FlashFXP le fait...enfin pas automatiquement, mais tu peux afficher 2 FTPs et transférer tous les fichiers de l'un à l'autre. Tu peux également le configurer pour qu'il écrase automatiquement les fichiers plus petits et qu'il passe au-dessus des fichiers identiques.
Moi je serais intéressé d'avoir un système du genre, mais avec gestion automatique de la syncronisation et pas par FTP, par l'explorateur windows par exemple... (pour du réseau local donc...)