je fais les 2, packaginig et repackaging.
Je connais un peu Win LE, il faut avouer que ce n'est pas des outils les plus complet et meme des plus simple.
Peut etre devrais tu faire un test avec un vrai outils de packaging. Je pense que le plus simple c'est installshield.
Mais si tu veux seulement faire des scripts d'installation automatiques, tu dois pouvoir t'en sortir sans créer des msi.