Idéalement, tu devrais passer par un script qui lit ton AD (ou annuaire LDAP) et le ré-enregistre dans le LDAP Samba.
Pour récupérer le contenu de ton annuaire et l'importer sur ton nouveau serveur 2000, voici un lien en anglais : http://searchwinit.techtarget.com/ [...] 19,00.html
Ce n'est franchement pas un problème de trouver de la doc à ce sujet, je te recommanderai même d'acheter un livre sur Active Directory, ce me semble plus que judicieux avant d'attaquer une telle migration.
Cdt.