouvoir à l'arbre de la création, puisse passe le portail et se retrouve au Champs-Elysées, en compagnie de sa fille, heureux. Persphone lui dévoile son plan avant de le laisser profiter de sa fille : Elle a libéré Atlas pour que celui ci s'attaque au pilier du monde et faire s'écrouler autant le monde des humains que celui des dieux, et mettre fin à toute vie. Sa vengeance contre Zeus pour l'avoir condamné à être la femme de Hades. Kratos se retrouve devant un choix cornélien : laisser le monde disparaitre, lui et sa fille avec, ou perdre à jamais sa fille, une fois encore et sauver le monde, et sa fille au paradis, mais sans lui? Kratos n'as pas le choix, il va devoir combattre et le sacrifice sera une fois encore de mise pour lui, le prix ultime à payer. Kratos repousse sa fille malgré ses pleurs, et redeviens lentement le fantôme de sparte, massacrant les âmes des Champs-Elysées pour redevenir celui qu'il avait été, le guerrier parfait. Une fois redevenu celui qu'il était, Kratos entame la bataille.

Persphone s'offusque : de grandes ailes noires sortent de son dos, un casque et une armure romaine l'orne, puis s'envole vers les hauteurs du pilier de la création, Atlas grimpant inexorablement accomplir son œuvre destructrice. Le combat s'engage entre Kratos et Persephone, ponctué de frappes d'Atlas, que Kratos repousse, et il en profites pour maitriser Atlas avec les chaines restantes et pendouillantes de ses poignets. Kratos finit par vaincre Persephone, l'achevant des armes d'Hélios, puis s'entretient avec Atlas. Ce dernier est condamné, enchainer entre deux pans de la tour, condamné à porter le monde sur ses épaules, par Kratos lui même. Atlas lance une dernière menace à Kratos, en lui disant qu'il à fait une erreur qui lui coutera chère dans le futur. Puis Kratos s'en retourne sur le char d'Hélios diffuser la lumière et faire reculer l'obscurité.

Cependant, même Kratos ne peut tenir irrémédiablement face à des événements aussi tragiques. Il chute du Char, se laisse choir, et tombe du ciel, visiblement épuisé et moralement vaincu. Il chute inexorablement, puis au moment de toucher le sol, Kratos s'arrête à quelques centimètre du sol, et se pose doucement, sur le bord de la plus haute montagne de Grèce, celle là même ou Kratos tentera de s'y suicider, en vain. Athéna et un autre dieux font leur apparition, et profite que Kratos soit sonné pour le desarmé, et le laisser à nu, avec pour seules armes les Blades of Chaos. le discours s'enchaine entre les deux dieux

??? "tu crois qu'on devrait le laisser là, Athéna?" "il survivra"

La caméra dezoome...

Kratos est un brillant capitaine dans l'armée spartiate mais aussi une brute sanguinaire. Sa réputation en tant que commandeur et de conquérant monte vite et Kratos passe d'une armée d'une cinquantaine d'hommes à une armée d'un millier d'hommes. Mais alors qu'il enchaîne ses campagnes victorieuses, une armée de barbares de plusieurs milliers d'hommes venus de l'Est déferle sur l'armée menée par Kratos. L'ordre et la discipline de l'armée spartiate ne peut rien contre les assauts barbares et l'armée de Kratos se fait vite massacrer. Alors que le chef barbare est sur le point de mettre fin à la vie de Kratos, ce dernier implore Arès de le sauver.

Arès entendit l'appel de Kratos et extermina toute l'armée barbare. En signe de reconnaissance Kratos s'offrit à lui et devient ainsi son serviteur. Pour son nouvel élève, Arès équipe Kratos des Lames du chaos forgées dans les flammes des enfers.

Sous la bienveillance d'Arès, Kratos reprend ses campagnes d'une manière plus cruelle et sanguinaire qu'avant. Son humanité avait été remplacée par une soif de destructions et de conquêtes insufflée par son nouveau maître pour qu'il soit la mort en personne.

Puis vient cette nuit où la vie de Kratos bascula. Arès assigna à Kratos une mission : mettre à feu et à sang un village louant la déesse Athéna. Il se chargea lui-même de tuer toutes les personnes présentes dans le temple, et même l'oracle du village ne put l'empêcher de commettre l'irréparable. Car dans ce temple se trouvaient sa femme et sa fille, qu'il tua dans sa folie meurtrière. Ce massacre avait été planifié par Arès, pour que le spartiate n'ait plus d'attaches, et soit dévoué au dieu qu'il servait. C'est alors que Kratos réalise l'atrocité que son maître lui a fait faire, horrifié par ce qui s'est passé il compte faire payer Arès pour sa manipulation machiavélique et n'a alors plus qu'une idée en tête : tuer son maître. Et sur le parvis du temple embrasé, l'Oracle maudit le guerrier pour que les cendres de sa femme et de sa fille mortes de ses mains lui collent à la peau à jamais. Tout blanc, Kratos reçoit le surnom de fantôme de Sparte mais la plus grande punition était des cauchemars représentant ses crimes qui lui torturent l'esprit éternellement.

Depuis, Kratos ne rêve que de vengeance. Il a offert ses services aux dieux de l'Olympe, espérant le pardon pour ses actes.

Au début du jeu, Poséidon charge Kratos de tuer l'Hydre de Lerne qui ravage les navires de la flotte grecque sur la mer Egée. Après s'être acquitté de cette tâche, il appelle la déesse Athéna. Depuis dix ans qu'il est au service des dieux, il attend la récompense qu'il désire plus que tout : oublier les horreurs qu'il a commises par le passé. Mais avant, Athéna lui demande d'intervenir en sa faveur. Son frère Arès a attaqué sa ville, Athènes, avec l'aide de monstres tout droit sortis des Enfers. Zeus ayant interdit tout conflit entre dieux, elle ne peut intervenir directement. Athéna est formelle : seul un mortel entraîné par un dieu aura une chance de vaincre un autre dieu... Les Olympiens promettent à leur champion de lui pardonner les actes de barbarie commis par le passé en cas de succès. Mais les actes odieux qu'il a commis continueront de hanter l'esprit de Kratos, le rendant de plus en plus fou.

Arrivé à Athènes, Kratos se fraye un chemin entre les cyclopes, les morts-vivants et les gorgones, pour rencontrer en chemin le fossoyeur, qui creuse une tombe au beau milieu du champ de bataille. Il arrive finalement au Temple de la ville où l'Oracle lui révèle que le seul moyen de vaincre un dieu pour un mortel est d'entrer en possession de la boîte de Pandore, enfermée au fond du Temple de Pandore, que le Titan Cronos est condamné à porter sur son dos dans les tourbillons de sable du Désert des âmes perdues.

Kratos parvient à accéder au temple de Pandore, malgré le chant envoûtant des sirènes. Le garde, premier homme à avoir tenté de déjouer les pièges du Temple, sans succès, lui ouvre les portes. A l'intérieur, trois défis l'attendent, trois labyrinthes érigés et conçus en honneur d'Atlas, Poséidon et Hadès, par Pathos Verdes et ses deux fils. Kratos parvient à survivre aux épreuves, en tuant notamment le Minotaure, gardien du dernier tunnel.

Après avoir exploré la tombe et survécu aux pièges imaginés par l'architecte dans sa folie, Kratos trouve finalement la boîte de Pandore. Mais Arès le ressent, saisit un énorme débris des bâtiments athéniens, et le lance tel un javelot vers Kratos, qui se retrouve empalé et meurt. Kratos se retrouve aux Enfers, mais ne compte pas se résigner. Il s'accroche, et tente d'éviter de tomber dans le Styx, jusqu'à ce qu'une corde opportune lui permette de sortir... avant de se retrouver face au Fossoyeur, au coeur d'Athènes!

Kratos s'empresse de rejoindre Arès, de lui reprendre la boîte de Pandore et l'ouvrir, pour défier le dieu de la guerre. Arès utilise ses pouvoirs pour créer l'illusion d'une armée de Kratos démoniaques voulant tuer sa femme et sa fille, que le dieu prétend pouvoir ressusciter. Mais Kratos parvient encore à protéger ses adorées, et défaire le plan d'Arès. Dans sa rage, celui-ci lui reprend les Lames du chaos, et tous les pouvoirs que les dieux lui avaient offerts durant son périple. Cependant, Kratos trouve une épée, dernier cadeau des dieux, grâce à laquelle il parvient à tuer Arès, et sauver Athènes.

Plus tard, Kratos va demander à Athéna de tenir sa promesse. Et Athéna la tient : les dieux lui pardonnent ses fautes passées, mais ne le privent pas de ses souvenirs. Se sentant trahi et abandonné, il tente de se suicider en se jetant de la plus haute des falaises de Grèce. Mais une force le retient, et le ramène au sommet. Athéna lui transmet un message des dieux : ils ne le laisseront pas mourir de cette façon. De plus, le trône du dieu de la Guerre est vacant. Après s'être vu remettre les Lames d'Athéna, Kratos pénètre dans le Colisée de l'Olympe, et prend place sur le siège qui est désormais sien.

Kratos devient donc le premier mortel à devenir un dieu...

Après avoir vaincu Arès, Kratos est devenu le nouveau Dieu de la guerre. Haïssant les dieux, Kratos avait trouvé une nouvelle famille auprès des guerriers Spartiates. Ses derniers, soutenus par leur nouveau dieu, écrasaient de plus en plus de cités. Cependant à chaque nouvelle ville détruite, la colère des dieux grandissait. Le jeu commence lorsque Kratos s'apprête à porter le coup final à la cité de Rhodes. C'est alors que Zeus, craignant de subir le même destin qu'Arès, trompa Kratos et put ainsi lui retirer tout ses pouvoirs. L'histoire est bâtie sur la vengeance de Kratos contre Zeus. Mais pour arriver à ses fins, Kratos va devoir refaire le plein de pouvoir et d'armes ; ce qui le conduira à traverser nombre d'obstacles et rencontrer énormément de personnages de la mythologie grecque. Kratos va ainsi aller au bout du monde jusque dans l'antre du titan Typhon afin d'y obtenir l'arc de Typhon qui lui permettra de tuer ses ennemis à distance. Entre-temps Kratos aura aidé Prométhée en le brûlant, mettant ainsi fin au supplice infligé par Zeus. En récompense, Prométhée donnera à Kratos ses cendres, lui permettant ainsi d'obtenir le pouvoir La colère des Titans.

Kratos part ensuite pour l'île de la Création afin d'y trouver les sœurs du destin. Notre héros va partir vers les Coursiers du Temps, quatre chevaux géants de pierre et de métal, sur le dos desquels il combattra le héros Thésée et où il obtiendra la magie que lui donne le Titan Cronos. Il force ensuite les coursiers à faire avancer l'île de la Création afin de pouvoir s'y rendre.

Se rendant sur l'île, il affronte ensuite plusieurs autres personnages mythologiques parmi lesquels Euryale (une des sœurs de la gorgone Médusa), Cerbere (le chien gardien des enfers), le chef de l'armée barbare qu'Arès avait jadis décimé à la demande de Kratos ainsi que Persée (un puissant guerrier qui peut devenir invisible).

Plus tard, Kratos obtient l'aide du phœnix pour se rendre dans le temple des sœurs du destin, ses dernières refusent alors d'aider Kratos qui ne trouva qu'une seule solution : les assassiner l'une après l'autre. Détenant désormais le pouvoir de contrôler l'espace et le temps, Kratos se rend au moment où Zeus l'avait trahi. Il intervient et engage un combat épique où il ne pouvait que sortir vainqueur jusqu'à ce qu'Athéna se sacrifie pour sauver son père qui s'enfuit.

Plus en colère que jamais, Kratos apprend que Zeus est en réalité son père et prend la décision d'en finir avec lui. Il retourne donc dans le passé, au moment ou Zeus et les autres Olympiens entreprennent d'enfermer les titans au Tartare. Son plan, récupérer tous les titans afin de retourner dans le présent et ainsi décimer les dieux.

Le jeu se termine sur une scène qui montre Kratos sur le dos de Gaïa accompagnée des autres titans qui escaladent le mont Olympe avec l'intention de détruire les Dieux.

C'est le début de la fin