Une fois booté sur le CD, tu lances l'install. Là, il te laissera choisir la partition où installer Windows. Tu pourras formater, supprimer la partition, en recréer, etc. Tout se fait pendant l'install de Windows.
Mais il y a un truc qui m'échappe : tu dis vouloir installer par dessus Win98, mais tu parles de partition NTFS...y'a incohérence là