Une fois n'est pas coutume, je réponds à ma propre question:
Après avoir fait tourner un certain nombre de logiciels de récupérations, le seul ayant été capable de récupérer mon arborescence de fichier est GetDataBack for NTFS.
Photorec m’a ressortis tous mes fichiers en vrac en les nommant avec des numéros.
Recuva à été un peu plus loin en me ressortant le nom des fichiers, mais toujours en vrac...
Pour ceux ayant un problème similaire au mien, je vous recommande vivement GetDataBack. Attention cependant, la version téléchargeable sur leur site est en réalité une version non enregistrée qui ne permet pas la restauration. Cependant, elle permet d'ouvrir les fichiers pour accéder à leur contenu. A partir de là, quelques copier/coller suffiront à donner satisfaction.
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LAURENT Amaury, Etudiant Ingénieur - Instrumentation Automatique Informatique