si tu peux (veux) les rassembler, c'est pas dur en fait.
tu lances une recherche sur *.rar (sur ton dossier et sous-dossiers contenant les fichiers)
dans la fenêtre de recherche, tu sélectionnes tous les fichiers trouvés et tu déplaces tout le résultat de la recherche dans le dossier de ton choix.
et tu peux les décompresser avec la méthode indiquée plus haut.
par contre, si l'emplacement des dossiers est important pour toi (tri déjà fait par exemple), désolé, je n'ai rien d'autre à proposer :-/